Protein–RNA interactions for Protein: P05546

SERPIND1, Heparin cofactor 2, humanhuman

Predictions only

Length 499 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SERPIND1P05546 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
SERPIND1P05546 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC26.65■■□□□ 1.86
SERPIND1P05546 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC26.64■■□□□ 1.85
SERPIND1P05546 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
SERPIND1P05546 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
SERPIND1P05546 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
SERPIND1P05546 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
SERPIND1P05546 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.62■■□□□ 1.85
SERPIND1P05546 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
SERPIND1P05546 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
SERPIND1P05546 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC26.59■■□□□ 1.85
SERPIND1P05546 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC26.59■■□□□ 1.85
SERPIND1P05546 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
SERPIND1P05546 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
SERPIND1P05546 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC26.57■■□□□ 1.84
SERPIND1P05546 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
SERPIND1P05546 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC26.54■■□□□ 1.84
SERPIND1P05546 IFNGR2-201ENST00000290219 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
SERPIND1P05546 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC26.53■■□□□ 1.84
SERPIND1P05546 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC26.53■■□□□ 1.84
SERPIND1P05546 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
SERPIND1P05546 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
SERPIND1P05546 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
SERPIND1P05546 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
SERPIND1P05546 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC26.52■■□□□ 1.84
SERPIND1P05546 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC26.51■■□□□ 1.83
SERPIND1P05546 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC26.51■■□□□ 1.83
SERPIND1P05546 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
SERPIND1P05546 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC26.5■■□□□ 1.83
SERPIND1P05546 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
SERPIND1P05546 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
SERPIND1P05546 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC26.47■■□□□ 1.83
SERPIND1P05546 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC26.47■■□□□ 1.83
SERPIND1P05546 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
SERPIND1P05546 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
SERPIND1P05546 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC26.45■■□□□ 1.83
SERPIND1P05546 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.83
SERPIND1P05546 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC26.44■■□□□ 1.82
SERPIND1P05546 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
SERPIND1P05546 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
SERPIND1P05546 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC26.41■■□□□ 1.82
SERPIND1P05546 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC26.38■■□□□ 1.81
SERPIND1P05546 UBP1-201ENST00000283628 2074 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.36■■□□□ 1.81
SERPIND1P05546 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
SERPIND1P05546 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
SERPIND1P05546 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC26.34■■□□□ 1.81
SERPIND1P05546 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC26.33■■□□□ 1.81
SERPIND1P05546 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC26.33■■□□□ 1.81
SERPIND1P05546 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC26.31■■□□□ 1.8
SERPIND1P05546 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.3■■□□□ 1.8
SERPIND1P05546 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
SERPIND1P05546 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
SERPIND1P05546 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
SERPIND1P05546 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
SERPIND1P05546 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC26.28■■□□□ 1.8
SERPIND1P05546 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
SERPIND1P05546 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
SERPIND1P05546 POU3F1-201ENST00000373012 2184 ntAPPRIS P1 BASIC26.27■■□□□ 1.8
SERPIND1P05546 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC26.27■■□□□ 1.8
SERPIND1P05546 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
SERPIND1P05546 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
SERPIND1P05546 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC26.25■■□□□ 1.79
SERPIND1P05546 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
SERPIND1P05546 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
SERPIND1P05546 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
SERPIND1P05546 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
SERPIND1P05546 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
SERPIND1P05546 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC26.22■■□□□ 1.79
SERPIND1P05546 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
SERPIND1P05546 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
SERPIND1P05546 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
SERPIND1P05546 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC26.21■■□□□ 1.79
SERPIND1P05546 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
SERPIND1P05546 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC26.19■■□□□ 1.78
SERPIND1P05546 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
SERPIND1P05546 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
SERPIND1P05546 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
SERPIND1P05546 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC26.18■■□□□ 1.78
SERPIND1P05546 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC26.17■■□□□ 1.78
SERPIND1P05546 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
SERPIND1P05546 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
SERPIND1P05546 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
SERPIND1P05546 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
SERPIND1P05546 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
SERPIND1P05546 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
SERPIND1P05546 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
SERPIND1P05546 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
SERPIND1P05546 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC26.14■■□□□ 1.78
SERPIND1P05546 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.77
SERPIND1P05546 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
SERPIND1P05546 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
SERPIND1P05546 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC26.13■■□□□ 1.77
SERPIND1P05546 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC26.12■■□□□ 1.77
SERPIND1P05546 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
SERPIND1P05546 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
SERPIND1P05546 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
SERPIND1P05546 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
SERPIND1P05546 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
SERPIND1P05546 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
SERPIND1P05546 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 56.2 ms