Protein–RNA interactions for Protein: P05230

FGF1, Fibroblast growth factor 1, humanhuman

Predictions only

Length 155 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FGF1P05230 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC28.09■■■□□ 2.09
FGF1P05230 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
FGF1P05230 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
FGF1P05230 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC28.08■■■□□ 2.09
FGF1P05230 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC28.08■■■□□ 2.09
FGF1P05230 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC28.08■■■□□ 2.09
FGF1P05230 SDCCAG3-204ENST00000371725 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.06■■■□□ 2.08
FGF1P05230 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC28.04■■■□□ 2.08
FGF1P05230 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
FGF1P05230 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC28.03■■■□□ 2.08
FGF1P05230 IFNGR2-201ENST00000290219 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
FGF1P05230 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
FGF1P05230 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
FGF1P05230 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC28.01■■■□□ 2.07
FGF1P05230 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
FGF1P05230 UBP1-201ENST00000283628 2074 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.96■■■□□ 2.07
FGF1P05230 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
FGF1P05230 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC27.96■■■□□ 2.07
FGF1P05230 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
FGF1P05230 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
FGF1P05230 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
FGF1P05230 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC27.93■■■□□ 2.06
FGF1P05230 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC27.93■■■□□ 2.06
FGF1P05230 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC27.92■■■□□ 2.06
FGF1P05230 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
FGF1P05230 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
FGF1P05230 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC27.9■■■□□ 2.06
FGF1P05230 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC27.89■■■□□ 2.06
FGF1P05230 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC27.89■■■□□ 2.06
FGF1P05230 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC27.88■■■□□ 2.05
FGF1P05230 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC27.88■■■□□ 2.05
FGF1P05230 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
FGF1P05230 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC27.84■■■□□ 2.05
FGF1P05230 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
FGF1P05230 POU3F1-201ENST00000373012 2184 ntAPPRIS P1 BASIC27.82■■■□□ 2.04
FGF1P05230 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
FGF1P05230 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
FGF1P05230 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
FGF1P05230 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
FGF1P05230 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
FGF1P05230 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
FGF1P05230 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC27.77■■■□□ 2.04
FGF1P05230 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC27.75■■■□□ 2.03
FGF1P05230 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC27.74■■■□□ 2.03
FGF1P05230 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
FGF1P05230 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC27.74■■■□□ 2.03
FGF1P05230 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
FGF1P05230 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
FGF1P05230 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC27.73■■■□□ 2.03
FGF1P05230 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC27.73■■■□□ 2.03
FGF1P05230 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
FGF1P05230 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.72■■■□□ 2.03
FGF1P05230 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
FGF1P05230 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC27.72■■■□□ 2.03
FGF1P05230 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC27.72■■■□□ 2.03
FGF1P05230 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
FGF1P05230 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
FGF1P05230 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC27.71■■■□□ 2.03
FGF1P05230 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
FGF1P05230 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.71■■■□□ 2.03
FGF1P05230 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC27.7■■■□□ 2.02
FGF1P05230 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC27.7■■■□□ 2.02
FGF1P05230 TNK2-201ENST00000333602 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
FGF1P05230 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
FGF1P05230 ST7-208ENST00000393451 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
FGF1P05230 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
FGF1P05230 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC27.67■■■□□ 2.02
FGF1P05230 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
FGF1P05230 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
FGF1P05230 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.66■■■□□ 2.02
FGF1P05230 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
FGF1P05230 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
FGF1P05230 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC27.65■■■□□ 2.02
FGF1P05230 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
FGF1P05230 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
FGF1P05230 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC27.61■■■□□ 2.01
FGF1P05230 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.61■■■□□ 2.01
FGF1P05230 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC27.61■■■□□ 2.01
FGF1P05230 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
FGF1P05230 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
FGF1P05230 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
FGF1P05230 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2
FGF1P05230 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC27.57■■■□□ 2
FGF1P05230 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
FGF1P05230 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
FGF1P05230 TPRG1L-202ENST00000378344 2414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.54■■■□□ 2
FGF1P05230 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC27.54■■■□□ 2
FGF1P05230 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC27.52■■■□□ 2
FGF1P05230 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
FGF1P05230 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC27.52■■■□□ 2
FGF1P05230 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
FGF1P05230 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.5■■□□□ 1.99
FGF1P05230 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC27.5■■□□□ 1.99
FGF1P05230 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
FGF1P05230 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
FGF1P05230 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
FGF1P05230 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
FGF1P05230 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
FGF1P05230 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC27.46■■□□□ 1.99
FGF1P05230 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC27.45■■□□□ 1.98
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.9 ms