Protein–RNA interactions for Protein: P05014

IFNA4, Interferon alpha-4, humanhuman

Predictions only

Length 189 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IFNA4P05014 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
IFNA4P05014 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
IFNA4P05014 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
IFNA4P05014 AKR1E2-201ENST00000298375 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
IFNA4P05014 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
IFNA4P05014 PPP1R1A-201ENST00000257905 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
IFNA4P05014 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
IFNA4P05014 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
IFNA4P05014 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
IFNA4P05014 BRF1-213ENST00000548421 1452 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
IFNA4P05014 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
IFNA4P05014 CACNG8-202ENST00000638874 1278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
IFNA4P05014 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC22.57■■□□□ 1.2
IFNA4P05014 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
IFNA4P05014 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
IFNA4P05014 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
IFNA4P05014 ANXA5-201ENST00000296511 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
IFNA4P05014 DRD4-201ENST00000176183 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
IFNA4P05014 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
IFNA4P05014 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
IFNA4P05014 CDV3-203ENST00000431519 955 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
IFNA4P05014 FAM89B-203ENST00000530349 1263 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
IFNA4P05014 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
IFNA4P05014 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
IFNA4P05014 AC015813.7-201ENST00000623294 581 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
IFNA4P05014 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
IFNA4P05014 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
IFNA4P05014 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
IFNA4P05014 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
IFNA4P05014 CHCHD4-202ENST00000396914 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
IFNA4P05014 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
IFNA4P05014 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
IFNA4P05014 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
IFNA4P05014 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
IFNA4P05014 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
IFNA4P05014 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
IFNA4P05014 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
IFNA4P05014 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
IFNA4P05014 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
IFNA4P05014 RNF126-201ENST00000292363 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
IFNA4P05014 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
IFNA4P05014 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
IFNA4P05014 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
IFNA4P05014 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
IFNA4P05014 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
IFNA4P05014 CYP26C1-201ENST00000285949 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
IFNA4P05014 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
IFNA4P05014 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
IFNA4P05014 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
IFNA4P05014 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
IFNA4P05014 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
IFNA4P05014 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
IFNA4P05014 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
IFNA4P05014 ANKRD65-203ENST00000454272 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
IFNA4P05014 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
IFNA4P05014 PPP1CC-202ENST00000340766 1472 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
IFNA4P05014 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
IFNA4P05014 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
IFNA4P05014 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
IFNA4P05014 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
IFNA4P05014 ARRDC1-201ENST00000371421 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
IFNA4P05014 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC22.3■■□□□ 1.16
IFNA4P05014 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
IFNA4P05014 GNB5-202ENST00000358784 1735 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
IFNA4P05014 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
IFNA4P05014 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
IFNA4P05014 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
IFNA4P05014 PCYT2-205ENST00000570391 1857 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
IFNA4P05014 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
IFNA4P05014 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC22.24■■□□□ 1.15
IFNA4P05014 LTB4R2-204ENST00000533293 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
IFNA4P05014 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
IFNA4P05014 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
IFNA4P05014 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
IFNA4P05014 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
IFNA4P05014 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
IFNA4P05014 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
IFNA4P05014 SATB1-AS1-216ENST00000598149 1119 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
IFNA4P05014 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
IFNA4P05014 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
IFNA4P05014 CD151-202ENST00000397420 1648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
IFNA4P05014 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
IFNA4P05014 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
IFNA4P05014 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
IFNA4P05014 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC22.17■■□□□ 1.14
IFNA4P05014 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
IFNA4P05014 FAM89B-202ENST00000449319 1337 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
IFNA4P05014 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
IFNA4P05014 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
IFNA4P05014 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
IFNA4P05014 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
IFNA4P05014 LY6K-202ENST00000518841 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
IFNA4P05014 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
IFNA4P05014 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
IFNA4P05014 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
IFNA4P05014 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
IFNA4P05014 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
IFNA4P05014 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
IFNA4P05014 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
IFNA4P05014 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.4 ms