Protein–RNA interactions for Protein: P04141

CSF2, Granulocyte-macrophage colony-stimulating factor, humanhuman

Predictions only

Length 144 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSF2P04141 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
CSF2P04141 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
CSF2P04141 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.55■■■□□ 2
CSF2P04141 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
CSF2P04141 SFRP5-201ENST00000266066 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
CSF2P04141 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
CSF2P04141 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC27.52■■■□□ 2
CSF2P04141 ADRA2C-201ENST00000330055 2129 ntAPPRIS P1 BASIC27.52■■■□□ 2
CSF2P04141 INO80B-WBP1-202ENST00000452361 2040 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC27.51■■■□□ 2
CSF2P04141 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC27.51■■□□□ 1.99
CSF2P04141 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC27.51■■□□□ 1.99
CSF2P04141 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
CSF2P04141 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC27.5■■□□□ 1.99
CSF2P04141 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC27.49■■□□□ 1.99
CSF2P04141 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.49■■□□□ 1.99
CSF2P04141 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC27.48■■□□□ 1.99
CSF2P04141 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
CSF2P04141 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
CSF2P04141 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.48■■□□□ 1.99
CSF2P04141 AKR1E2-201ENST00000298375 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
CSF2P04141 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
CSF2P04141 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
CSF2P04141 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC27.42■■□□□ 1.98
CSF2P04141 ANXA5-201ENST00000296511 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
CSF2P04141 KIAA2013-203ENST00000616327 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.39■■□□□ 1.98
CSF2P04141 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC27.38■■□□□ 1.97
CSF2P04141 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
CSF2P04141 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC27.37■■□□□ 1.97
CSF2P04141 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
CSF2P04141 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC27.35■■□□□ 1.97
CSF2P04141 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
CSF2P04141 CSNK1E-205ENST00000405675 2127 ntTSL 5 BASIC27.34■■□□□ 1.97
CSF2P04141 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.33■■□□□ 1.97
CSF2P04141 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC27.32■■□□□ 1.96
CSF2P04141 GRASP-206ENST00000552049 1688 ntTSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
CSF2P04141 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.3■■□□□ 1.96
CSF2P04141 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.29■■□□□ 1.96
CSF2P04141 GPI-201ENST00000356487 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
CSF2P04141 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
CSF2P04141 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC27.26■■□□□ 1.95
CSF2P04141 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
CSF2P04141 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC27.24■■□□□ 1.95
CSF2P04141 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC27.24■■□□□ 1.95
CSF2P04141 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
CSF2P04141 SLC25A10-203ENST00000545862 1911 ntTSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
CSF2P04141 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
CSF2P04141 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC27.2■■□□□ 1.94
CSF2P04141 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.19■■□□□ 1.94
CSF2P04141 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC27.19■■□□□ 1.94
CSF2P04141 IFNGR2-201ENST00000290219 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
CSF2P04141 ADRA1D-201ENST00000379453 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
CSF2P04141 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC27.18■■□□□ 1.94
CSF2P04141 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC27.17■■□□□ 1.94
CSF2P04141 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
CSF2P04141 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC27.13■■□□□ 1.93
CSF2P04141 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
CSF2P04141 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
CSF2P04141 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
CSF2P04141 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
CSF2P04141 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC27.11■■□□□ 1.93
CSF2P04141 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC27.11■■□□□ 1.93
CSF2P04141 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
CSF2P04141 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
CSF2P04141 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC27.07■■□□□ 1.92
CSF2P04141 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
CSF2P04141 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC27.05■■□□□ 1.92
CSF2P04141 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC27.05■■□□□ 1.92
CSF2P04141 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC27.04■■□□□ 1.92
CSF2P04141 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
CSF2P04141 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
CSF2P04141 CTDNEP1-210ENST00000574322 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
CSF2P04141 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
CSF2P04141 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC27.02■■□□□ 1.92
CSF2P04141 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC27.02■■□□□ 1.92
CSF2P04141 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC27■■□□□ 1.91
CSF2P04141 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
CSF2P04141 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC27■■□□□ 1.91
CSF2P04141 KCNK1-202ENST00000366621 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
CSF2P04141 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC26.98■■□□□ 1.91
CSF2P04141 IL1R1-201ENST00000409288 1735 ntTSL 5 BASIC26.98■■□□□ 1.91
CSF2P04141 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
CSF2P04141 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
CSF2P04141 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
CSF2P04141 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
CSF2P04141 DPP6-204ENST00000406326 2012 ntTSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
CSF2P04141 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.94■■□□□ 1.9
CSF2P04141 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC26.94■■□□□ 1.9
CSF2P04141 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC26.94■■□□□ 1.9
CSF2P04141 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC26.92■■□□□ 1.9
CSF2P04141 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC26.9■■□□□ 1.9
CSF2P04141 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC26.9■■□□□ 1.9
CSF2P04141 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
CSF2P04141 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC26.89■■□□□ 1.9
CSF2P04141 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
CSF2P04141 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC26.88■■□□□ 1.89
CSF2P04141 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
CSF2P04141 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC26.86■■□□□ 1.89
CSF2P04141 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.86■■□□□ 1.89
CSF2P04141 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC26.86■■□□□ 1.89
CSF2P04141 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.6 ms