Protein–RNA interactions for Protein: P01732

CD8A, T-cell surface glycoprotein CD8 alpha chain, humanhuman

Predictions only

Length 235 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CD8AP01732 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
CD8AP01732 AGAP1-204ENST00000409457 2165 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
CD8AP01732 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
CD8AP01732 AC145285.7-201ENST00000614819 1539 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
CD8AP01732 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
CD8AP01732 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC24.31■■□□□ 1.48
CD8AP01732 PCYT2-205ENST00000570391 1857 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
CD8AP01732 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
CD8AP01732 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
CD8AP01732 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
CD8AP01732 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
CD8AP01732 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC24.29■■□□□ 1.48
CD8AP01732 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
CD8AP01732 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
CD8AP01732 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
CD8AP01732 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
CD8AP01732 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
CD8AP01732 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
CD8AP01732 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
CD8AP01732 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
CD8AP01732 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
CD8AP01732 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
CD8AP01732 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC24.23■■□□□ 1.47
CD8AP01732 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
CD8AP01732 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
CD8AP01732 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC24.21■■□□□ 1.47
CD8AP01732 PPP1R1A-201ENST00000257905 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CD8AP01732 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CD8AP01732 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
CD8AP01732 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
CD8AP01732 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
CD8AP01732 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
CD8AP01732 DPP6-204ENST00000406326 2012 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
CD8AP01732 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
CD8AP01732 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
CD8AP01732 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
CD8AP01732 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
CD8AP01732 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
CD8AP01732 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
CD8AP01732 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
CD8AP01732 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
CD8AP01732 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
CD8AP01732 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
CD8AP01732 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC24.07■■□□□ 1.44
CD8AP01732 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
CD8AP01732 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
CD8AP01732 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC24.06■■□□□ 1.44
CD8AP01732 LTB4R2-204ENST00000533293 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
CD8AP01732 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC24.04■■□□□ 1.44
CD8AP01732 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
CD8AP01732 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
CD8AP01732 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC24.03■■□□□ 1.44
CD8AP01732 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
CD8AP01732 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
CD8AP01732 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
CD8AP01732 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
CD8AP01732 CTDNEP1-210ENST00000574322 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
CD8AP01732 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
CD8AP01732 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
CD8AP01732 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
CD8AP01732 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
CD8AP01732 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
CD8AP01732 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC23.96■■□□□ 1.43
CD8AP01732 ARTN-202ENST00000372359 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
CD8AP01732 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
CD8AP01732 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
CD8AP01732 GNB5-202ENST00000358784 1735 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
CD8AP01732 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
CD8AP01732 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
CD8AP01732 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
CD8AP01732 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
CD8AP01732 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
CD8AP01732 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
CD8AP01732 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
CD8AP01732 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.9■■□□□ 1.42
CD8AP01732 B4GALT7-201ENST00000029410 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
CD8AP01732 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
CD8AP01732 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.42
CD8AP01732 CYP26C1-201ENST00000285949 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
CD8AP01732 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.88■■□□□ 1.41
CD8AP01732 ADRA2C-201ENST00000330055 2129 ntAPPRIS P1 BASIC23.88■■□□□ 1.41
CD8AP01732 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
CD8AP01732 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
CD8AP01732 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
CD8AP01732 SFRP5-201ENST00000266066 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
CD8AP01732 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
CD8AP01732 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
CD8AP01732 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
CD8AP01732 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
CD8AP01732 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
CD8AP01732 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
CD8AP01732 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.84■■□□□ 1.41
CD8AP01732 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
CD8AP01732 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
CD8AP01732 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
CD8AP01732 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC23.82■■□□□ 1.4
CD8AP01732 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
CD8AP01732 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
CD8AP01732 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC23.81■■□□□ 1.4
CD8AP01732 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.5 ms