Protein–RNA interactions for Protein: P00738

HP, Haptoglobin, humanhuman

Predictions only

Length 406 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HPP00738 KIAA2013-203ENST00000616327 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
HPP00738 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.04■■□□□ 1.76
HPP00738 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
HPP00738 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
HPP00738 AKR1E2-201ENST00000298375 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
HPP00738 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
HPP00738 GRASP-206ENST00000552049 1688 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
HPP00738 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
HPP00738 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC25.99■■□□□ 1.75
HPP00738 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
HPP00738 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
HPP00738 ANXA5-201ENST00000296511 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
HPP00738 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.96■■□□□ 1.75
HPP00738 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
HPP00738 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC25.94■■□□□ 1.74
HPP00738 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
HPP00738 CSNK1E-205ENST00000405675 2127 ntTSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
HPP00738 SLC25A10-203ENST00000545862 1911 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
HPP00738 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
HPP00738 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC25.93■■□□□ 1.74
HPP00738 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
HPP00738 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
HPP00738 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
HPP00738 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
HPP00738 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC25.87■■□□□ 1.73
HPP00738 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
HPP00738 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
HPP00738 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
HPP00738 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
HPP00738 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
HPP00738 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC25.82■■□□□ 1.72
HPP00738 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC25.82■■□□□ 1.72
HPP00738 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
HPP00738 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
HPP00738 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
HPP00738 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
HPP00738 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
HPP00738 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
HPP00738 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
HPP00738 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
HPP00738 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
HPP00738 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
HPP00738 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
HPP00738 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
HPP00738 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
HPP00738 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
HPP00738 CTDNEP1-210ENST00000574322 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
HPP00738 ADRA1D-201ENST00000379453 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
HPP00738 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC25.68■■□□□ 1.7
HPP00738 FEZF2-201ENST00000283268 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
HPP00738 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC25.64■■□□□ 1.7
HPP00738 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.7
HPP00738 IL1R1-201ENST00000409288 1735 ntTSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
HPP00738 DPP6-204ENST00000406326 2012 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
HPP00738 KCNK1-202ENST00000366621 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
HPP00738 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
HPP00738 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC25.6■■□□□ 1.69
HPP00738 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
HPP00738 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC25.59■■□□□ 1.69
HPP00738 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC25.59■■□□□ 1.69
HPP00738 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC25.59■■□□□ 1.69
HPP00738 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
HPP00738 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
HPP00738 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
HPP00738 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC25.54■■□□□ 1.68
HPP00738 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
HPP00738 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC25.52■■□□□ 1.68
HPP00738 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
HPP00738 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
HPP00738 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
HPP00738 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
HPP00738 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
HPP00738 NADK2-202ENST00000381937 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
HPP00738 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
HPP00738 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
HPP00738 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC25.48■■□□□ 1.67
HPP00738 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
HPP00738 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC25.47■■□□□ 1.67
HPP00738 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
HPP00738 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
HPP00738 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
HPP00738 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC25.45■■□□□ 1.66
HPP00738 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
HPP00738 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
HPP00738 SDCCAG3-202ENST00000357365 2304 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
HPP00738 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
HPP00738 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC25.43■■□□□ 1.66
HPP00738 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
HPP00738 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
HPP00738 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
HPP00738 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
HPP00738 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
HPP00738 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
HPP00738 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
HPP00738 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
HPP00738 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
HPP00738 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
HPP00738 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
HPP00738 SSBP3-204ENST00000371320 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
HPP00738 SAMD1-202ENST00000533683 2164 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17 ms