Protein–RNA interactions for Protein: P00374

DHFR, Dihydrofolate reductase, humanhuman

Predictions only

Length 187 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DHFRP00374 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
DHFRP00374 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
DHFRP00374 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
DHFRP00374 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
DHFRP00374 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
DHFRP00374 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
DHFRP00374 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
DHFRP00374 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
DHFRP00374 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
DHFRP00374 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
DHFRP00374 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
DHFRP00374 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
DHFRP00374 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
DHFRP00374 B4GALT7-201ENST00000029410 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
DHFRP00374 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
DHFRP00374 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
DHFRP00374 ARTN-202ENST00000372359 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
DHFRP00374 Z97634.1-201ENST00000412293 1715 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
DHFRP00374 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
DHFRP00374 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
DHFRP00374 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
DHFRP00374 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
DHFRP00374 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.42
DHFRP00374 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
DHFRP00374 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC23.89■■□□□ 1.42
DHFRP00374 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
DHFRP00374 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
DHFRP00374 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
DHFRP00374 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
DHFRP00374 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
DHFRP00374 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
DHFRP00374 NT5M-207ENST00000616989 1635 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
DHFRP00374 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
DHFRP00374 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
DHFRP00374 NT5M-201ENST00000389022 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
DHFRP00374 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC23.81■■□□□ 1.4
DHFRP00374 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
DHFRP00374 CSNK1E-206ENST00000413574 1631 ntTSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
DHFRP00374 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
DHFRP00374 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
DHFRP00374 RNF126-201ENST00000292363 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
DHFRP00374 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
DHFRP00374 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC23.77■■□□□ 1.4
DHFRP00374 NKAIN4-203ENST00000370316 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
DHFRP00374 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
DHFRP00374 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
DHFRP00374 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
DHFRP00374 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
DHFRP00374 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
DHFRP00374 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
DHFRP00374 ANXA5-201ENST00000296511 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
DHFRP00374 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
DHFRP00374 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
DHFRP00374 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
DHFRP00374 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
DHFRP00374 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
DHFRP00374 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
DHFRP00374 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
DHFRP00374 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
DHFRP00374 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
DHFRP00374 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
DHFRP00374 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
DHFRP00374 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
DHFRP00374 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
DHFRP00374 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
DHFRP00374 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
DHFRP00374 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
DHFRP00374 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
DHFRP00374 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
DHFRP00374 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
DHFRP00374 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
DHFRP00374 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
DHFRP00374 CMTM4-202ENST00000394106 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
DHFRP00374 CMTM4-204ENST00000563952 1023 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
DHFRP00374 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
DHFRP00374 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
DHFRP00374 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
DHFRP00374 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
DHFRP00374 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
DHFRP00374 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
DHFRP00374 PPP1R1A-201ENST00000257905 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
DHFRP00374 INO80B-201ENST00000233331 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
DHFRP00374 GALR3-201ENST00000249041 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
DHFRP00374 RAB43-207ENST00000476465 1627 ntTSL 3 BASIC23.51■■□□□ 1.35
DHFRP00374 RAN-202ENST00000392369 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
DHFRP00374 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
DHFRP00374 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
DHFRP00374 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
DHFRP00374 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
DHFRP00374 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
DHFRP00374 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
DHFRP00374 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
DHFRP00374 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
DHFRP00374 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
DHFRP00374 C11orf68-202ENST00000449692 1559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
DHFRP00374 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
DHFRP00374 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
DHFRP00374 AL357033.3-201ENST00000620143 614 ntTSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
DHFRP00374 BRF1-213ENST00000548421 1452 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
DHFRP00374 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 70 ms