Protein–RNA interactions for Protein: O95858

TSPAN15, Tetraspanin-15, humanhuman

Predictions only

Length 294 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TSPAN15O95858 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
TSPAN15O95858 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
TSPAN15O95858 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
TSPAN15O95858 CTDNEP1-210ENST00000574322 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
TSPAN15O95858 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
TSPAN15O95858 FEZF2-203ENST00000486811 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
TSPAN15O95858 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
TSPAN15O95858 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC22.91■■□□□ 1.26
TSPAN15O95858 AL136373.1-201ENST00000634804 1449 ntAPPRIS P1 BASIC22.91■■□□□ 1.26
TSPAN15O95858 LIMCH1-211ENST00000509638 1570 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
TSPAN15O95858 AGTRAP-204ENST00000376637 1067 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
TSPAN15O95858 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
TSPAN15O95858 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
TSPAN15O95858 RAN-202ENST00000392369 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
TSPAN15O95858 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
TSPAN15O95858 ADRA2C-201ENST00000330055 2129 ntAPPRIS P1 BASIC22.88■■□□□ 1.25
TSPAN15O95858 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
TSPAN15O95858 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
TSPAN15O95858 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
TSPAN15O95858 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
TSPAN15O95858 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
TSPAN15O95858 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
TSPAN15O95858 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
TSPAN15O95858 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
TSPAN15O95858 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
TSPAN15O95858 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
TSPAN15O95858 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
TSPAN15O95858 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
TSPAN15O95858 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
TSPAN15O95858 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
TSPAN15O95858 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
TSPAN15O95858 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
TSPAN15O95858 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC22.79■■□□□ 1.24
TSPAN15O95858 ECHS1-201ENST00000368547 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
TSPAN15O95858 AKR1E2-201ENST00000298375 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
TSPAN15O95858 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
TSPAN15O95858 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
TSPAN15O95858 AC145285.7-201ENST00000614819 1539 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
TSPAN15O95858 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
TSPAN15O95858 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
TSPAN15O95858 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
TSPAN15O95858 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
TSPAN15O95858 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
TSPAN15O95858 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
TSPAN15O95858 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
TSPAN15O95858 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
TSPAN15O95858 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
TSPAN15O95858 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
TSPAN15O95858 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
TSPAN15O95858 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
TSPAN15O95858 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
TSPAN15O95858 SFRP5-201ENST00000266066 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
TSPAN15O95858 PLPP2-203ENST00000434325 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
TSPAN15O95858 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
TSPAN15O95858 KCNK1-202ENST00000366621 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
TSPAN15O95858 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
TSPAN15O95858 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
TSPAN15O95858 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
TSPAN15O95858 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
TSPAN15O95858 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
TSPAN15O95858 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
TSPAN15O95858 ANKRD65-203ENST00000454272 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
TSPAN15O95858 IL1R1-201ENST00000409288 1735 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
TSPAN15O95858 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
TSPAN15O95858 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
TSPAN15O95858 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
TSPAN15O95858 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
TSPAN15O95858 SH3GL1-202ENST00000417295 1404 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
TSPAN15O95858 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
TSPAN15O95858 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
TSPAN15O95858 Z97634.1-201ENST00000412293 1715 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
TSPAN15O95858 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
TSPAN15O95858 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
TSPAN15O95858 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
TSPAN15O95858 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
TSPAN15O95858 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
TSPAN15O95858 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
TSPAN15O95858 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
TSPAN15O95858 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
TSPAN15O95858 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
TSPAN15O95858 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
TSPAN15O95858 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
TSPAN15O95858 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
TSPAN15O95858 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
TSPAN15O95858 DRD4-201ENST00000176183 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
TSPAN15O95858 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
TSPAN15O95858 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
TSPAN15O95858 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
TSPAN15O95858 COPS6-201ENST00000303904 1432 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
TSPAN15O95858 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
TSPAN15O95858 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
TSPAN15O95858 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
TSPAN15O95858 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
TSPAN15O95858 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
TSPAN15O95858 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
TSPAN15O95858 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
TSPAN15O95858 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
TSPAN15O95858 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
TSPAN15O95858 NT5M-201ENST00000389022 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
TSPAN15O95858 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 57.4 ms