Protein–RNA interactions for Protein: O95727

CRTAM, Cytotoxic and regulatory T-cell molecule, humanhuman

Predictions only

Length 393 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CRTAMO95727 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
CRTAMO95727 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC28.01■■■□□ 2.07
CRTAMO95727 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
CRTAMO95727 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
CRTAMO95727 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.99■■■□□ 2.07
CRTAMO95727 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
CRTAMO95727 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC27.99■■■□□ 2.07
CRTAMO95727 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
CRTAMO95727 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
CRTAMO95727 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
CRTAMO95727 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
CRTAMO95727 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC27.96■■■□□ 2.07
CRTAMO95727 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC27.96■■■□□ 2.07
CRTAMO95727 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC27.96■■■□□ 2.07
CRTAMO95727 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
CRTAMO95727 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
CRTAMO95727 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
CRTAMO95727 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
CRTAMO95727 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC27.91■■■□□ 2.06
CRTAMO95727 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC27.91■■■□□ 2.06
CRTAMO95727 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC27.87■■■□□ 2.05
CRTAMO95727 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
CRTAMO95727 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC27.84■■■□□ 2.05
CRTAMO95727 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
CRTAMO95727 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
CRTAMO95727 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.81■■■□□ 2.04
CRTAMO95727 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
CRTAMO95727 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC27.8■■■□□ 2.04
CRTAMO95727 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC27.8■■■□□ 2.04
CRTAMO95727 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC27.8■■■□□ 2.04
CRTAMO95727 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
CRTAMO95727 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC27.79■■■□□ 2.04
CRTAMO95727 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC27.79■■■□□ 2.04
CRTAMO95727 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
CRTAMO95727 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
CRTAMO95727 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC27.76■■■□□ 2.03
CRTAMO95727 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
CRTAMO95727 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC27.74■■■□□ 2.03
CRTAMO95727 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC27.73■■■□□ 2.03
CRTAMO95727 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
CRTAMO95727 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
CRTAMO95727 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
CRTAMO95727 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC27.69■■■□□ 2.02
CRTAMO95727 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC27.69■■■□□ 2.02
CRTAMO95727 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC27.69■■■□□ 2.02
CRTAMO95727 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
CRTAMO95727 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
CRTAMO95727 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
CRTAMO95727 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
CRTAMO95727 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
CRTAMO95727 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
CRTAMO95727 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
CRTAMO95727 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC27.65■■■□□ 2.02
CRTAMO95727 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
CRTAMO95727 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC27.64■■■□□ 2.01
CRTAMO95727 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC27.63■■■□□ 2.01
CRTAMO95727 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
CRTAMO95727 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC27.61■■■□□ 2.01
CRTAMO95727 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
CRTAMO95727 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC27.61■■■□□ 2.01
CRTAMO95727 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC27.6■■■□□ 2.01
CRTAMO95727 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.6■■■□□ 2.01
CRTAMO95727 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
CRTAMO95727 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC27.6■■■□□ 2.01
CRTAMO95727 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
CRTAMO95727 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
CRTAMO95727 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.59■■■□□ 2.01
CRTAMO95727 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
CRTAMO95727 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC27.59■■■□□ 2.01
CRTAMO95727 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC27.58■■■□□ 2.01
CRTAMO95727 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
CRTAMO95727 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
CRTAMO95727 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC27.57■■■□□ 2
CRTAMO95727 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC27.55■■■□□ 2
CRTAMO95727 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.54■■■□□ 2
CRTAMO95727 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC27.54■■■□□ 2
CRTAMO95727 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
CRTAMO95727 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
CRTAMO95727 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
CRTAMO95727 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
CRTAMO95727 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
CRTAMO95727 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
CRTAMO95727 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC27.49■■□□□ 1.99
CRTAMO95727 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC27.48■■□□□ 1.99
CRTAMO95727 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.46■■□□□ 1.99
CRTAMO95727 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
CRTAMO95727 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
CRTAMO95727 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC27.45■■□□□ 1.98
CRTAMO95727 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
CRTAMO95727 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
CRTAMO95727 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
CRTAMO95727 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC27.41■■□□□ 1.98
CRTAMO95727 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
CRTAMO95727 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
CRTAMO95727 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
CRTAMO95727 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
CRTAMO95727 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
CRTAMO95727 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
CRTAMO95727 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC27.37■■□□□ 1.97
CRTAMO95727 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC27.36■■□□□ 1.97
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.8 ms