Protein–RNA interactions for Protein: O95704

APBB3, Amyloid-beta A4 precursor protein-binding family B member 3, humanhuman

Predictions only

Length 486 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APBB3O95704 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC28.42■■■□□ 2.14
APBB3O95704 MAPK3-202ENST00000322266 1743 ntTSL 5 BASIC28.42■■■□□ 2.14
APBB3O95704 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC28.41■■■□□ 2.14
APBB3O95704 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC28.4■■■□□ 2.14
APBB3O95704 ACOT7-209ENST00000545482 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
APBB3O95704 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC28.37■■■□□ 2.13
APBB3O95704 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.37■■■□□ 2.13
APBB3O95704 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
APBB3O95704 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC28.35■■■□□ 2.13
APBB3O95704 PPP2CB-201ENST00000221138 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
APBB3O95704 PABPN1-201ENST00000216727 2001 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
APBB3O95704 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
APBB3O95704 LTB4R2-204ENST00000533293 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
APBB3O95704 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC28.32■■■□□ 2.12
APBB3O95704 TGIF1-202ENST00000343820 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
APBB3O95704 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.29■■■□□ 2.12
APBB3O95704 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC28.29■■■□□ 2.12
APBB3O95704 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
APBB3O95704 TPRG1L-201ENST00000344579 2189 ntTSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
APBB3O95704 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC28.27■■■□□ 2.12
APBB3O95704 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
APBB3O95704 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC28.26■■■□□ 2.12
APBB3O95704 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC28.25■■■□□ 2.11
APBB3O95704 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.25■■■□□ 2.11
APBB3O95704 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.24■■■□□ 2.11
APBB3O95704 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC28.24■■■□□ 2.11
APBB3O95704 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC28.22■■■□□ 2.11
APBB3O95704 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC28.22■■■□□ 2.11
APBB3O95704 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
APBB3O95704 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
APBB3O95704 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
APBB3O95704 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
APBB3O95704 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC28.19■■■□□ 2.1
APBB3O95704 CTDNEP1-208ENST00000573600 1724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.18■■■□□ 2.1
APBB3O95704 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC28.18■■■□□ 2.1
APBB3O95704 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC28.14■■■□□ 2.1
APBB3O95704 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.14■■■□□ 2.1
APBB3O95704 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
APBB3O95704 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC28.13■■■□□ 2.09
APBB3O95704 AGAP1-204ENST00000409457 2165 ntTSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
APBB3O95704 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.09■■■□□ 2.09
APBB3O95704 MAPK3-201ENST00000263025 1861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
APBB3O95704 GNB5-202ENST00000358784 1735 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
APBB3O95704 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
APBB3O95704 B4GALT2-203ENST00000372324 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
APBB3O95704 CYP26C1-201ENST00000285949 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
APBB3O95704 CRIP2-201ENST00000329146 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
APBB3O95704 INO80B-WBP1-202ENST00000452361 2040 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC28.03■■■□□ 2.08
APBB3O95704 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
APBB3O95704 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC28.03■■■□□ 2.08
APBB3O95704 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
APBB3O95704 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC28.02■■■□□ 2.08
APBB3O95704 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC28.02■■■□□ 2.08
APBB3O95704 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC28.02■■■□□ 2.08
APBB3O95704 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
APBB3O95704 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC28.01■■■□□ 2.07
APBB3O95704 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
APBB3O95704 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC28■■■□□ 2.07
APBB3O95704 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC28■■■□□ 2.07
APBB3O95704 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC28■■■□□ 2.07
APBB3O95704 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
APBB3O95704 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
APBB3O95704 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC27.98■■■□□ 2.07
APBB3O95704 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC27.98■■■□□ 2.07
APBB3O95704 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
APBB3O95704 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC27.97■■■□□ 2.07
APBB3O95704 ARTN-202ENST00000372359 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
APBB3O95704 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC27.96■■■□□ 2.07
APBB3O95704 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
APBB3O95704 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC27.95■■■□□ 2.06
APBB3O95704 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC27.95■■■□□ 2.06
APBB3O95704 AKR1E2-201ENST00000298375 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
APBB3O95704 B4GALT7-201ENST00000029410 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
APBB3O95704 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC27.92■■■□□ 2.06
APBB3O95704 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
APBB3O95704 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.9■■■□□ 2.06
APBB3O95704 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
APBB3O95704 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC27.87■■■□□ 2.05
APBB3O95704 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.87■■■□□ 2.05
APBB3O95704 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC27.86■■■□□ 2.05
APBB3O95704 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC27.85■■■□□ 2.05
APBB3O95704 SFRP5-201ENST00000266066 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
APBB3O95704 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC27.84■■■□□ 2.05
APBB3O95704 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
APBB3O95704 ADRA2C-201ENST00000330055 2129 ntAPPRIS P1 BASIC27.83■■■□□ 2.05
APBB3O95704 KHSRP-213ENST00000619396 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.82■■■□□ 2.04
APBB3O95704 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
APBB3O95704 KIAA2013-203ENST00000616327 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.8■■■□□ 2.04
APBB3O95704 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC27.8■■■□□ 2.04
APBB3O95704 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
APBB3O95704 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
APBB3O95704 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC27.77■■■□□ 2.04
APBB3O95704 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC27.76■■■□□ 2.03
APBB3O95704 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.76■■■□□ 2.03
APBB3O95704 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.75■■■□□ 2.03
APBB3O95704 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.75■■■□□ 2.03
APBB3O95704 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC27.75■■■□□ 2.03
APBB3O95704 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.75■■■□□ 2.03
APBB3O95704 GRASP-206ENST00000552049 1688 ntTSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
APBB3O95704 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC27.74■■■□□ 2.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.9 ms