Protein–RNA interactions for Protein: O95503

CBX6, Chromobox protein homolog 6, humanhuman

Predictions only

Length 412 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CBX6O95503 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC27.51■■□□□ 1.99
CBX6O95503 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC27.5■■□□□ 1.99
CBX6O95503 ANXA5-201ENST00000296511 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
CBX6O95503 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
CBX6O95503 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
CBX6O95503 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
CBX6O95503 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
CBX6O95503 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
CBX6O95503 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
CBX6O95503 CLEC3B-201ENST00000296130 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
CBX6O95503 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
CBX6O95503 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.44■■□□□ 1.98
CBX6O95503 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
CBX6O95503 RNF126-201ENST00000292363 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
CBX6O95503 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC27.41■■□□□ 1.98
CBX6O95503 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC27.39■■□□□ 1.98
CBX6O95503 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
CBX6O95503 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.38■■□□□ 1.97
CBX6O95503 H2AFV-202ENST00000308153 752 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
CBX6O95503 FAM58A-202ENST00000440428 1164 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.38■■□□□ 1.97
CBX6O95503 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
CBX6O95503 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
CBX6O95503 RAB43-207ENST00000476465 1627 ntTSL 3 BASIC27.32■■□□□ 1.96
CBX6O95503 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
CBX6O95503 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
CBX6O95503 AC079848.1-201ENST00000511301 327 ntTSL 3 BASIC27.31■■□□□ 1.96
CBX6O95503 FGF2-203ENST00000614010 867 ntTSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
CBX6O95503 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC27.27■■□□□ 1.96
CBX6O95503 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC27.26■■□□□ 1.96
CBX6O95503 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
CBX6O95503 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC27.24■■□□□ 1.95
CBX6O95503 LIMCH1-211ENST00000509638 1570 ntTSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
CBX6O95503 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
CBX6O95503 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
CBX6O95503 SYNGR1-202ENST00000318801 1361 ntTSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
CBX6O95503 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC27.23■■□□□ 1.95
CBX6O95503 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
CBX6O95503 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC27.23■■□□□ 1.95
CBX6O95503 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
CBX6O95503 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
CBX6O95503 PPP1R1A-201ENST00000257905 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
CBX6O95503 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
CBX6O95503 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
CBX6O95503 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC27.21■■□□□ 1.95
CBX6O95503 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
CBX6O95503 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.21■■□□□ 1.95
CBX6O95503 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
CBX6O95503 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.2■■□□□ 1.95
CBX6O95503 BRF1-213ENST00000548421 1452 ntTSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
CBX6O95503 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
CBX6O95503 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
CBX6O95503 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
CBX6O95503 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
CBX6O95503 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC27.17■■□□□ 1.94
CBX6O95503 AC005524.1-203ENST00000586528 451 ntTSL 3 BASIC27.17■■□□□ 1.94
CBX6O95503 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
CBX6O95503 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
CBX6O95503 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
CBX6O95503 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC27.15■■□□□ 1.94
CBX6O95503 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
CBX6O95503 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
CBX6O95503 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
CBX6O95503 FAM19A5-203ENST00000402357 1508 ntTSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
CBX6O95503 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
CBX6O95503 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
CBX6O95503 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
CBX6O95503 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
CBX6O95503 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC27.07■■□□□ 1.92
CBX6O95503 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.07■■□□□ 1.92
CBX6O95503 LINC01578-201ENST00000553829 732 ntTSL 2 BASIC27.07■■□□□ 1.92
CBX6O95503 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
CBX6O95503 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
CBX6O95503 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.06■■□□□ 1.92
CBX6O95503 AL136373.1-201ENST00000634804 1449 ntAPPRIS P1 BASIC27.05■■□□□ 1.92
CBX6O95503 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.03■■□□□ 1.92
CBX6O95503 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
CBX6O95503 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
CBX6O95503 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC27.02■■□□□ 1.92
CBX6O95503 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
CBX6O95503 CYP26C1-201ENST00000285949 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
CBX6O95503 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC27.02■■□□□ 1.92
CBX6O95503 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
CBX6O95503 NRGN-201ENST00000284292 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
CBX6O95503 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC27■■□□□ 1.91
CBX6O95503 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
CBX6O95503 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
CBX6O95503 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC26.98■■□□□ 1.91
CBX6O95503 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
CBX6O95503 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC26.97■■□□□ 1.91
CBX6O95503 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
CBX6O95503 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
CBX6O95503 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC26.96■■□□□ 1.91
CBX6O95503 HOXB3-208ENST00000476342 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
CBX6O95503 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
CBX6O95503 GNB5-202ENST00000358784 1735 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
CBX6O95503 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
CBX6O95503 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
CBX6O95503 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
CBX6O95503 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC26.89■■□□□ 1.9
CBX6O95503 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC26.89■■□□□ 1.9
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.9 ms