Protein–RNA interactions for Protein: O95471

CLDN7, Claudin-7, humanhuman

Predictions only

Length 211 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLDN7O95471 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
CLDN7O95471 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC27.88■■■□□ 2.05
CLDN7O95471 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
CLDN7O95471 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC27.87■■■□□ 2.05
CLDN7O95471 GPI-201ENST00000356487 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
CLDN7O95471 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC27.85■■■□□ 2.05
CLDN7O95471 SDCCAG3-204ENST00000371725 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.85■■■□□ 2.05
CLDN7O95471 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.83■■■□□ 2.05
CLDN7O95471 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
CLDN7O95471 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC27.82■■■□□ 2.04
CLDN7O95471 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
CLDN7O95471 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC27.82■■■□□ 2.04
CLDN7O95471 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
CLDN7O95471 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
CLDN7O95471 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC27.78■■■□□ 2.04
CLDN7O95471 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC27.78■■■□□ 2.04
CLDN7O95471 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC27.77■■■□□ 2.04
CLDN7O95471 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
CLDN7O95471 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC27.76■■■□□ 2.03
CLDN7O95471 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
CLDN7O95471 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC27.75■■■□□ 2.03
CLDN7O95471 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC27.75■■■□□ 2.03
CLDN7O95471 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC27.75■■■□□ 2.03
CLDN7O95471 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
CLDN7O95471 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
CLDN7O95471 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
CLDN7O95471 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
CLDN7O95471 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC27.7■■■□□ 2.03
CLDN7O95471 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
CLDN7O95471 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
CLDN7O95471 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
CLDN7O95471 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC27.69■■■□□ 2.02
CLDN7O95471 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
CLDN7O95471 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC27.66■■■□□ 2.02
CLDN7O95471 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC27.66■■■□□ 2.02
CLDN7O95471 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
CLDN7O95471 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC27.62■■■□□ 2.01
CLDN7O95471 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
CLDN7O95471 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
CLDN7O95471 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
CLDN7O95471 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
CLDN7O95471 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
CLDN7O95471 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
CLDN7O95471 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
CLDN7O95471 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC27.56■■■□□ 2
CLDN7O95471 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
CLDN7O95471 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
CLDN7O95471 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC27.55■■■□□ 2
CLDN7O95471 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
CLDN7O95471 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
CLDN7O95471 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
CLDN7O95471 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC27.52■■■□□ 2
CLDN7O95471 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC27.52■■■□□ 2
CLDN7O95471 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC27.52■■■□□ 2
CLDN7O95471 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.5■■□□□ 1.99
CLDN7O95471 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.49■■□□□ 1.99
CLDN7O95471 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC27.49■■□□□ 1.99
CLDN7O95471 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
CLDN7O95471 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC27.47■■□□□ 1.99
CLDN7O95471 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
CLDN7O95471 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
CLDN7O95471 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC27.46■■□□□ 1.99
CLDN7O95471 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC27.46■■□□□ 1.99
CLDN7O95471 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
CLDN7O95471 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
CLDN7O95471 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC27.44■■□□□ 1.98
CLDN7O95471 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC27.43■■□□□ 1.98
CLDN7O95471 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
CLDN7O95471 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC27.42■■□□□ 1.98
CLDN7O95471 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.42■■□□□ 1.98
CLDN7O95471 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
CLDN7O95471 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC27.39■■□□□ 1.98
CLDN7O95471 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
CLDN7O95471 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC27.39■■□□□ 1.98
CLDN7O95471 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC27.39■■□□□ 1.98
CLDN7O95471 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC27.38■■□□□ 1.97
CLDN7O95471 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
CLDN7O95471 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC27.36■■□□□ 1.97
CLDN7O95471 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC27.34■■□□□ 1.97
CLDN7O95471 UBP1-201ENST00000283628 2074 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.33■■□□□ 1.97
CLDN7O95471 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
CLDN7O95471 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
CLDN7O95471 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC27.33■■□□□ 1.97
CLDN7O95471 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.33■■□□□ 1.97
CLDN7O95471 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC27.33■■□□□ 1.97
CLDN7O95471 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
CLDN7O95471 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.32■■□□□ 1.96
CLDN7O95471 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
CLDN7O95471 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
CLDN7O95471 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
CLDN7O95471 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC27.3■■□□□ 1.96
CLDN7O95471 IFNGR2-201ENST00000290219 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
CLDN7O95471 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
CLDN7O95471 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
CLDN7O95471 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC27.28■■□□□ 1.96
CLDN7O95471 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
CLDN7O95471 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
CLDN7O95471 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
CLDN7O95471 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
CLDN7O95471 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 78.2 ms