Protein–RNA interactions for Protein: O95292

VAPB, Vesicle-associated membrane protein-associated protein B/C, humanhuman

Predictions only

Length 243 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VAPBO95292 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
VAPBO95292 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC27.93■■■□□ 2.06
VAPBO95292 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.93■■■□□ 2.06
VAPBO95292 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC27.93■■■□□ 2.06
VAPBO95292 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
VAPBO95292 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC27.92■■■□□ 2.06
VAPBO95292 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC27.92■■■□□ 2.06
VAPBO95292 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
VAPBO95292 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
VAPBO95292 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.9■■■□□ 2.06
VAPBO95292 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
VAPBO95292 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
VAPBO95292 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC27.87■■■□□ 2.05
VAPBO95292 CLEC3B-201ENST00000296130 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
VAPBO95292 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
VAPBO95292 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC27.86■■■□□ 2.05
VAPBO95292 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC27.86■■■□□ 2.05
VAPBO95292 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC27.86■■■□□ 2.05
VAPBO95292 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.85■■■□□ 2.05
VAPBO95292 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC27.85■■■□□ 2.05
VAPBO95292 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC27.84■■■□□ 2.05
VAPBO95292 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC27.84■■■□□ 2.05
VAPBO95292 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
VAPBO95292 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
VAPBO95292 AP002365.1-201ENST00000603448 772 ntBASIC27.82■■■□□ 2.04
VAPBO95292 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.81■■■□□ 2.04
VAPBO95292 FAM58A-202ENST00000440428 1164 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.8■■■□□ 2.04
VAPBO95292 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC27.79■■■□□ 2.04
VAPBO95292 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC27.79■■■□□ 2.04
VAPBO95292 H2AFV-202ENST00000308153 752 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
VAPBO95292 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.04
VAPBO95292 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
VAPBO95292 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
VAPBO95292 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
VAPBO95292 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC27.74■■■□□ 2.03
VAPBO95292 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
VAPBO95292 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC27.72■■■□□ 2.03
VAPBO95292 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC27.72■■■□□ 2.03
VAPBO95292 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
VAPBO95292 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
VAPBO95292 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC27.69■■■□□ 2.02
VAPBO95292 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
VAPBO95292 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
VAPBO95292 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
VAPBO95292 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC27.68■■■□□ 2.02
VAPBO95292 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC27.68■■■□□ 2.02
VAPBO95292 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
VAPBO95292 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC27.67■■■□□ 2.02
VAPBO95292 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC27.67■■■□□ 2.02
VAPBO95292 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
VAPBO95292 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
VAPBO95292 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC27.64■■■□□ 2.02
VAPBO95292 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
VAPBO95292 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
VAPBO95292 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
VAPBO95292 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
VAPBO95292 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC27.59■■■□□ 2.01
VAPBO95292 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC27.59■■■□□ 2.01
VAPBO95292 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
VAPBO95292 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
VAPBO95292 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
VAPBO95292 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC27.56■■■□□ 2
VAPBO95292 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC27.55■■■□□ 2
VAPBO95292 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC27.54■■■□□ 2
VAPBO95292 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
VAPBO95292 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
VAPBO95292 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC27.54■■■□□ 2
VAPBO95292 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.54■■■□□ 2
VAPBO95292 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
VAPBO95292 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC27.53■■■□□ 2
VAPBO95292 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
VAPBO95292 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC27.52■■■□□ 2
VAPBO95292 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
VAPBO95292 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
VAPBO95292 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
VAPBO95292 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
VAPBO95292 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.47■■□□□ 1.99
VAPBO95292 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
VAPBO95292 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
VAPBO95292 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
VAPBO95292 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
VAPBO95292 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
VAPBO95292 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
VAPBO95292 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
VAPBO95292 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
VAPBO95292 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC27.39■■□□□ 1.98
VAPBO95292 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
VAPBO95292 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC27.39■■□□□ 1.98
VAPBO95292 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC27.39■■□□□ 1.98
VAPBO95292 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC27.39■■□□□ 1.97
VAPBO95292 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
VAPBO95292 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
VAPBO95292 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC27.37■■□□□ 1.97
VAPBO95292 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
VAPBO95292 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC27.36■■□□□ 1.97
VAPBO95292 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
VAPBO95292 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC27.34■■□□□ 1.97
VAPBO95292 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
VAPBO95292 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
VAPBO95292 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 7.9 ms