Protein–RNA interactions for Protein: O95219

SNX4, Sorting nexin-4, humanhuman

Predictions only

Length 450 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNX4O95219 CHST12-204ENST00000618655 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
SNX4O95219 CYP26C1-201ENST00000285949 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
SNX4O95219 NADK2-202ENST00000381937 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
SNX4O95219 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
SNX4O95219 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
SNX4O95219 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
SNX4O95219 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
SNX4O95219 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
SNX4O95219 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
SNX4O95219 GNB5-202ENST00000358784 1735 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
SNX4O95219 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
SNX4O95219 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
SNX4O95219 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
SNX4O95219 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC25.72■■□□□ 1.71
SNX4O95219 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC25.71■■□□□ 1.71
SNX4O95219 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
SNX4O95219 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
SNX4O95219 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC25.69■■□□□ 1.7
SNX4O95219 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
SNX4O95219 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
SNX4O95219 ANXA5-201ENST00000296511 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
SNX4O95219 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
SNX4O95219 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
SNX4O95219 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
SNX4O95219 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC25.64■■□□□ 1.69
SNX4O95219 AKR1E2-201ENST00000298375 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
SNX4O95219 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
SNX4O95219 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
SNX4O95219 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
SNX4O95219 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
SNX4O95219 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
SNX4O95219 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC25.59■■□□□ 1.69
SNX4O95219 CTDNEP1-210ENST00000574322 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
SNX4O95219 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC25.58■■□□□ 1.69
SNX4O95219 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
SNX4O95219 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.55■■□□□ 1.68
SNX4O95219 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
SNX4O95219 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
SNX4O95219 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
SNX4O95219 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC25.51■■□□□ 1.67
SNX4O95219 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC25.51■■□□□ 1.67
SNX4O95219 DPP6-204ENST00000406326 2012 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
SNX4O95219 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
SNX4O95219 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC25.5■■□□□ 1.67
SNX4O95219 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
SNX4O95219 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
SNX4O95219 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC25.49■■□□□ 1.67
SNX4O95219 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
SNX4O95219 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
SNX4O95219 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
SNX4O95219 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
SNX4O95219 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
SNX4O95219 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
SNX4O95219 IL1R1-201ENST00000409288 1735 ntTSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
SNX4O95219 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
SNX4O95219 KCNK1-202ENST00000366621 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
SNX4O95219 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
SNX4O95219 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
SNX4O95219 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
SNX4O95219 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
SNX4O95219 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
SNX4O95219 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
SNX4O95219 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
SNX4O95219 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
SNX4O95219 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
SNX4O95219 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
SNX4O95219 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
SNX4O95219 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
SNX4O95219 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
SNX4O95219 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
SNX4O95219 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
SNX4O95219 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
SNX4O95219 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
SNX4O95219 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
SNX4O95219 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
SNX4O95219 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
SNX4O95219 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
SNX4O95219 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
SNX4O95219 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
SNX4O95219 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
SNX4O95219 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
SNX4O95219 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
SNX4O95219 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
SNX4O95219 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.29■■□□□ 1.64
SNX4O95219 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
SNX4O95219 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
SNX4O95219 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
SNX4O95219 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
SNX4O95219 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
SNX4O95219 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC25.24■■□□□ 1.63
SNX4O95219 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
SNX4O95219 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
SNX4O95219 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
SNX4O95219 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
SNX4O95219 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
SNX4O95219 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
SNX4O95219 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
SNX4O95219 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
SNX4O95219 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
SNX4O95219 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44 ms