Protein–RNA interactions for Protein: O95104

SCAF4, Splicing factor, arginine/serine-rich 15, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,147 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCAF4O95104 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
SCAF4O95104 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
SCAF4O95104 SATB1-AS1-216ENST00000598149 1119 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
SCAF4O95104 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
SCAF4O95104 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
SCAF4O95104 AL136373.1-201ENST00000634804 1449 ntAPPRIS P1 BASIC22.5■■□□□ 1.19
SCAF4O95104 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC22.5■■□□□ 1.19
SCAF4O95104 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
SCAF4O95104 ALYREF-202ENST00000505490 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SCAF4O95104 FAM19A5-203ENST00000402357 1508 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SCAF4O95104 AC008738.5-201ENST00000587312 482 ntTSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
SCAF4O95104 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
SCAF4O95104 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
SCAF4O95104 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
SCAF4O95104 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
SCAF4O95104 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
SCAF4O95104 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
SCAF4O95104 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SCAF4O95104 ANXA5-201ENST00000296511 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SCAF4O95104 HOXB3-208ENST00000476342 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SCAF4O95104 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SCAF4O95104 CYBA-201ENST00000261623 797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SCAF4O95104 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
SCAF4O95104 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SCAF4O95104 CYP26C1-201ENST00000285949 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SCAF4O95104 DRD4-201ENST00000176183 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SCAF4O95104 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SCAF4O95104 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SCAF4O95104 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SCAF4O95104 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SCAF4O95104 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
SCAF4O95104 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
SCAF4O95104 FAM89B-202ENST00000449319 1337 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SCAF4O95104 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SCAF4O95104 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SCAF4O95104 AC006077.2-201ENST00000623591 457 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
SCAF4O95104 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SCAF4O95104 PPP1CC-202ENST00000340766 1472 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
SCAF4O95104 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
SCAF4O95104 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SCAF4O95104 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SCAF4O95104 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
SCAF4O95104 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SCAF4O95104 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SCAF4O95104 LTB4R2-204ENST00000533293 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SCAF4O95104 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SCAF4O95104 ZNRF2P1-201ENST00000441407 443 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
SCAF4O95104 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
SCAF4O95104 ARRDC1-201ENST00000371421 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SCAF4O95104 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SCAF4O95104 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC22.2■■□□□ 1.14
SCAF4O95104 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SCAF4O95104 CHCHD4-202ENST00000396914 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SCAF4O95104 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SCAF4O95104 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
SCAF4O95104 GNB5-202ENST00000358784 1735 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SCAF4O95104 PRELID2-202ENST00000394450 1102 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SCAF4O95104 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SCAF4O95104 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
SCAF4O95104 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
SCAF4O95104 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
SCAF4O95104 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
SCAF4O95104 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SCAF4O95104 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SCAF4O95104 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
SCAF4O95104 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SCAF4O95104 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
SCAF4O95104 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SCAF4O95104 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
SCAF4O95104 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SCAF4O95104 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
SCAF4O95104 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
SCAF4O95104 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
SCAF4O95104 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
SCAF4O95104 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SCAF4O95104 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SCAF4O95104 CD151-202ENST00000397420 1648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SCAF4O95104 MAF-203ENST00000569649 1217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
SCAF4O95104 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SCAF4O95104 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SCAF4O95104 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SCAF4O95104 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SCAF4O95104 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SCAF4O95104 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SCAF4O95104 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SCAF4O95104 ANKRD65-203ENST00000454272 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SCAF4O95104 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SCAF4O95104 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SCAF4O95104 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SCAF4O95104 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
SCAF4O95104 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
SCAF4O95104 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
SCAF4O95104 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SCAF4O95104 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
SCAF4O95104 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
SCAF4O95104 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
SCAF4O95104 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SCAF4O95104 LY6K-202ENST00000518841 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
SCAF4O95104 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
SCAF4O95104 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.7 ms