Protein–RNA interactions for Protein: O94823

ATP10B, Probable phospholipid-transporting ATPase VB, humanhuman

Predictions only

Length 1,461 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP10BO94823 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.64■■■■■ 4.74
ATP10BO94823 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC44.63■■■■■ 4.73
ATP10BO94823 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC44.63■■■■■ 4.73
ATP10BO94823 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC44.62■■■■■ 4.73
ATP10BO94823 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC44.6■■■■■ 4.73
ATP10BO94823 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC44.59■■■■■ 4.73
ATP10BO94823 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC44.53■■■■■ 4.72
ATP10BO94823 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC44.53■■■■■ 4.72
ATP10BO94823 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC44.53■■■■■ 4.72
ATP10BO94823 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC44.5■■■■■ 4.71
ATP10BO94823 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC44.49■■■■■ 4.71
ATP10BO94823 LMO2-202ENST00000395833 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.48■■■■■ 4.71
ATP10BO94823 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC44.46■■■■■ 4.71
ATP10BO94823 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC44.43■■■■■ 4.7
ATP10BO94823 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC44.34■■■■■ 4.69
ATP10BO94823 PPP1R1A-201ENST00000257905 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.34■■■■■ 4.69
ATP10BO94823 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC44.34■■■■■ 4.69
ATP10BO94823 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC44.33■■■■■ 4.69
ATP10BO94823 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.32■■■■■ 4.69
ATP10BO94823 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC44.3■■■■■ 4.68
ATP10BO94823 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC44.25■■■■■ 4.67
ATP10BO94823 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC44.24■■■■■ 4.67
ATP10BO94823 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC44.23■■■■■ 4.67
ATP10BO94823 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC44.23■■■■■ 4.67
ATP10BO94823 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC44.23■■■■■ 4.67
ATP10BO94823 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC44.22■■■■■ 4.67
ATP10BO94823 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC44.21■■■■■ 4.67
ATP10BO94823 LTB4R2-204ENST00000533293 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.21■■■■■ 4.67
ATP10BO94823 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC44.19■■■■■ 4.66
ATP10BO94823 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC44.18■■■■■ 4.66
ATP10BO94823 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC44.18■■■■■ 4.66
ATP10BO94823 TPRG1L-201ENST00000344579 2189 ntTSL 1 (best) BASIC44.18■■■■■ 4.66
ATP10BO94823 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC44.17■■■■■ 4.66
ATP10BO94823 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC44.15■■■■■ 4.66
ATP10BO94823 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC44.14■■■■■ 4.66
ATP10BO94823 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC44.13■■■■■ 4.65
ATP10BO94823 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.12■■■■■ 4.65
ATP10BO94823 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC44.09■■■■■ 4.65
ATP10BO94823 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.09■■■■■ 4.65
ATP10BO94823 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.08■■■■■ 4.65
ATP10BO94823 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC44.06■■■■■ 4.64
ATP10BO94823 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC44.04■■■■■ 4.64
ATP10BO94823 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC44.04■■■■■ 4.64
ATP10BO94823 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC44.04■■■■■ 4.64
ATP10BO94823 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC44.03■■■■■ 4.64
ATP10BO94823 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC43.97■■■■■ 4.63
ATP10BO94823 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC43.96■■■■■ 4.63
ATP10BO94823 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC43.94■■■■■ 4.62
ATP10BO94823 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC43.92■■■■■ 4.62
ATP10BO94823 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC43.92■■■■■ 4.62
ATP10BO94823 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC43.91■■■■■ 4.62
ATP10BO94823 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC43.91■■■■■ 4.62
ATP10BO94823 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC43.9■■■■■ 4.62
ATP10BO94823 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.87■■■■■ 4.61
ATP10BO94823 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC43.85■■■■■ 4.61
ATP10BO94823 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC43.85■■■■■ 4.61
ATP10BO94823 GNB5-202ENST00000358784 1735 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC43.83■■■■■ 4.61
ATP10BO94823 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC43.81■■■■■ 4.6
ATP10BO94823 CRIP2-201ENST00000329146 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.8■■■■■ 4.6
ATP10BO94823 PPP2CB-201ENST00000221138 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.8■■■■■ 4.6
ATP10BO94823 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC43.79■■■■■ 4.6
ATP10BO94823 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC43.79■■■■■ 4.6
ATP10BO94823 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC43.79■■■■■ 4.6
ATP10BO94823 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC43.76■■■■■ 4.6
ATP10BO94823 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.76■■■■■ 4.6
ATP10BO94823 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC43.76■■■■■ 4.6
ATP10BO94823 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC43.76■■■■■ 4.6
ATP10BO94823 MAPK3-202ENST00000322266 1743 ntTSL 5 BASIC43.75■■■■■ 4.59
ATP10BO94823 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC43.72■■■■■ 4.59
ATP10BO94823 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC43.72■■■■■ 4.59
ATP10BO94823 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC43.71■■■■■ 4.59
ATP10BO94823 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC43.71■■■■■ 4.59
ATP10BO94823 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC43.71■■■■■ 4.59
ATP10BO94823 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC43.7■■■■■ 4.59
ATP10BO94823 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.7■■■■■ 4.59
ATP10BO94823 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC43.69■■■■■ 4.58
ATP10BO94823 CYP26C1-201ENST00000285949 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.69■■■■■ 4.58
ATP10BO94823 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.66■■■■■ 4.58
ATP10BO94823 ARTN-202ENST00000372359 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC43.66■■■■■ 4.58
ATP10BO94823 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC43.64■■■■■ 4.58
ATP10BO94823 AKR1E2-201ENST00000298375 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.64■■■■■ 4.58
ATP10BO94823 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.62■■■■■ 4.57
ATP10BO94823 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC43.61■■■■■ 4.57
ATP10BO94823 AGAP1-204ENST00000409457 2165 ntTSL 1 (best) BASIC43.58■■■■■ 4.57
ATP10BO94823 B4GALT7-201ENST00000029410 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.57■■■■■ 4.57
ATP10BO94823 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC43.57■■■■■ 4.56
ATP10BO94823 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC43.55■■■■■ 4.56
ATP10BO94823 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC43.54■■■■■ 4.56
ATP10BO94823 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC43.54■■■■■ 4.56
ATP10BO94823 CTDNEP1-208ENST00000573600 1724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC43.54■■■■■ 4.56
ATP10BO94823 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.52■■■■■ 4.56
ATP10BO94823 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC43.52■■■■■ 4.56
ATP10BO94823 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC43.51■■■■■ 4.56
ATP10BO94823 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC43.51■■■■■ 4.56
ATP10BO94823 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC43.49■■■■■ 4.55
ATP10BO94823 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC43.47■■■■■ 4.55
ATP10BO94823 SFRP5-201ENST00000266066 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.46■■■■■ 4.55
ATP10BO94823 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC43.45■■■■■ 4.55
ATP10BO94823 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC43.45■■■■■ 4.55
ATP10BO94823 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC43.45■■■■■ 4.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.6 ms