Protein–RNA interactions for Protein: O88870

Best1, Bestrophin-1, mousemouse

Predictions only

Length 551 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Best1O88870 Dapk3-209ENSMUST00000219850 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Best1O88870 Tcfl5-201ENSMUST00000037877 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Best1O88870 Vstm2l-201ENSMUST00000109523 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
Best1O88870 Chrna5-202ENSMUST00000213960 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Best1O88870 Gm42517-201ENSMUST00000197216 1850 ntAPPRIS P1 BASIC25.76■■□□□ 1.71
Best1O88870 Gm26566-201ENSMUST00000181601 1038 ntAPPRIS P1 BASIC25.74■■□□□ 1.71
Best1O88870 Wsb2-201ENSMUST00000031309 2421 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Best1O88870 Mocs3-201ENSMUST00000099071 1973 ntAPPRIS P1 BASIC25.73■■□□□ 1.71
Best1O88870 Orai1-202ENSMUST00000121652 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
Best1O88870 Coq10a-207ENSMUST00000220227 1434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
Best1O88870 Crlf1-201ENSMUST00000008032 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Best1O88870 Abhd17a-201ENSMUST00000003436 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Best1O88870 Gm16148-201ENSMUST00000119653 893 ntBASIC25.66■■□□□ 1.7
Best1O88870 Syt7-201ENSMUST00000073899 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Best1O88870 Stk24-201ENSMUST00000079817 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Best1O88870 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Best1O88870 Gm42984-201ENSMUST00000195990 987 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Best1O88870 Srsf9-201ENSMUST00000031513 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Best1O88870 Gm26588-201ENSMUST00000181064 2098 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Best1O88870 Raly-203ENSMUST00000109701 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Best1O88870 Kcnmb4os2-201ENSMUST00000080943 1571 ntTSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
Best1O88870 Zfp131-205ENSMUST00000223812 663 ntBASIC25.58■■□□□ 1.69
Best1O88870 Frs3-201ENSMUST00000113296 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Best1O88870 E2f4-201ENSMUST00000015003 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Best1O88870 Tnfsf12-202ENSMUST00000181810 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Best1O88870 Sh3glb2-203ENSMUST00000113620 1694 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Best1O88870 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Best1O88870 Rbfox2-201ENSMUST00000048145 1720 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Best1O88870 Dhrs13-203ENSMUST00000122342 1791 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Best1O88870 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.68
Best1O88870 1700028N14Rik-201ENSMUST00000139621 747 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Best1O88870 Pwwp2a-202ENSMUST00000094294 1814 ntTSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
Best1O88870 Mapkapk5-201ENSMUST00000031410 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Best1O88870 2210008F06Rik-201ENSMUST00000180805 1082 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Best1O88870 Ctbp1-206ENSMUST00000201575 2091 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Best1O88870 Pard6a-205ENSMUST00000212430 1261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Best1O88870 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
Best1O88870 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
Best1O88870 Fndc10-201ENSMUST00000099265 2140 ntAPPRIS P1 BASIC25.42■■□□□ 1.66
Best1O88870 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC25.39■■□□□ 1.66
Best1O88870 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
Best1O88870 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.38■■□□□ 1.65
Best1O88870 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Best1O88870 Ubl4a-207ENSMUST00000178691 1038 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
Best1O88870 1700069B07Rik-202ENSMUST00000191155 939 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
Best1O88870 Msantd2-201ENSMUST00000048604 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Best1O88870 Ppp2r2d-201ENSMUST00000041097 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Best1O88870 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Best1O88870 Mon2-207ENSMUST00000219203 1844 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Best1O88870 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
Best1O88870 Gltp-203ENSMUST00000112214 944 ntTSL 3 BASIC25.3■■□□□ 1.64
Best1O88870 Eif2ak3-204ENSMUST00000162950 927 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Best1O88870 Gkap1-201ENSMUST00000091579 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Best1O88870 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Best1O88870 C330011M18Rik-201ENSMUST00000071067 1849 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Best1O88870 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC25.29■■□□□ 1.64
Best1O88870 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Best1O88870 Dlx4-201ENSMUST00000021241 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Best1O88870 Vsig8-202ENSMUST00000177086 1519 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Best1O88870 Orai1-201ENSMUST00000051016 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Best1O88870 Tmem59-201ENSMUST00000030361 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Best1O88870 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Best1O88870 Gm10762-201ENSMUST00000099385 1133 ntAPPRIS P1 BASIC25.24■■□□□ 1.63
Best1O88870 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Best1O88870 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
Best1O88870 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Best1O88870 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Best1O88870 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Best1O88870 Tmco6-201ENSMUST00000007046 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Best1O88870 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Best1O88870 1700016A09Rik-201ENSMUST00000192004 835 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
Best1O88870 Lmo2-201ENSMUST00000111139 1434 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
Best1O88870 Sept11-208ENSMUST00000202308 1792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
Best1O88870 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Best1O88870 Gm2415-204ENSMUST00000190235 2004 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
Best1O88870 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Best1O88870 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Best1O88870 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
Best1O88870 Ildr2-207ENSMUST00000195557 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
Best1O88870 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
Best1O88870 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Best1O88870 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Best1O88870 Hnrnpd-202ENSMUST00000072750 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.12■■□□□ 1.61
Best1O88870 Dennd1b-209ENSMUST00000200533 1853 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Best1O88870 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
Best1O88870 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
Best1O88870 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Best1O88870 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Best1O88870 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC25■■□□□ 1.59
Best1O88870 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
Best1O88870 Gm6658-202ENSMUST00000209493 1885 ntBASIC25■■□□□ 1.59
Best1O88870 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC24.98■■□□□ 1.59
Best1O88870 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Best1O88870 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC24.97■■□□□ 1.59
Best1O88870 Rundc3a-201ENSMUST00000006750 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Best1O88870 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Best1O88870 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
Best1O88870 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
Best1O88870 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Best1O88870 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32 ms