Protein–RNA interactions for Protein: O76031

CLPX, ATP-dependent Clp protease ATP-binding subunit clpX-like, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 633 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLPXO76031 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
CLPXO76031 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
CLPXO76031 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
CLPXO76031 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
CLPXO76031 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC25.2■■□□□ 1.62
CLPXO76031 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
CLPXO76031 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
CLPXO76031 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
CLPXO76031 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
CLPXO76031 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
CLPXO76031 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC25.12■■□□□ 1.61
CLPXO76031 UBE2M-201ENST00000253023 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
CLPXO76031 GALR3-201ENST00000249041 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
CLPXO76031 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
CLPXO76031 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
CLPXO76031 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
CLPXO76031 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
CLPXO76031 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
CLPXO76031 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
CLPXO76031 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
CLPXO76031 ARTN-202ENST00000372359 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
CLPXO76031 CSNK1E-206ENST00000413574 1631 ntTSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
CLPXO76031 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
CLPXO76031 B4GALT7-201ENST00000029410 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
CLPXO76031 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
CLPXO76031 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
CLPXO76031 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
CLPXO76031 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
CLPXO76031 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
CLPXO76031 ALYREF-202ENST00000505490 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
CLPXO76031 CMTM4-202ENST00000394106 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
CLPXO76031 CMTM4-204ENST00000563952 1023 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
CLPXO76031 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
CLPXO76031 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
CLPXO76031 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
CLPXO76031 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
CLPXO76031 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
CLPXO76031 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
CLPXO76031 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
CLPXO76031 INO80B-201ENST00000233331 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
CLPXO76031 RNF126-201ENST00000292363 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
CLPXO76031 NT5M-207ENST00000616989 1635 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
CLPXO76031 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
CLPXO76031 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
CLPXO76031 Z97634.1-201ENST00000412293 1715 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
CLPXO76031 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
CLPXO76031 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
CLPXO76031 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
CLPXO76031 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
CLPXO76031 NT5M-201ENST00000389022 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
CLPXO76031 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC24.85■■□□□ 1.57
CLPXO76031 NKAIN4-203ENST00000370316 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
CLPXO76031 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
CLPXO76031 AL357033.3-201ENST00000620143 614 ntTSL 3 BASIC24.83■■□□□ 1.57
CLPXO76031 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
CLPXO76031 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
CLPXO76031 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
CLPXO76031 ANXA5-201ENST00000296511 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
CLPXO76031 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
CLPXO76031 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
CLPXO76031 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
CLPXO76031 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
CLPXO76031 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
CLPXO76031 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
CLPXO76031 FAM89B-203ENST00000530349 1263 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
CLPXO76031 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
CLPXO76031 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
CLPXO76031 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
CLPXO76031 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
CLPXO76031 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC24.73■■□□□ 1.55
CLPXO76031 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
CLPXO76031 C11orf68-202ENST00000449692 1559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
CLPXO76031 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
CLPXO76031 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
CLPXO76031 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
CLPXO76031 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
CLPXO76031 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
CLPXO76031 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
CLPXO76031 INO80B-203ENST00000409917 796 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
CLPXO76031 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
CLPXO76031 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
CLPXO76031 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
CLPXO76031 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
CLPXO76031 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
CLPXO76031 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
CLPXO76031 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
CLPXO76031 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
CLPXO76031 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
CLPXO76031 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
CLPXO76031 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
CLPXO76031 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
CLPXO76031 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
CLPXO76031 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
CLPXO76031 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
CLPXO76031 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
CLPXO76031 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
CLPXO76031 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
CLPXO76031 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
CLPXO76031 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
CLPXO76031 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 10.2 ms