Protein–RNA interactions for Protein: O75712

GJB3, Gap junction beta-3 protein, humanhuman

Predictions only

Length 270 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GJB3O75712 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
GJB3O75712 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC28.5■■■□□ 2.15
GJB3O75712 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
GJB3O75712 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC28.49■■■□□ 2.15
GJB3O75712 AKR1E2-201ENST00000298375 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
GJB3O75712 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
GJB3O75712 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC28.48■■■□□ 2.15
GJB3O75712 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
GJB3O75712 GPI-201ENST00000356487 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
GJB3O75712 FEZF2-201ENST00000283268 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
GJB3O75712 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC28.44■■■□□ 2.14
GJB3O75712 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC28.44■■■□□ 2.14
GJB3O75712 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
GJB3O75712 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
GJB3O75712 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC28.42■■■□□ 2.14
GJB3O75712 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC28.4■■■□□ 2.14
GJB3O75712 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.39■■■□□ 2.14
GJB3O75712 SDCCAG3-204ENST00000371725 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.39■■■□□ 2.14
GJB3O75712 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.38■■■□□ 2.13
GJB3O75712 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
GJB3O75712 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
GJB3O75712 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC28.34■■■□□ 2.13
GJB3O75712 SERINC2-201ENST00000373709 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
GJB3O75712 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
GJB3O75712 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC28.32■■■□□ 2.12
GJB3O75712 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
GJB3O75712 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC28.3■■■□□ 2.12
GJB3O75712 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
GJB3O75712 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.28■■■□□ 2.12
GJB3O75712 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC28.28■■■□□ 2.12
GJB3O75712 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC28.27■■■□□ 2.12
GJB3O75712 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC28.27■■■□□ 2.12
GJB3O75712 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC28.27■■■□□ 2.12
GJB3O75712 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC28.25■■■□□ 2.11
GJB3O75712 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
GJB3O75712 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC28.25■■■□□ 2.11
GJB3O75712 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
GJB3O75712 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC28.24■■■□□ 2.11
GJB3O75712 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC28.24■■■□□ 2.11
GJB3O75712 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
GJB3O75712 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
GJB3O75712 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
GJB3O75712 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
GJB3O75712 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
GJB3O75712 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
GJB3O75712 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC28.18■■■□□ 2.1
GJB3O75712 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC28.17■■■□□ 2.1
GJB3O75712 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC28.16■■■□□ 2.1
GJB3O75712 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
GJB3O75712 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC28.16■■■□□ 2.1
GJB3O75712 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC28.16■■■□□ 2.1
GJB3O75712 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
GJB3O75712 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC28.14■■■□□ 2.1
GJB3O75712 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
GJB3O75712 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.14■■■□□ 2.1
GJB3O75712 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
GJB3O75712 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC28.13■■■□□ 2.09
GJB3O75712 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
GJB3O75712 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
GJB3O75712 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
GJB3O75712 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.08
GJB3O75712 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
GJB3O75712 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
GJB3O75712 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC28.07■■■□□ 2.08
GJB3O75712 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC28.06■■■□□ 2.08
GJB3O75712 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
GJB3O75712 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
GJB3O75712 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
GJB3O75712 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC28.03■■■□□ 2.08
GJB3O75712 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
GJB3O75712 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.08
GJB3O75712 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC27.99■■■□□ 2.07
GJB3O75712 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
GJB3O75712 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.96■■■□□ 2.07
GJB3O75712 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.95■■■□□ 2.06
GJB3O75712 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC27.94■■■□□ 2.06
GJB3O75712 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC27.93■■■□□ 2.06
GJB3O75712 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
GJB3O75712 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC27.93■■■□□ 2.06
GJB3O75712 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
GJB3O75712 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
GJB3O75712 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
GJB3O75712 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
GJB3O75712 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
GJB3O75712 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC27.89■■■□□ 2.06
GJB3O75712 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
GJB3O75712 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC27.88■■■□□ 2.05
GJB3O75712 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC27.87■■■□□ 2.05
GJB3O75712 IFNGR2-201ENST00000290219 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
GJB3O75712 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC27.86■■■□□ 2.05
GJB3O75712 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
GJB3O75712 UBP1-201ENST00000283628 2074 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.85■■■□□ 2.05
GJB3O75712 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
GJB3O75712 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
GJB3O75712 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC27.84■■■□□ 2.05
GJB3O75712 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
GJB3O75712 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
GJB3O75712 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC27.83■■■□□ 2.05
GJB3O75712 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC27.82■■■□□ 2.04
GJB3O75712 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC27.82■■■□□ 2.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.2 ms