Protein–RNA interactions for Protein: O75503

CLN5, Ceroid-lipofuscinosis neuronal protein 5, humanhuman

Predictions only

Length 358 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLN5O75503 B4GALT7-201ENST00000029410 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CLN5O75503 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CLN5O75503 PPP1R1A-201ENST00000257905 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CLN5O75503 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CLN5O75503 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CLN5O75503 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CLN5O75503 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
CLN5O75503 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
CLN5O75503 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CLN5O75503 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CLN5O75503 ANKRD65-203ENST00000454272 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CLN5O75503 FAM89B-202ENST00000449319 1337 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CLN5O75503 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CLN5O75503 KCNK1-202ENST00000366621 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CLN5O75503 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CLN5O75503 IL1R1-201ENST00000409288 1735 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CLN5O75503 AKR1E2-201ENST00000298375 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CLN5O75503 AC008738.5-201ENST00000587312 482 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CLN5O75503 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CLN5O75503 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CLN5O75503 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CLN5O75503 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CLN5O75503 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CLN5O75503 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CLN5O75503 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CLN5O75503 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CLN5O75503 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
CLN5O75503 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
CLN5O75503 ANXA5-201ENST00000296511 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CLN5O75503 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CLN5O75503 PPP1CC-202ENST00000340766 1472 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CLN5O75503 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CLN5O75503 ARRDC1-201ENST00000371421 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CLN5O75503 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CLN5O75503 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CLN5O75503 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CLN5O75503 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CLN5O75503 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
CLN5O75503 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CLN5O75503 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CLN5O75503 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CLN5O75503 CYP26C1-201ENST00000285949 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CLN5O75503 CD151-202ENST00000397420 1648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CLN5O75503 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CLN5O75503 RNF126-201ENST00000292363 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CLN5O75503 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
CLN5O75503 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CLN5O75503 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CLN5O75503 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CLN5O75503 LY6K-202ENST00000518841 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CLN5O75503 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CLN5O75503 AGTRAP-204ENST00000376637 1067 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
CLN5O75503 AC006077.2-201ENST00000623591 457 ntBASIC22■■□□□ 1.11
CLN5O75503 PCYT2-205ENST00000570391 1857 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
CLN5O75503 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC22■■□□□ 1.11
CLN5O75503 LTB4R2-204ENST00000533293 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CLN5O75503 GNB5-202ENST00000358784 1735 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CLN5O75503 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CLN5O75503 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CLN5O75503 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
CLN5O75503 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CLN5O75503 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CLN5O75503 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CLN5O75503 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
CLN5O75503 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CLN5O75503 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CLN5O75503 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
CLN5O75503 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
CLN5O75503 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
CLN5O75503 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
CLN5O75503 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
CLN5O75503 CYBA-201ENST00000261623 797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
CLN5O75503 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
CLN5O75503 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
CLN5O75503 SYNGR1-202ENST00000318801 1361 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
CLN5O75503 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
CLN5O75503 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CLN5O75503 ALYREF-202ENST00000505490 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CLN5O75503 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC21.87■■□□□ 1.09
CLN5O75503 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CLN5O75503 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
CLN5O75503 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
CLN5O75503 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
CLN5O75503 HAGHL-204ENST00000549114 1820 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
CLN5O75503 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC21.85■■□□□ 1.09
CLN5O75503 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CLN5O75503 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
CLN5O75503 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
CLN5O75503 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
CLN5O75503 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
CLN5O75503 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
CLN5O75503 PRELID2-202ENST00000394450 1102 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
CLN5O75503 ZNRF2P1-201ENST00000441407 443 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
CLN5O75503 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
CLN5O75503 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
CLN5O75503 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
CLN5O75503 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
CLN5O75503 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
CLN5O75503 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
CLN5O75503 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.3 ms