Protein–RNA interactions for Protein: O75487

GPC4, Glypican-4, humanhuman

Predictions only

Length 556 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GPC4O75487 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
GPC4O75487 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC27.6■■■□□ 2.01
GPC4O75487 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.6■■■□□ 2.01
GPC4O75487 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.6■■■□□ 2.01
GPC4O75487 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
GPC4O75487 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
GPC4O75487 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC27.57■■■□□ 2
GPC4O75487 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
GPC4O75487 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.55■■■□□ 2
GPC4O75487 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
GPC4O75487 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
GPC4O75487 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
GPC4O75487 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
GPC4O75487 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
GPC4O75487 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
GPC4O75487 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC27.51■■□□□ 1.99
GPC4O75487 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
GPC4O75487 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
GPC4O75487 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
GPC4O75487 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.49■■□□□ 1.99
GPC4O75487 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.47■■□□□ 1.99
GPC4O75487 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC27.47■■□□□ 1.99
GPC4O75487 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
GPC4O75487 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
GPC4O75487 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
GPC4O75487 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.4■■□□□ 1.98
GPC4O75487 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC27.4■■□□□ 1.98
GPC4O75487 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
GPC4O75487 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC27.38■■□□□ 1.97
GPC4O75487 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC27.38■■□□□ 1.97
GPC4O75487 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
GPC4O75487 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
GPC4O75487 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC27.34■■□□□ 1.97
GPC4O75487 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
GPC4O75487 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
GPC4O75487 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC27.32■■□□□ 1.96
GPC4O75487 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC27.31■■□□□ 1.96
GPC4O75487 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC27.31■■□□□ 1.96
GPC4O75487 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
GPC4O75487 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC27.3■■□□□ 1.96
GPC4O75487 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC27.3■■□□□ 1.96
GPC4O75487 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC27.3■■□□□ 1.96
GPC4O75487 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
GPC4O75487 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC27.29■■□□□ 1.96
GPC4O75487 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.29■■□□□ 1.96
GPC4O75487 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
GPC4O75487 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.27■■□□□ 1.96
GPC4O75487 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
GPC4O75487 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.96
GPC4O75487 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
GPC4O75487 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
GPC4O75487 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC27.26■■□□□ 1.95
GPC4O75487 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC27.26■■□□□ 1.95
GPC4O75487 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
GPC4O75487 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
GPC4O75487 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
GPC4O75487 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
GPC4O75487 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC27.24■■□□□ 1.95
GPC4O75487 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
GPC4O75487 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
GPC4O75487 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC27.22■■□□□ 1.95
GPC4O75487 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
GPC4O75487 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
GPC4O75487 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
GPC4O75487 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
GPC4O75487 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
GPC4O75487 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
GPC4O75487 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.2■■□□□ 1.94
GPC4O75487 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
GPC4O75487 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
GPC4O75487 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC27.19■■□□□ 1.94
GPC4O75487 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
GPC4O75487 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC27.19■■□□□ 1.94
GPC4O75487 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC27.18■■□□□ 1.94
GPC4O75487 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC27.17■■□□□ 1.94
GPC4O75487 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
GPC4O75487 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC27.17■■□□□ 1.94
GPC4O75487 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC27.15■■□□□ 1.94
GPC4O75487 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
GPC4O75487 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC27.11■■□□□ 1.93
GPC4O75487 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
GPC4O75487 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
GPC4O75487 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC27.09■■□□□ 1.93
GPC4O75487 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.08■■□□□ 1.93
GPC4O75487 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC27.07■■□□□ 1.92
GPC4O75487 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC27.07■■□□□ 1.92
GPC4O75487 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC27.07■■□□□ 1.92
GPC4O75487 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
GPC4O75487 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
GPC4O75487 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
GPC4O75487 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
GPC4O75487 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
GPC4O75487 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC27.02■■□□□ 1.92
GPC4O75487 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
GPC4O75487 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
GPC4O75487 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
GPC4O75487 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC27■■□□□ 1.91
GPC4O75487 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC27■■□□□ 1.91
GPC4O75487 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC27■■□□□ 1.91
GPC4O75487 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.3 ms