Protein–RNA interactions for Protein: O75175

CNOT3, CCR4-NOT transcription complex subunit 3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 753 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNOT3O75175 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC26.61■■□□□ 1.85
CNOT3O75175 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC26.6■■□□□ 1.85
CNOT3O75175 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC26.59■■□□□ 1.85
CNOT3O75175 LTB4R2-204ENST00000533293 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
CNOT3O75175 ARTN-202ENST00000372359 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
CNOT3O75175 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC26.57■■□□□ 1.84
CNOT3O75175 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
CNOT3O75175 ADRA2C-201ENST00000330055 2129 ntAPPRIS P1 BASIC26.56■■□□□ 1.84
CNOT3O75175 SFRP5-201ENST00000266066 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
CNOT3O75175 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC26.54■■□□□ 1.84
CNOT3O75175 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC26.54■■□□□ 1.84
CNOT3O75175 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
CNOT3O75175 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC26.51■■□□□ 1.83
CNOT3O75175 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC26.51■■□□□ 1.83
CNOT3O75175 B4GALT7-201ENST00000029410 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
CNOT3O75175 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC26.5■■□□□ 1.83
CNOT3O75175 GNB5-202ENST00000358784 1735 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
CNOT3O75175 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
CNOT3O75175 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC26.48■■□□□ 1.83
CNOT3O75175 SH3GLB2-201ENST00000372554 1985 ntTSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
CNOT3O75175 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
CNOT3O75175 SAMD1-202ENST00000533683 2164 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
CNOT3O75175 CYP26C1-201ENST00000285949 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
CNOT3O75175 ANXA5-201ENST00000296511 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
CNOT3O75175 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
CNOT3O75175 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
CNOT3O75175 SDCCAG3-202ENST00000357365 2304 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
CNOT3O75175 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
CNOT3O75175 STK25-202ENST00000401869 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
CNOT3O75175 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
CNOT3O75175 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
CNOT3O75175 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC26.38■■□□□ 1.81
CNOT3O75175 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC26.38■■□□□ 1.81
CNOT3O75175 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
CNOT3O75175 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC26.37■■□□□ 1.81
CNOT3O75175 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC26.37■■□□□ 1.81
CNOT3O75175 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC26.37■■□□□ 1.81
CNOT3O75175 CHST12-204ENST00000618655 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
CNOT3O75175 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
CNOT3O75175 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
CNOT3O75175 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
CNOT3O75175 NADK2-202ENST00000381937 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.36■■□□□ 1.81
CNOT3O75175 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC26.35■■□□□ 1.81
CNOT3O75175 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.34■■□□□ 1.81
CNOT3O75175 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
CNOT3O75175 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
CNOT3O75175 AKR1E2-201ENST00000298375 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.8
CNOT3O75175 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC26.32■■□□□ 1.8
CNOT3O75175 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC26.32■■□□□ 1.8
CNOT3O75175 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC26.32■■□□□ 1.8
CNOT3O75175 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC26.31■■□□□ 1.8
CNOT3O75175 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC26.31■■□□□ 1.8
CNOT3O75175 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
CNOT3O75175 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
CNOT3O75175 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
CNOT3O75175 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
CNOT3O75175 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC26.22■■□□□ 1.79
CNOT3O75175 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC26.22■■□□□ 1.79
CNOT3O75175 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC26.22■■□□□ 1.79
CNOT3O75175 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC26.21■■□□□ 1.79
CNOT3O75175 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
CNOT3O75175 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
CNOT3O75175 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
CNOT3O75175 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
CNOT3O75175 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
CNOT3O75175 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
CNOT3O75175 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC26.18■■□□□ 1.78
CNOT3O75175 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
CNOT3O75175 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC26.18■■□□□ 1.78
CNOT3O75175 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC26.17■■□□□ 1.78
CNOT3O75175 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC26.16■■□□□ 1.78
CNOT3O75175 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
CNOT3O75175 DPP6-204ENST00000406326 2012 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
CNOT3O75175 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.77
CNOT3O75175 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.13■■□□□ 1.77
CNOT3O75175 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
CNOT3O75175 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
CNOT3O75175 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
CNOT3O75175 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
CNOT3O75175 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
CNOT3O75175 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
CNOT3O75175 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC26.1■■□□□ 1.77
CNOT3O75175 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
CNOT3O75175 KCNK1-202ENST00000366621 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
CNOT3O75175 CTDNEP1-210ENST00000574322 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
CNOT3O75175 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
CNOT3O75175 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
CNOT3O75175 IL1R1-201ENST00000409288 1735 ntTSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
CNOT3O75175 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
CNOT3O75175 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
CNOT3O75175 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
CNOT3O75175 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
CNOT3O75175 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
CNOT3O75175 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC26■■□□□ 1.75
CNOT3O75175 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
CNOT3O75175 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
CNOT3O75175 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
CNOT3O75175 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
CNOT3O75175 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
CNOT3O75175 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.1 ms