Protein–RNA interactions for Protein: O70492

Snx3, Sorting nexin-3, mousemouse

Predictions only

Length 162 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snx3O70492 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC25.79■■□□□ 1.72
Snx3O70492 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Snx3O70492 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Snx3O70492 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Snx3O70492 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Snx3O70492 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Snx3O70492 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Snx3O70492 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Snx3O70492 Vps37d-201ENSMUST00000067935 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Snx3O70492 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Snx3O70492 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Snx3O70492 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Snx3O70492 Agpat2-201ENSMUST00000028286 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Snx3O70492 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC25.65■■□□□ 1.7
Snx3O70492 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
Snx3O70492 Casp9-202ENSMUST00000097805 1498 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
Snx3O70492 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.69
Snx3O70492 Fcho2-203ENSMUST00000109403 1523 ntTSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
Snx3O70492 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Snx3O70492 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Snx3O70492 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Snx3O70492 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
Snx3O70492 Tmed7-201ENSMUST00000036030 1436 ntTSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
Snx3O70492 Bzw1-202ENSMUST00000186949 1492 ntTSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
Snx3O70492 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
Snx3O70492 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Snx3O70492 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
Snx3O70492 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Snx3O70492 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Snx3O70492 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Snx3O70492 Fkbp8-204ENSMUST00000119698 1799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Snx3O70492 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Snx3O70492 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Snx3O70492 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Snx3O70492 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC25.5■■□□□ 1.67
Snx3O70492 Cacng8-201ENSMUST00000092351 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Snx3O70492 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Snx3O70492 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Snx3O70492 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Snx3O70492 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Snx3O70492 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Snx3O70492 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Snx3O70492 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
Snx3O70492 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Snx3O70492 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
Snx3O70492 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Snx3O70492 Agap3-206ENSMUST00000212381 1191 ntTSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
Snx3O70492 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC25.39■■□□□ 1.65
Snx3O70492 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
Snx3O70492 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
Snx3O70492 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Snx3O70492 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
Snx3O70492 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Snx3O70492 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
Snx3O70492 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Snx3O70492 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Snx3O70492 Bod1-201ENSMUST00000058060 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Snx3O70492 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Snx3O70492 Ube2q2-202ENSMUST00000121677 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
Snx3O70492 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Snx3O70492 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Snx3O70492 Adgrb2-207ENSMUST00000120204 5170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Snx3O70492 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
Snx3O70492 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
Snx3O70492 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Snx3O70492 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
Snx3O70492 Slc25a28-201ENSMUST00000046038 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Snx3O70492 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Snx3O70492 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
Snx3O70492 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
Snx3O70492 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Snx3O70492 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Snx3O70492 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Snx3O70492 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Snx3O70492 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Snx3O70492 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Snx3O70492 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
Snx3O70492 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Snx3O70492 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Snx3O70492 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Snx3O70492 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
Snx3O70492 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Snx3O70492 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
Snx3O70492 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Snx3O70492 Zxdb-201ENSMUST00000101388 5619 ntAPPRIS P1 BASIC25.08■■□□□ 1.61
Snx3O70492 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Snx3O70492 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Snx3O70492 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Snx3O70492 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Snx3O70492 Shf-201ENSMUST00000048635 1431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Snx3O70492 Rexo2-201ENSMUST00000034524 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Snx3O70492 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Snx3O70492 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Snx3O70492 Rnf149-204ENSMUST00000195705 389 ntTSL 3 BASIC25■■□□□ 1.59
Snx3O70492 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Snx3O70492 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC24.99■■□□□ 1.59
Snx3O70492 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
Snx3O70492 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Snx3O70492 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Snx3O70492 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 110.8 ms