Protein–RNA interactions for Protein: O70435

Psma3, Proteasome subunit alpha type-3, mousemouse

Predictions only

Length 255 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Psma3O70435 Mon2-207ENSMUST00000219203 1844 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
Psma3O70435 Rnf130-202ENSMUST00000102776 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
Psma3O70435 Tcf15-201ENSMUST00000089112 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
Psma3O70435 Cenpv-201ENSMUST00000018653 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
Psma3O70435 Rnf130-201ENSMUST00000054684 1415 ntTSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
Psma3O70435 Tmem59-201ENSMUST00000030361 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
Psma3O70435 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.63■■□□□ 1.85
Psma3O70435 Popdc3-202ENSMUST00000161803 1369 ntTSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
Psma3O70435 Dapk3-209ENSMUST00000219850 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
Psma3O70435 Ccm2-201ENSMUST00000000388 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
Psma3O70435 Ildr2-207ENSMUST00000195557 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
Psma3O70435 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
Psma3O70435 Adgrb2-207ENSMUST00000120204 5170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
Psma3O70435 Gm6658-202ENSMUST00000209493 1885 ntBASIC26.56■■□□□ 1.84
Psma3O70435 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
Psma3O70435 Hspd1-201ENSMUST00000027123 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
Psma3O70435 Il17d-201ENSMUST00000089494 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
Psma3O70435 Sap30l-201ENSMUST00000020826 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
Psma3O70435 Abhd17a-201ENSMUST00000003436 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
Psma3O70435 Tmed7-203ENSMUST00000151189 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
Psma3O70435 Rab22a-202ENSMUST00000109110 849 ntTSL 5 BASIC26.5■■□□□ 1.83
Psma3O70435 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
Psma3O70435 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
Psma3O70435 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.47■■□□□ 1.83
Psma3O70435 Crlf1-201ENSMUST00000008032 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
Psma3O70435 Chrna5-202ENSMUST00000213960 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.83
Psma3O70435 Hoxd8-201ENSMUST00000019749 2634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.83
Psma3O70435 Tnfsf12-202ENSMUST00000181810 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
Psma3O70435 Mkrn1-202ENSMUST00000051671 1511 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
Psma3O70435 Nrg3-202ENSMUST00000168810 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
Psma3O70435 Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 1442 ntTSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
Psma3O70435 St3gal5-201ENSMUST00000069994 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
Psma3O70435 Snf8-202ENSMUST00000107700 849 ntTSL 2 BASIC26.4■■□□□ 1.82
Psma3O70435 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
Psma3O70435 Rab7-204ENSMUST00000113598 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
Psma3O70435 Homer3-202ENSMUST00000087467 880 ntTSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
Psma3O70435 Vdac3-202ENSMUST00000179233 1423 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
Psma3O70435 Dhrs13-203ENSMUST00000122342 1791 ntTSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
Psma3O70435 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
Psma3O70435 Peli2-204ENSMUST00000226513 1320 ntBASIC26.31■■□□□ 1.8
Psma3O70435 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
Psma3O70435 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.28■■□□□ 1.8
Psma3O70435 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.28■■□□□ 1.8
Psma3O70435 Gm24804-201ENSMUST00000174982 85 ntBASIC26.27■■□□□ 1.8
Psma3O70435 Syt7-201ENSMUST00000073899 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
Psma3O70435 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
Psma3O70435 Hnrnpa0-201ENSMUST00000007980 2678 ntAPPRIS P1 BASIC26.27■■□□□ 1.8
Psma3O70435 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
Psma3O70435 Btf3-201ENSMUST00000022163 1091 ntTSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
Psma3O70435 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC26.23■■□□□ 1.79
Psma3O70435 Ndufaf6-201ENSMUST00000058183 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Psma3O70435 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
Psma3O70435 Kcnmb4os2-201ENSMUST00000080943 1571 ntTSL 5 BASIC26.2■■□□□ 1.78
Psma3O70435 Gm26566-201ENSMUST00000181601 1038 ntAPPRIS P1 BASIC26.19■■□□□ 1.78
Psma3O70435 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Psma3O70435 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Psma3O70435 Gkap1-201ENSMUST00000091579 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Psma3O70435 Srp9-202ENSMUST00000111018 823 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
Psma3O70435 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Psma3O70435 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Psma3O70435 Ubl4a-207ENSMUST00000178691 1038 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
Psma3O70435 Lmo2-201ENSMUST00000111139 1434 ntTSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
Psma3O70435 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC26.1■■□□□ 1.77
Psma3O70435 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Psma3O70435 Mapk13-201ENSMUST00000004986 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
Psma3O70435 Hnrnpd-202ENSMUST00000072750 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.08■■□□□ 1.77
Psma3O70435 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Psma3O70435 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Psma3O70435 Sept11-208ENSMUST00000202308 1792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
Psma3O70435 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC26.06■■□□□ 1.76
Psma3O70435 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Psma3O70435 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
Psma3O70435 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
Psma3O70435 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Psma3O70435 Tmeff1-201ENSMUST00000030032 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Psma3O70435 Vsig8-202ENSMUST00000177086 1519 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Psma3O70435 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Psma3O70435 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Psma3O70435 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
Psma3O70435 Orai1-201ENSMUST00000051016 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Psma3O70435 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Psma3O70435 Coq10a-207ENSMUST00000220227 1434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
Psma3O70435 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
Psma3O70435 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Psma3O70435 Maz-202ENSMUST00000205461 796 ntTSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
Psma3O70435 Tlx1-201ENSMUST00000026236 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Psma3O70435 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC25.98■■□□□ 1.75
Psma3O70435 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Psma3O70435 Ywhaz-204ENSMUST00000110362 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Psma3O70435 Vstm2l-201ENSMUST00000109523 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.75
Psma3O70435 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
Psma3O70435 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.74
Psma3O70435 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC25.95■■□□□ 1.74
Psma3O70435 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Psma3O70435 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Psma3O70435 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Psma3O70435 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Psma3O70435 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Psma3O70435 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Psma3O70435 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.2 ms