Protein–RNA interactions for Protein: O60749

SNX2, Sorting nexin-2, humanhuman

Predictions only

Length 519 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNX2O60749 GNB5-202ENST00000358784 1735 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.01
SNX2O60749 ST7-208ENST00000393451 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.01
SNX2O60749 AKR1E2-201ENST00000298375 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
SNX2O60749 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC27.62■■■□□ 2.01
SNX2O60749 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC27.61■■■□□ 2.01
SNX2O60749 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
SNX2O60749 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
SNX2O60749 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
SNX2O60749 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC27.58■■■□□ 2.01
SNX2O60749 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
SNX2O60749 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC27.57■■■□□ 2
SNX2O60749 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC27.57■■■□□ 2
SNX2O60749 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC27.56■■■□□ 2
SNX2O60749 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
SNX2O60749 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
SNX2O60749 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
SNX2O60749 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC27.52■■■□□ 2
SNX2O60749 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC27.52■■■□□ 2
SNX2O60749 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
SNX2O60749 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC27.51■■□□□ 1.99
SNX2O60749 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
SNX2O60749 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
SNX2O60749 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
SNX2O60749 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
SNX2O60749 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
SNX2O60749 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC27.46■■□□□ 1.99
SNX2O60749 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC27.46■■□□□ 1.99
SNX2O60749 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
SNX2O60749 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
SNX2O60749 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
SNX2O60749 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
SNX2O60749 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
SNX2O60749 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
SNX2O60749 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC27.42■■□□□ 1.98
SNX2O60749 TPRG1L-202ENST00000378344 2414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.41■■□□□ 1.98
SNX2O60749 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.41■■□□□ 1.98
SNX2O60749 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.4■■□□□ 1.98
SNX2O60749 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC27.4■■□□□ 1.98
SNX2O60749 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
SNX2O60749 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC27.39■■□□□ 1.98
SNX2O60749 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.97
SNX2O60749 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC27.38■■□□□ 1.97
SNX2O60749 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.37■■□□□ 1.97
SNX2O60749 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
SNX2O60749 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC27.36■■□□□ 1.97
SNX2O60749 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC27.35■■□□□ 1.97
SNX2O60749 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
SNX2O60749 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC27.33■■□□□ 1.97
SNX2O60749 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC27.32■■□□□ 1.96
SNX2O60749 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
SNX2O60749 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
SNX2O60749 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
SNX2O60749 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC27.31■■□□□ 1.96
SNX2O60749 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
SNX2O60749 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC27.31■■□□□ 1.96
SNX2O60749 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.3■■□□□ 1.96
SNX2O60749 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
SNX2O60749 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
SNX2O60749 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
SNX2O60749 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC27.28■■□□□ 1.96
SNX2O60749 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC27.28■■□□□ 1.96
SNX2O60749 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC27.26■■□□□ 1.95
SNX2O60749 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
SNX2O60749 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.25■■□□□ 1.95
SNX2O60749 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
SNX2O60749 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC27.24■■□□□ 1.95
SNX2O60749 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC27.24■■□□□ 1.95
SNX2O60749 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.24■■□□□ 1.95
SNX2O60749 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC27.23■■□□□ 1.95
SNX2O60749 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
SNX2O60749 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC27.22■■□□□ 1.95
SNX2O60749 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
SNX2O60749 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
SNX2O60749 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC27.2■■□□□ 1.94
SNX2O60749 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.2■■□□□ 1.94
SNX2O60749 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
SNX2O60749 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
SNX2O60749 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
SNX2O60749 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC27.18■■□□□ 1.94
SNX2O60749 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC27.18■■□□□ 1.94
SNX2O60749 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC27.17■■□□□ 1.94
SNX2O60749 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
SNX2O60749 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC27.17■■□□□ 1.94
SNX2O60749 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC27.17■■□□□ 1.94
SNX2O60749 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
SNX2O60749 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC27.16■■□□□ 1.94
SNX2O60749 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
SNX2O60749 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC27.15■■□□□ 1.94
SNX2O60749 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC27.15■■□□□ 1.94
SNX2O60749 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
SNX2O60749 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
SNX2O60749 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
SNX2O60749 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
SNX2O60749 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
SNX2O60749 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC27.1■■□□□ 1.93
SNX2O60749 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC27.09■■□□□ 1.93
SNX2O60749 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC27.08■■□□□ 1.93
SNX2O60749 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
SNX2O60749 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC27.08■■□□□ 1.93
SNX2O60749 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 236.5 ms