Protein–RNA interactions for Protein: O60547

GMDS, GDP-mannose 4,6 dehydratase, humanhuman

Predictions only

Length 372 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GMDSO60547 CYP26C1-201ENST00000285949 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
GMDSO60547 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
GMDSO60547 PLPP2-203ENST00000434325 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
GMDSO60547 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
GMDSO60547 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
GMDSO60547 RNF126-201ENST00000292363 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
GMDSO60547 COPS6-201ENST00000303904 1432 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
GMDSO60547 GNB5-202ENST00000358784 1735 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
GMDSO60547 HAGHL-204ENST00000549114 1820 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
GMDSO60547 LTB4R2-204ENST00000533293 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
GMDSO60547 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
GMDSO60547 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
GMDSO60547 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
GMDSO60547 CLEC3B-201ENST00000296130 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
GMDSO60547 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
GMDSO60547 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
GMDSO60547 ARTN-201ENST00000372354 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
GMDSO60547 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC24.23■■□□□ 1.47
GMDSO60547 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
GMDSO60547 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
GMDSO60547 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
GMDSO60547 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
GMDSO60547 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
GMDSO60547 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
GMDSO60547 AP002365.1-201ENST00000603448 772 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
GMDSO60547 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
GMDSO60547 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
GMDSO60547 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
GMDSO60547 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
GMDSO60547 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
GMDSO60547 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
GMDSO60547 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
GMDSO60547 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
GMDSO60547 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
GMDSO60547 FBXO2-201ENST00000354287 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
GMDSO60547 SH3GL1-202ENST00000417295 1404 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
GMDSO60547 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
GMDSO60547 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
GMDSO60547 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
GMDSO60547 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
GMDSO60547 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
GMDSO60547 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
GMDSO60547 H2AFV-202ENST00000308153 752 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
GMDSO60547 FAM58A-202ENST00000440428 1164 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
GMDSO60547 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
GMDSO60547 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC24.07■■□□□ 1.44
GMDSO60547 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
GMDSO60547 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
GMDSO60547 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
GMDSO60547 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC24.04■■□□□ 1.44
GMDSO60547 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
GMDSO60547 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
GMDSO60547 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
GMDSO60547 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
GMDSO60547 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC24.02■■□□□ 1.44
GMDSO60547 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
GMDSO60547 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
GMDSO60547 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
GMDSO60547 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
GMDSO60547 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
GMDSO60547 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
GMDSO60547 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
GMDSO60547 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
GMDSO60547 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC23.99■■□□□ 1.43
GMDSO60547 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
GMDSO60547 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
GMDSO60547 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
GMDSO60547 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
GMDSO60547 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
GMDSO60547 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
GMDSO60547 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
GMDSO60547 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
GMDSO60547 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
GMDSO60547 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
GMDSO60547 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
GMDSO60547 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
GMDSO60547 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
GMDSO60547 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
GMDSO60547 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC23.9■■□□□ 1.42
GMDSO60547 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC23.9■■□□□ 1.42
GMDSO60547 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
GMDSO60547 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
GMDSO60547 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
GMDSO60547 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.88■■□□□ 1.41
GMDSO60547 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
GMDSO60547 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
GMDSO60547 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
GMDSO60547 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC23.86■■□□□ 1.41
GMDSO60547 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
GMDSO60547 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
GMDSO60547 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
GMDSO60547 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC23.83■■□□□ 1.41
GMDSO60547 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
GMDSO60547 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
GMDSO60547 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
GMDSO60547 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
GMDSO60547 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
GMDSO60547 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC23.8■■□□□ 1.4
GMDSO60547 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
GMDSO60547 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.8 ms