Protein–RNA interactions for Protein: O60393

NOBOX, Homeobox protein NOBOX, humanhuman

Predictions only

Length 691 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NOBOXO60393 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
NOBOXO60393 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC27.4■■□□□ 1.98
NOBOXO60393 SFRP5-201ENST00000266066 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
NOBOXO60393 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC27.39■■□□□ 1.98
NOBOXO60393 B4GALT7-201ENST00000029410 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
NOBOXO60393 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
NOBOXO60393 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC27.38■■□□□ 1.97
NOBOXO60393 GNB5-202ENST00000358784 1735 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
NOBOXO60393 ADRA2C-201ENST00000330055 2129 ntAPPRIS P1 BASIC27.37■■□□□ 1.97
NOBOXO60393 SDCCAG3-204ENST00000371725 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.37■■□□□ 1.97
NOBOXO60393 UBP1-201ENST00000283628 2074 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.36■■□□□ 1.97
NOBOXO60393 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC27.36■■□□□ 1.97
NOBOXO60393 ST7-208ENST00000393451 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
NOBOXO60393 CYP26C1-201ENST00000285949 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
NOBOXO60393 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
NOBOXO60393 SDCCAG3-202ENST00000357365 2304 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC27.28■■□□□ 1.96
NOBOXO60393 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
NOBOXO60393 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
NOBOXO60393 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
NOBOXO60393 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC27.26■■□□□ 1.96
NOBOXO60393 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.26■■□□□ 1.96
NOBOXO60393 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
NOBOXO60393 STK25-202ENST00000401869 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
NOBOXO60393 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC27.25■■□□□ 1.95
NOBOXO60393 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC27.25■■□□□ 1.95
NOBOXO60393 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
NOBOXO60393 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
NOBOXO60393 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC27.24■■□□□ 1.95
NOBOXO60393 ANXA5-201ENST00000296511 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
NOBOXO60393 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
NOBOXO60393 AKR1E2-201ENST00000298375 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
NOBOXO60393 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
NOBOXO60393 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
NOBOXO60393 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
NOBOXO60393 NADK2-202ENST00000381937 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.22■■□□□ 1.95
NOBOXO60393 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
NOBOXO60393 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
NOBOXO60393 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC27.21■■□□□ 1.95
NOBOXO60393 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC27.21■■□□□ 1.95
NOBOXO60393 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
NOBOXO60393 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.2■■□□□ 1.94
NOBOXO60393 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC27.19■■□□□ 1.94
NOBOXO60393 SAMD1-202ENST00000533683 2164 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
NOBOXO60393 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
NOBOXO60393 SH3GLB2-201ENST00000372554 1985 ntTSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
NOBOXO60393 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
NOBOXO60393 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
NOBOXO60393 CHST12-204ENST00000618655 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
NOBOXO60393 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.11■■□□□ 1.93
NOBOXO60393 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC27.11■■□□□ 1.93
NOBOXO60393 TPRG1L-202ENST00000378344 2414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.1■■□□□ 1.93
NOBOXO60393 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
NOBOXO60393 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC27.1■■□□□ 1.93
NOBOXO60393 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC27.09■■□□□ 1.93
NOBOXO60393 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC27.08■■□□□ 1.93
NOBOXO60393 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
NOBOXO60393 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC27.07■■□□□ 1.92
NOBOXO60393 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
NOBOXO60393 TNK2-201ENST00000333602 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
NOBOXO60393 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.05■■□□□ 1.92
NOBOXO60393 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC27.03■■□□□ 1.92
NOBOXO60393 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
NOBOXO60393 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC27.02■■□□□ 1.92
NOBOXO60393 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.01■■□□□ 1.91
NOBOXO60393 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC27■■□□□ 1.91
NOBOXO60393 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27■■□□□ 1.91
NOBOXO60393 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
NOBOXO60393 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC26.99■■□□□ 1.91
NOBOXO60393 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC26.99■■□□□ 1.91
NOBOXO60393 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
NOBOXO60393 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC26.98■■□□□ 1.91
NOBOXO60393 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
NOBOXO60393 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
NOBOXO60393 DPP6-204ENST00000406326 2012 ntTSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
NOBOXO60393 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
NOBOXO60393 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
NOBOXO60393 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
NOBOXO60393 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC26.92■■□□□ 1.9
NOBOXO60393 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
NOBOXO60393 CTDNEP1-210ENST00000574322 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
NOBOXO60393 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC26.89■■□□□ 1.9
NOBOXO60393 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC26.87■■□□□ 1.89
NOBOXO60393 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC26.86■■□□□ 1.89
NOBOXO60393 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC26.86■■□□□ 1.89
NOBOXO60393 KCNK1-202ENST00000366621 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
NOBOXO60393 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
NOBOXO60393 IL1R1-201ENST00000409288 1735 ntTSL 5 BASIC26.85■■□□□ 1.89
NOBOXO60393 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.84■■□□□ 1.89
NOBOXO60393 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC26.84■■□□□ 1.89
NOBOXO60393 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC26.84■■□□□ 1.89
NOBOXO60393 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
NOBOXO60393 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
NOBOXO60393 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
NOBOXO60393 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC26.81■■□□□ 1.88
NOBOXO60393 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
NOBOXO60393 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
NOBOXO60393 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC26.81■■□□□ 1.88
NOBOXO60393 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
NOBOXO60393 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
NOBOXO60393 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.6 ms