Protein–RNA interactions for Protein: O60296

TRAK2, Trafficking kinesin-binding protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 914 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAK2O60296 SATB1-AS1-216ENST00000598149 1119 ntTSL 2 BASIC32.74■■■□□ 2.83
TRAK2O60296 RNF126-201ENST00000292363 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.7■■■□□ 2.83
TRAK2O60296 AC008738.5-201ENST00000587312 482 ntTSL 3 BASIC32.68■■■□□ 2.82
TRAK2O60296 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.68■■■□□ 2.82
TRAK2O60296 LIMCH1-211ENST00000509638 1570 ntTSL 1 (best) BASIC32.66■■■□□ 2.82
TRAK2O60296 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.65■■■□□ 2.82
TRAK2O60296 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC32.65■■■□□ 2.82
TRAK2O60296 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.64■■■□□ 2.82
TRAK2O60296 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC32.59■■■□□ 2.81
TRAK2O60296 AL136373.1-201ENST00000634804 1449 ntAPPRIS P1 BASIC32.58■■■□□ 2.81
TRAK2O60296 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC32.57■■■□□ 2.8
TRAK2O60296 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.57■■■□□ 2.8
TRAK2O60296 CYBA-201ENST00000261623 797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.57■■■□□ 2.8
TRAK2O60296 RAB43-207ENST00000476465 1627 ntTSL 3 BASIC32.57■■■□□ 2.8
TRAK2O60296 HOXB3-208ENST00000476342 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.56■■■□□ 2.8
TRAK2O60296 FAM89B-202ENST00000449319 1337 ntTSL 1 (best) BASIC32.52■■■□□ 2.8
TRAK2O60296 AC006077.2-201ENST00000623591 457 ntBASIC32.51■■■□□ 2.79
TRAK2O60296 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC32.5■■■□□ 2.79
TRAK2O60296 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC32.5■■■□□ 2.79
TRAK2O60296 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC32.49■■■□□ 2.79
TRAK2O60296 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC32.48■■■□□ 2.79
TRAK2O60296 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC32.48■■■□□ 2.79
TRAK2O60296 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.47■■■□□ 2.79
TRAK2O60296 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC32.47■■■□□ 2.79
TRAK2O60296 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.46■■■□□ 2.79
TRAK2O60296 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.45■■■□□ 2.79
TRAK2O60296 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.45■■■□□ 2.79
TRAK2O60296 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.44■■■□□ 2.78
TRAK2O60296 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.43■■■□□ 2.78
TRAK2O60296 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.43■■■□□ 2.78
TRAK2O60296 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC32.43■■■□□ 2.78
TRAK2O60296 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.43■■■□□ 2.78
TRAK2O60296 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC32.42■■■□□ 2.78
TRAK2O60296 PPP1R1A-201ENST00000257905 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.42■■■□□ 2.78
TRAK2O60296 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.42■■■□□ 2.78
TRAK2O60296 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.41■■■□□ 2.78
TRAK2O60296 BRF1-213ENST00000548421 1452 ntTSL 1 (best) BASIC32.41■■■□□ 2.78
TRAK2O60296 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC32.4■■■□□ 2.78
TRAK2O60296 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.39■■■□□ 2.78
TRAK2O60296 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC32.38■■■□□ 2.77
TRAK2O60296 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.37■■■□□ 2.77
TRAK2O60296 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC32.36■■■□□ 2.77
TRAK2O60296 CHCHD4-202ENST00000396914 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.35■■■□□ 2.77
TRAK2O60296 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.35■■■□□ 2.77
TRAK2O60296 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.35■■■□□ 2.77
TRAK2O60296 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.34■■■□□ 2.77
TRAK2O60296 ZNRF2P1-201ENST00000441407 443 ntBASIC32.34■■■□□ 2.77
TRAK2O60296 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC32.33■■■□□ 2.77
TRAK2O60296 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.33■■■□□ 2.77
TRAK2O60296 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.3■■■□□ 2.76
TRAK2O60296 FAM19A5-203ENST00000402357 1508 ntTSL 1 (best) BASIC32.29■■■□□ 2.76
TRAK2O60296 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC32.29■■■□□ 2.76
TRAK2O60296 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC32.28■■■□□ 2.76
TRAK2O60296 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.28■■■□□ 2.76
TRAK2O60296 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.27■■■□□ 2.76
TRAK2O60296 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC32.27■■■□□ 2.76
TRAK2O60296 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC32.24■■■□□ 2.75
TRAK2O60296 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.23■■■□□ 2.75
TRAK2O60296 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.23■■■□□ 2.75
TRAK2O60296 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC32.22■■■□□ 2.75
TRAK2O60296 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC32.21■■■□□ 2.75
TRAK2O60296 CYP26C1-201ENST00000285949 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.2■■■□□ 2.75
TRAK2O60296 DRD4-201ENST00000176183 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.19■■■□□ 2.74
TRAK2O60296 PRELID2-202ENST00000394450 1102 ntTSL 1 (best) BASIC32.19■■■□□ 2.74
TRAK2O60296 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.19■■■□□ 2.74
TRAK2O60296 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.17■■■□□ 2.74
TRAK2O60296 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC32.17■■■□□ 2.74
TRAK2O60296 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC32.16■■■□□ 2.74
TRAK2O60296 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.16■■■□□ 2.74
TRAK2O60296 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC32.14■■■□□ 2.73
TRAK2O60296 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.13■■■□□ 2.73
TRAK2O60296 ANKRD65-203ENST00000454272 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.12■■■□□ 2.73
TRAK2O60296 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC32.12■■■□□ 2.73
TRAK2O60296 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.1■■■□□ 2.73
TRAK2O60296 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.09■■■□□ 2.73
TRAK2O60296 GNB5-202ENST00000358784 1735 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC32.08■■■□□ 2.73
TRAK2O60296 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC32.05■■■□□ 2.72
TRAK2O60296 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.05■■■□□ 2.72
TRAK2O60296 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC32.04■■■□□ 2.72
TRAK2O60296 MAF-203ENST00000569649 1217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.04■■■□□ 2.72
TRAK2O60296 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC32.02■■■□□ 2.72
TRAK2O60296 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC32.02■■■□□ 2.72
TRAK2O60296 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC31.99■■■□□ 2.71
TRAK2O60296 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC31.99■■■□□ 2.71
TRAK2O60296 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC31.98■■■□□ 2.71
TRAK2O60296 AGTRAP-204ENST00000376637 1067 ntTSL 2 BASIC31.98■■■□□ 2.71
TRAK2O60296 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.98■■■□□ 2.71
TRAK2O60296 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.98■■■□□ 2.71
TRAK2O60296 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.98■■■□□ 2.71
TRAK2O60296 SYNGR1-202ENST00000318801 1361 ntTSL 1 (best) BASIC31.96■■■□□ 2.71
TRAK2O60296 PCYT2-205ENST00000570391 1857 ntTSL 2 BASIC31.95■■■□□ 2.71
TRAK2O60296 AC079848.1-201ENST00000511301 327 ntTSL 3 BASIC31.95■■■□□ 2.71
TRAK2O60296 FGF2-203ENST00000614010 867 ntTSL 1 (best) BASIC31.94■■■□□ 2.7
TRAK2O60296 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC31.93■■■□□ 2.7
TRAK2O60296 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.91■■■□□ 2.7
TRAK2O60296 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.9■■■□□ 2.7
TRAK2O60296 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.89■■■□□ 2.7
TRAK2O60296 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC31.89■■■□□ 2.69
TRAK2O60296 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC31.89■■■□□ 2.69
TRAK2O60296 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.88■■■□□ 2.69
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 58.7 ms