Protein–RNA interactions for Protein: O43561

LAT, Linker for activation of T-cells family member 1, humanhuman

Predictions only

Length 262 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LATO43561 SFRP5-201ENST00000266066 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
LATO43561 SLC25A10-203ENST00000545862 1911 ntTSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
LATO43561 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
LATO43561 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
LATO43561 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
LATO43561 ADRA2C-201ENST00000330055 2129 ntAPPRIS P1 BASIC27.92■■■□□ 2.06
LATO43561 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
LATO43561 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
LATO43561 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.89■■■□□ 2.06
LATO43561 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
LATO43561 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC27.88■■■□□ 2.05
LATO43561 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC27.88■■■□□ 2.05
LATO43561 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.87■■■□□ 2.05
LATO43561 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC27.87■■■□□ 2.05
LATO43561 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC27.87■■■□□ 2.05
LATO43561 C11orf63-202ENST00000307257 1964 ntTSL 2 BASIC27.86■■■□□ 2.05
LATO43561 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
LATO43561 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC27.84■■■□□ 2.05
LATO43561 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC27.83■■■□□ 2.05
LATO43561 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
LATO43561 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
LATO43561 AKR1E2-201ENST00000298375 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
LATO43561 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
LATO43561 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.8■■■□□ 2.04
LATO43561 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
LATO43561 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC27.79■■■□□ 2.04
LATO43561 ANXA5-201ENST00000296511 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
LATO43561 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
LATO43561 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC27.73■■■□□ 2.03
LATO43561 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.73■■■□□ 2.03
LATO43561 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
LATO43561 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
LATO43561 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC27.7■■■□□ 2.02
LATO43561 GRASP-206ENST00000552049 1688 ntTSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
LATO43561 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC27.69■■■□□ 2.02
LATO43561 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC27.69■■■□□ 2.02
LATO43561 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.66■■■□□ 2.02
LATO43561 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.64■■■□□ 2.02
LATO43561 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
LATO43561 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC27.6■■■□□ 2.01
LATO43561 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
LATO43561 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC27.59■■■□□ 2.01
LATO43561 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
LATO43561 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC27.58■■■□□ 2.01
LATO43561 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
LATO43561 NADK2-202ENST00000381937 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.57■■■□□ 2
LATO43561 SDCCAG3-202ENST00000357365 2304 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC27.56■■■□□ 2
LATO43561 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC27.56■■■□□ 2
LATO43561 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC27.56■■■□□ 2
LATO43561 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC27.53■■■□□ 2
LATO43561 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC27.52■■■□□ 2
LATO43561 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.5■■□□□ 1.99
LATO43561 SSBP3-204ENST00000371320 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
LATO43561 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
LATO43561 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
LATO43561 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC27.48■■□□□ 1.99
LATO43561 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
LATO43561 KCNK1-202ENST00000366621 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
LATO43561 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
LATO43561 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
LATO43561 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC27.46■■□□□ 1.99
LATO43561 STK25-202ENST00000401869 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
LATO43561 CTDNEP1-210ENST00000574322 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
LATO43561 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
LATO43561 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC27.43■■□□□ 1.98
LATO43561 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
LATO43561 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
LATO43561 DPP6-204ENST00000406326 2012 ntTSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
LATO43561 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC27.39■■□□□ 1.98
LATO43561 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC27.39■■□□□ 1.98
LATO43561 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC27.39■■□□□ 1.98
LATO43561 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
LATO43561 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.97
LATO43561 IL1R1-201ENST00000409288 1735 ntTSL 5 BASIC27.37■■□□□ 1.97
LATO43561 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC27.37■■□□□ 1.97
LATO43561 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC27.37■■□□□ 1.97
LATO43561 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
LATO43561 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
LATO43561 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC27.36■■□□□ 1.97
LATO43561 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC27.35■■□□□ 1.97
LATO43561 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC27.35■■□□□ 1.97
LATO43561 SAMD1-202ENST00000533683 2164 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
LATO43561 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC27.32■■□□□ 1.96
LATO43561 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
LATO43561 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
LATO43561 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
LATO43561 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC27.3■■□□□ 1.96
LATO43561 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC27.29■■□□□ 1.96
LATO43561 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC27.29■■□□□ 1.96
LATO43561 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.28■■□□□ 1.96
LATO43561 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
LATO43561 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
LATO43561 CHST12-204ENST00000618655 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
LATO43561 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC27.25■■□□□ 1.95
LATO43561 SH3GLB2-201ENST00000372554 1985 ntTSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
LATO43561 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
LATO43561 TUBB6-201ENST00000317702 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
LATO43561 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC27.23■■□□□ 1.95
LATO43561 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC27.23■■□□□ 1.95
LATO43561 SULT4A1-201ENST00000330884 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.1 ms