Protein–RNA interactions for Protein: O43474

KLF4, Krueppel-like factor 4, humanhuman

Predictions only

Length 513 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLF4O43474 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
KLF4O43474 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
KLF4O43474 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
KLF4O43474 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC25.5■■□□□ 1.67
KLF4O43474 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
KLF4O43474 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
KLF4O43474 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
KLF4O43474 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC25.46■■□□□ 1.67
KLF4O43474 CD151-202ENST00000397420 1648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
KLF4O43474 LY6K-202ENST00000518841 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
KLF4O43474 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
KLF4O43474 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
KLF4O43474 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
KLF4O43474 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
KLF4O43474 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
KLF4O43474 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
KLF4O43474 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
KLF4O43474 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC25.39■■□□□ 1.65
KLF4O43474 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
KLF4O43474 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC25.37■■□□□ 1.65
KLF4O43474 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
KLF4O43474 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
KLF4O43474 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
KLF4O43474 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
KLF4O43474 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
KLF4O43474 PLPP2-203ENST00000434325 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
KLF4O43474 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
KLF4O43474 HAGHL-204ENST00000549114 1820 ntTSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
KLF4O43474 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC25.34■■□□□ 1.65
KLF4O43474 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
KLF4O43474 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
KLF4O43474 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
KLF4O43474 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
KLF4O43474 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
KLF4O43474 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
KLF4O43474 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
KLF4O43474 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
KLF4O43474 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
KLF4O43474 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.28■■□□□ 1.64
KLF4O43474 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC25.28■■□□□ 1.64
KLF4O43474 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC25.28■■□□□ 1.64
KLF4O43474 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
KLF4O43474 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
KLF4O43474 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
KLF4O43474 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
KLF4O43474 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
KLF4O43474 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC25.23■■□□□ 1.63
KLF4O43474 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
KLF4O43474 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
KLF4O43474 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC25.21■■□□□ 1.63
KLF4O43474 SH3GL1-202ENST00000417295 1404 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.63
KLF4O43474 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
KLF4O43474 FBXO2-201ENST00000354287 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
KLF4O43474 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
KLF4O43474 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
KLF4O43474 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
KLF4O43474 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
KLF4O43474 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
KLF4O43474 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
KLF4O43474 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.16■■□□□ 1.62
KLF4O43474 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
KLF4O43474 COPS6-201ENST00000303904 1432 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
KLF4O43474 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
KLF4O43474 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC25.13■■□□□ 1.61
KLF4O43474 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC25.13■■□□□ 1.61
KLF4O43474 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
KLF4O43474 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
KLF4O43474 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
KLF4O43474 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
KLF4O43474 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC25.07■■□□□ 1.6
KLF4O43474 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
KLF4O43474 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
KLF4O43474 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
KLF4O43474 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
KLF4O43474 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
KLF4O43474 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
KLF4O43474 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
KLF4O43474 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
KLF4O43474 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
KLF4O43474 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
KLF4O43474 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
KLF4O43474 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC25■■□□□ 1.59
KLF4O43474 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
KLF4O43474 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
KLF4O43474 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
KLF4O43474 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC24.96■■□□□ 1.59
KLF4O43474 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
KLF4O43474 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC24.95■■□□□ 1.58
KLF4O43474 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC24.94■■□□□ 1.58
KLF4O43474 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
KLF4O43474 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
KLF4O43474 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
KLF4O43474 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC24.93■■□□□ 1.58
KLF4O43474 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
KLF4O43474 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
KLF4O43474 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
KLF4O43474 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
KLF4O43474 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
KLF4O43474 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
KLF4O43474 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.7 ms