Protein–RNA interactions for Protein: O35927

Ctnnd2, Catenin delta-2, mousemouse

Predictions only

Length 1,247 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ctnnd2O35927 Frs3-201ENSMUST00000113296 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Ctnnd2O35927 AC166822.3-201ENSMUST00000227394 661 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
Ctnnd2O35927 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Ctnnd2O35927 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
Ctnnd2O35927 Gm2415-204ENSMUST00000190235 2004 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
Ctnnd2O35927 E2f4-201ENSMUST00000015003 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Ctnnd2O35927 Gm12184-201ENSMUST00000104959 1310 ntAPPRIS P1 BASIC25.18■■□□□ 1.62
Ctnnd2O35927 Ppp2r2d-201ENSMUST00000041097 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Ctnnd2O35927 Tmco6-201ENSMUST00000007046 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Ctnnd2O35927 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
Ctnnd2O35927 Mon2-207ENSMUST00000219203 1844 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Ctnnd2O35927 Ywhaz-204ENSMUST00000110362 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Ctnnd2O35927 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Ctnnd2O35927 Rbfox2-201ENSMUST00000048145 1720 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Ctnnd2O35927 Tcf15-201ENSMUST00000089112 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Ctnnd2O35927 Fcho2-203ENSMUST00000109403 1523 ntTSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
Ctnnd2O35927 C330011M18Rik-201ENSMUST00000071067 1849 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Ctnnd2O35927 Hspd1-201ENSMUST00000027123 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Ctnnd2O35927 Pwwp2a-202ENSMUST00000094294 1814 ntTSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
Ctnnd2O35927 Cenpv-201ENSMUST00000018653 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Ctnnd2O35927 Gm6658-202ENSMUST00000209493 1885 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
Ctnnd2O35927 Rnf130-202ENSMUST00000102776 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Ctnnd2O35927 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Ctnnd2O35927 Popdc3-202ENSMUST00000161803 1369 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Ctnnd2O35927 Rnf130-201ENSMUST00000054684 1415 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Ctnnd2O35927 Dapk3-209ENSMUST00000219850 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Ctnnd2O35927 Ccm2-201ENSMUST00000000388 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Ctnnd2O35927 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Ctnnd2O35927 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
Ctnnd2O35927 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Ctnnd2O35927 Il17d-201ENSMUST00000089494 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Ctnnd2O35927 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Ctnnd2O35927 Tmem59-201ENSMUST00000030361 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Ctnnd2O35927 Rab7-204ENSMUST00000113598 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Ctnnd2O35927 Tmed7-203ENSMUST00000151189 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Ctnnd2O35927 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
Ctnnd2O35927 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Ctnnd2O35927 Sap30l-201ENSMUST00000020826 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Ctnnd2O35927 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Ctnnd2O35927 Mkrn1-202ENSMUST00000051671 1511 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Ctnnd2O35927 Rab22a-202ENSMUST00000109110 849 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
Ctnnd2O35927 Chrna5-202ENSMUST00000213960 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Ctnnd2O35927 Tlx1-201ENSMUST00000026236 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Ctnnd2O35927 Ildr2-207ENSMUST00000195557 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Ctnnd2O35927 Abhd17a-201ENSMUST00000003436 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Ctnnd2O35927 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
Ctnnd2O35927 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Ctnnd2O35927 Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 1442 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Ctnnd2O35927 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
Ctnnd2O35927 Snf8-202ENSMUST00000107700 849 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
Ctnnd2O35927 Homer3-202ENSMUST00000087467 880 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Ctnnd2O35927 Crlf1-201ENSMUST00000008032 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Ctnnd2O35927 Tnfsf12-202ENSMUST00000181810 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Ctnnd2O35927 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.56
Ctnnd2O35927 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Ctnnd2O35927 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Ctnnd2O35927 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
Ctnnd2O35927 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Ctnnd2O35927 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Ctnnd2O35927 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
Ctnnd2O35927 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
Ctnnd2O35927 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Ctnnd2O35927 Btf3-201ENSMUST00000022163 1091 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Ctnnd2O35927 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
Ctnnd2O35927 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC24.7■■□□□ 1.55
Ctnnd2O35927 Dhrs13-203ENSMUST00000122342 1791 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
Ctnnd2O35927 Gm24804-201ENSMUST00000174982 85 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
Ctnnd2O35927 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Ctnnd2O35927 Syt7-201ENSMUST00000073899 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Ctnnd2O35927 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Ctnnd2O35927 Peli2-204ENSMUST00000226513 1320 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
Ctnnd2O35927 Vdac3-202ENSMUST00000179233 1423 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Ctnnd2O35927 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Ctnnd2O35927 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC24.64■■□□□ 1.54
Ctnnd2O35927 Ndufaf6-201ENSMUST00000058183 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Ctnnd2O35927 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
Ctnnd2O35927 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Ctnnd2O35927 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Ctnnd2O35927 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Ctnnd2O35927 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
Ctnnd2O35927 Gm26566-201ENSMUST00000181601 1038 ntAPPRIS P1 BASIC24.59■■□□□ 1.53
Ctnnd2O35927 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
Ctnnd2O35927 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Ctnnd2O35927 Kcnmb4os2-201ENSMUST00000080943 1571 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
Ctnnd2O35927 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Ctnnd2O35927 Mapk13-201ENSMUST00000004986 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Ctnnd2O35927 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Ctnnd2O35927 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Ctnnd2O35927 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Ctnnd2O35927 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Ctnnd2O35927 Gkap1-201ENSMUST00000091579 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Ctnnd2O35927 Srp9-202ENSMUST00000111018 823 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Ctnnd2O35927 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Ctnnd2O35927 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Ctnnd2O35927 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Ctnnd2O35927 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Ctnnd2O35927 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Ctnnd2O35927 Ubl4a-207ENSMUST00000178691 1038 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
Ctnnd2O35927 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Ctnnd2O35927 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 59.5 ms