Protein–RNA interactions for Protein: O35902

Dsg3, Desmoglein-3, mousemouse

Predictions only

Length 993 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dsg3O35902 1700016A09Rik-201ENSMUST00000192004 835 ntBASIC28.36■■■□□ 2.13
Dsg3O35902 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC28.36■■■□□ 2.13
Dsg3O35902 Nemp1-202ENSMUST00000118612 1522 ntTSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
Dsg3O35902 Gm26566-201ENSMUST00000181601 1038 ntAPPRIS P1 BASIC28.34■■■□□ 2.13
Dsg3O35902 Btf3-201ENSMUST00000022163 1091 ntTSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
Dsg3O35902 Cadm4-201ENSMUST00000068023 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
Dsg3O35902 Mkrn1-202ENSMUST00000051671 1511 ntTSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
Dsg3O35902 Zfp131-207ENSMUST00000224946 1783 ntBASIC28.32■■■□□ 2.12
Dsg3O35902 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
Dsg3O35902 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC28.32■■■□□ 2.12
Dsg3O35902 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
Dsg3O35902 Popdc3-202ENSMUST00000161803 1369 ntTSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
Dsg3O35902 9230104M06Rik-201ENSMUST00000180971 1963 ntBASIC28.24■■■□□ 2.11
Dsg3O35902 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
Dsg3O35902 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
Dsg3O35902 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC28.19■■■□□ 2.1
Dsg3O35902 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.16■■■□□ 2.1
Dsg3O35902 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC28.16■■■□□ 2.1
Dsg3O35902 Cenpv-201ENSMUST00000018653 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
Dsg3O35902 Rab22a-202ENSMUST00000109110 849 ntTSL 5 BASIC28.12■■■□□ 2.09
Dsg3O35902 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
Dsg3O35902 Lrrc1-204ENSMUST00000183734 2113 ntTSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
Dsg3O35902 Tcfl5-201ENSMUST00000037877 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
Dsg3O35902 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
Dsg3O35902 Fam241a-202ENSMUST00000199273 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
Dsg3O35902 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC28.04■■■□□ 2.08
Dsg3O35902 Emx1-201ENSMUST00000045942 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
Dsg3O35902 Gm42517-201ENSMUST00000197216 1850 ntAPPRIS P1 BASIC28.02■■■□□ 2.08
Dsg3O35902 Mipep-204ENSMUST00000225043 1548 ntBASIC28.01■■■□□ 2.07
Dsg3O35902 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
Dsg3O35902 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28■■■□□ 2.07
Dsg3O35902 Ldb1-207ENSMUST00000156585 2014 ntTSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
Dsg3O35902 Wsb2-201ENSMUST00000031309 2421 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
Dsg3O35902 Syt7-201ENSMUST00000073899 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
Dsg3O35902 Kcnmb4os2-201ENSMUST00000080943 1571 ntTSL 5 BASIC27.99■■■□□ 2.07
Dsg3O35902 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
Dsg3O35902 Rpia-201ENSMUST00000066134 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
Dsg3O35902 Calm3-201ENSMUST00000019514 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
Dsg3O35902 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
Dsg3O35902 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
Dsg3O35902 Egln2-201ENSMUST00000080058 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
Dsg3O35902 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
Dsg3O35902 Ube2q2-202ENSMUST00000121677 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.9■■■□□ 2.06
Dsg3O35902 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
Dsg3O35902 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
Dsg3O35902 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
Dsg3O35902 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
Dsg3O35902 Crlf1-201ENSMUST00000008032 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
Dsg3O35902 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC27.86■■■□□ 2.05
Dsg3O35902 Stk24-201ENSMUST00000079817 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
Dsg3O35902 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC27.85■■■□□ 2.05
Dsg3O35902 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC27.85■■■□□ 2.05
Dsg3O35902 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
Dsg3O35902 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
Dsg3O35902 Gnai2-201ENSMUST00000055704 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
Dsg3O35902 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
Dsg3O35902 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
Dsg3O35902 Casp9-202ENSMUST00000097805 1498 ntTSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
Dsg3O35902 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.8■■■□□ 2.04
Dsg3O35902 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.78■■■□□ 2.04
Dsg3O35902 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
Dsg3O35902 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC27.78■■■□□ 2.04
Dsg3O35902 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
Dsg3O35902 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.76■■■□□ 2.03
Dsg3O35902 Mapkapk5-201ENSMUST00000031410 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
Dsg3O35902 Lactb-202ENSMUST00000215172 1806 ntTSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
Dsg3O35902 Shf-201ENSMUST00000048635 1431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
Dsg3O35902 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
Dsg3O35902 Dapk3-209ENSMUST00000219850 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
Dsg3O35902 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
Dsg3O35902 Msantd2-201ENSMUST00000048604 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
Dsg3O35902 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC27.73■■■□□ 2.03
Dsg3O35902 Orai1-201ENSMUST00000051016 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
Dsg3O35902 Cib1-201ENSMUST00000065163 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
Dsg3O35902 Azin2-201ENSMUST00000030581 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
Dsg3O35902 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
Dsg3O35902 Tprgl-201ENSMUST00000030896 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
Dsg3O35902 Orai1-202ENSMUST00000121652 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.01
Dsg3O35902 Abhd17a-201ENSMUST00000003436 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.01
Dsg3O35902 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC27.62■■■□□ 2.01
Dsg3O35902 Gm5987-201ENSMUST00000196433 1151 ntBASIC27.61■■■□□ 2.01
Dsg3O35902 Evx2-202ENSMUST00000173623 1428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
Dsg3O35902 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
Dsg3O35902 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC27.59■■■□□ 2.01
Dsg3O35902 1810026B05Rik-206ENSMUST00000187421 519 ntTSL 3 BASIC27.58■■■□□ 2.01
Dsg3O35902 Gm2018-201ENSMUST00000140754 478 ntTSL 2 BASIC27.57■■■□□ 2
Dsg3O35902 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC27.56■■■□□ 2
Dsg3O35902 Mocs3-201ENSMUST00000099071 1973 ntAPPRIS P1 BASIC27.55■■■□□ 2
Dsg3O35902 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
Dsg3O35902 AY074887-201ENSMUST00000054018 769 ntAPPRIS P1 BASIC27.55■■■□□ 2
Dsg3O35902 Fcho2-203ENSMUST00000109403 1523 ntTSL 5 BASIC27.53■■■□□ 2
Dsg3O35902 Gm12523-201ENSMUST00000148844 599 ntTSL 5 BASIC27.53■■■□□ 2
Dsg3O35902 Gm26588-201ENSMUST00000181064 2098 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
Dsg3O35902 Dhrs13-203ENSMUST00000122342 1791 ntTSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
Dsg3O35902 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
Dsg3O35902 Dlx4-201ENSMUST00000021241 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
Dsg3O35902 Frs3-201ENSMUST00000113296 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
Dsg3O35902 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
Dsg3O35902 Bcl7c-207ENSMUST00000207019 654 ntTSL 3 BASIC27.45■■□□□ 1.98
Dsg3O35902 Stard3nl-210ENSMUST00000222869 1030 ntTSL 5 BASIC27.45■■□□□ 1.98
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.7 ms