Protein–RNA interactions for Protein: O35664

Ifnar2, Interferon alpha/beta receptor 2, mousemouse

Predictions only

Length 513 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ifnar2O35664 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
Ifnar2O35664 Enho-201ENSMUST00000127306 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
Ifnar2O35664 Chrna5-202ENSMUST00000213960 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
Ifnar2O35664 Clec2l-201ENSMUST00000114874 1428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.65■■□□□ 1.86
Ifnar2O35664 Tmem59-201ENSMUST00000030361 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
Ifnar2O35664 AL845457.1-201ENSMUST00000197244 68 ntBASIC26.64■■□□□ 1.86
Ifnar2O35664 Ildr2-207ENSMUST00000195557 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
Ifnar2O35664 Gm27322-201ENSMUST00000184007 104 ntBASIC26.63■■□□□ 1.85
Ifnar2O35664 Nkx1-1-201ENSMUST00000173348 1209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.62■■□□□ 1.85
Ifnar2O35664 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
Ifnar2O35664 Ilk-201ENSMUST00000033182 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
Ifnar2O35664 Mapk3-201ENSMUST00000050201 1267 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.58■■□□□ 1.85
Ifnar2O35664 Grk2-210ENSMUST00000171123 1439 ntTSL 5 BASIC26.56■■□□□ 1.84
Ifnar2O35664 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC26.52■■□□□ 1.84
Ifnar2O35664 Mapk14-205ENSMUST00000114758 1581 ntTSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
Ifnar2O35664 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
Ifnar2O35664 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
Ifnar2O35664 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
Ifnar2O35664 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
Ifnar2O35664 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
Ifnar2O35664 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.83
Ifnar2O35664 Ino80b-201ENSMUST00000032109 1038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
Ifnar2O35664 Slc25a28-201ENSMUST00000046038 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
Ifnar2O35664 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
Ifnar2O35664 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
Ifnar2O35664 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
Ifnar2O35664 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
Ifnar2O35664 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.4■■□□□ 1.82
Ifnar2O35664 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
Ifnar2O35664 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
Ifnar2O35664 Gm8066-201ENSMUST00000197762 485 ntTSL 3 BASIC26.38■■□□□ 1.81
Ifnar2O35664 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
Ifnar2O35664 Mipep-204ENSMUST00000225043 1548 ntBASIC26.35■■□□□ 1.81
Ifnar2O35664 AC166822.3-201ENSMUST00000227394 661 ntBASIC26.35■■□□□ 1.81
Ifnar2O35664 Shf-201ENSMUST00000048635 1431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
Ifnar2O35664 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
Ifnar2O35664 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
Ifnar2O35664 Gm12184-201ENSMUST00000104959 1310 ntAPPRIS P1 BASIC26.31■■□□□ 1.8
Ifnar2O35664 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.3■■□□□ 1.8
Ifnar2O35664 Fcho2-203ENSMUST00000109403 1523 ntTSL 5 BASIC26.29■■□□□ 1.8
Ifnar2O35664 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
Ifnar2O35664 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
Ifnar2O35664 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
Ifnar2O35664 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
Ifnar2O35664 Tcf15-201ENSMUST00000089112 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
Ifnar2O35664 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.23■■□□□ 1.79
Ifnar2O35664 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Ifnar2O35664 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
Ifnar2O35664 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Ifnar2O35664 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Ifnar2O35664 Tmed7-203ENSMUST00000151189 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Ifnar2O35664 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC26.15■■□□□ 1.78
Ifnar2O35664 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC26.14■■□□□ 1.77
Ifnar2O35664 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Ifnar2O35664 Rnf130-201ENSMUST00000054684 1415 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Ifnar2O35664 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Ifnar2O35664 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Ifnar2O35664 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Ifnar2O35664 Il17d-201ENSMUST00000089494 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Ifnar2O35664 Rnf130-202ENSMUST00000102776 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Ifnar2O35664 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Ifnar2O35664 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC26.09■■□□□ 1.77
Ifnar2O35664 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
Ifnar2O35664 Sap30l-201ENSMUST00000020826 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Ifnar2O35664 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Ifnar2O35664 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Ifnar2O35664 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Ifnar2O35664 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC26.05■■□□□ 1.76
Ifnar2O35664 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Ifnar2O35664 Cenpv-201ENSMUST00000018653 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Ifnar2O35664 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC26.03■■□□□ 1.76
Ifnar2O35664 Popdc3-202ENSMUST00000161803 1369 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Ifnar2O35664 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
Ifnar2O35664 Snf8-202ENSMUST00000107700 849 ntTSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
Ifnar2O35664 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
Ifnar2O35664 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
Ifnar2O35664 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
Ifnar2O35664 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
Ifnar2O35664 Homer3-202ENSMUST00000087467 880 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Ifnar2O35664 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Ifnar2O35664 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Ifnar2O35664 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
Ifnar2O35664 Dapk3-209ENSMUST00000219850 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Ifnar2O35664 Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 1442 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Ifnar2O35664 Tlx1-201ENSMUST00000026236 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Ifnar2O35664 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Ifnar2O35664 Gm24804-201ENSMUST00000174982 85 ntBASIC25.92■■□□□ 1.74
Ifnar2O35664 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
Ifnar2O35664 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC25.88■■□□□ 1.73
Ifnar2O35664 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Ifnar2O35664 Mkrn1-202ENSMUST00000051671 1511 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Ifnar2O35664 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Ifnar2O35664 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Ifnar2O35664 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
Ifnar2O35664 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Ifnar2O35664 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Ifnar2O35664 Tnfsf12-202ENSMUST00000181810 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
Ifnar2O35664 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Ifnar2O35664 Crlf1-201ENSMUST00000008032 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Ifnar2O35664 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.5 ms