Protein–RNA interactions for Protein: O35652

Lhx8, LIM/homeobox protein Lhx8, mousemouse

Predictions only

Length 367 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lhx8O35652 Tmco6-201ENSMUST00000007046 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Lhx8O35652 Ino80b-202ENSMUST00000113935 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Lhx8O35652 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
Lhx8O35652 C330011M18Rik-201ENSMUST00000071067 1849 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Lhx8O35652 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Lhx8O35652 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Lhx8O35652 Mon2-207ENSMUST00000219203 1844 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Lhx8O35652 Mapk13-201ENSMUST00000004986 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Lhx8O35652 Sap30l-201ENSMUST00000020826 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Lhx8O35652 Fcho2-204ENSMUST00000179563 1586 ntTSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
Lhx8O35652 Bzw1-202ENSMUST00000186949 1492 ntTSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.6
Lhx8O35652 Nkx1-1-201ENSMUST00000173348 1209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
Lhx8O35652 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Lhx8O35652 Carnmt1-201ENSMUST00000025632 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Lhx8O35652 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
Lhx8O35652 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
Lhx8O35652 Gm6658-202ENSMUST00000209493 1885 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
Lhx8O35652 Uhrf2-202ENSMUST00000112552 1464 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Lhx8O35652 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Lhx8O35652 Gm42984-201ENSMUST00000195990 987 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Lhx8O35652 Ube2q2-202ENSMUST00000121677 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
Lhx8O35652 Pwwp2a-202ENSMUST00000094294 1814 ntTSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
Lhx8O35652 Rab7-204ENSMUST00000113598 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Lhx8O35652 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Lhx8O35652 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Lhx8O35652 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
Lhx8O35652 Gm5987-201ENSMUST00000196433 1151 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
Lhx8O35652 AC158592.1-201ENSMUST00000215560 1113 ntTSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
Lhx8O35652 Casp9-202ENSMUST00000097805 1498 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Lhx8O35652 Hnrnpd-203ENSMUST00000112939 1670 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
Lhx8O35652 Chrna5-202ENSMUST00000213960 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
Lhx8O35652 Aes-201ENSMUST00000002518 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Lhx8O35652 Ildr2-207ENSMUST00000195557 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Lhx8O35652 Ndufaf6-201ENSMUST00000058183 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Lhx8O35652 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Lhx8O35652 Gm12339-201ENSMUST00000127424 728 ntTSL 3 BASIC24.85■■□□□ 1.57
Lhx8O35652 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Lhx8O35652 Tmem59-201ENSMUST00000030361 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Lhx8O35652 Srsf9-201ENSMUST00000031513 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Lhx8O35652 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
Lhx8O35652 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Lhx8O35652 Mbd3-204ENSMUST00000105349 1566 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Lhx8O35652 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Lhx8O35652 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Lhx8O35652 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Lhx8O35652 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Lhx8O35652 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
Lhx8O35652 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Lhx8O35652 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Lhx8O35652 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
Lhx8O35652 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Lhx8O35652 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Lhx8O35652 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC24.64■■□□□ 1.54
Lhx8O35652 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
Lhx8O35652 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
Lhx8O35652 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Lhx8O35652 Slc25a28-201ENSMUST00000046038 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Lhx8O35652 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Lhx8O35652 2210008F06Rik-201ENSMUST00000180805 1082 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Lhx8O35652 Mafa-201ENSMUST00000062002 1080 ntAPPRIS P1 BASIC24.6■■□□□ 1.53
Lhx8O35652 Homer3-202ENSMUST00000087467 880 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Lhx8O35652 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Lhx8O35652 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC24.58■■□□□ 1.53
Lhx8O35652 Srp9-202ENSMUST00000111018 823 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Lhx8O35652 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Lhx8O35652 AL845457.1-201ENSMUST00000197244 68 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
Lhx8O35652 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Lhx8O35652 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
Lhx8O35652 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Lhx8O35652 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Lhx8O35652 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Lhx8O35652 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Lhx8O35652 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
Lhx8O35652 Mipep-204ENSMUST00000225043 1548 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
Lhx8O35652 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Lhx8O35652 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Lhx8O35652 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Lhx8O35652 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Lhx8O35652 Fcho2-203ENSMUST00000109403 1523 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Lhx8O35652 Ilk-201ENSMUST00000033182 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Lhx8O35652 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
Lhx8O35652 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Lhx8O35652 Shf-201ENSMUST00000048635 1431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Lhx8O35652 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
Lhx8O35652 Gm2018-201ENSMUST00000140754 478 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
Lhx8O35652 Mapk14-205ENSMUST00000114758 1581 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Lhx8O35652 Grk2-210ENSMUST00000171123 1439 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Lhx8O35652 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Lhx8O35652 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Lhx8O35652 Gm12184-201ENSMUST00000104959 1310 ntAPPRIS P1 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Lhx8O35652 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Lhx8O35652 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Lhx8O35652 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Lhx8O35652 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC24.39■■□□□ 1.49
Lhx8O35652 Eif2ak3-204ENSMUST00000162950 927 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Lhx8O35652 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Lhx8O35652 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Lhx8O35652 Vstm2l-201ENSMUST00000109523 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Lhx8O35652 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Lhx8O35652 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 100.1 ms