Protein–RNA interactions for Protein: O35621

Pmm1, Phosphomannomutase 1, mousemouse

Predictions only

Length 262 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pmm1O35621 Fcho2-203ENSMUST00000109403 1523 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
Pmm1O35621 Tmem59-201ENSMUST00000030361 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Pmm1O35621 Adgrb2-207ENSMUST00000120204 5170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Pmm1O35621 Gm8066-201ENSMUST00000197762 485 ntTSL 3 BASIC24.58■■□□□ 1.53
Pmm1O35621 Maz-202ENSMUST00000205461 796 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
Pmm1O35621 Gm24804-201ENSMUST00000174982 85 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
Pmm1O35621 Gm6658-202ENSMUST00000209493 1885 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
Pmm1O35621 AC166822.3-201ENSMUST00000227394 661 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
Pmm1O35621 Snf8-202ENSMUST00000107700 849 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
Pmm1O35621 Il17d-201ENSMUST00000089494 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Pmm1O35621 Nrg3-202ENSMUST00000168810 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Pmm1O35621 Cenpv-201ENSMUST00000018653 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Pmm1O35621 St3gal5-201ENSMUST00000069994 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Pmm1O35621 Gm12184-201ENSMUST00000104959 1310 ntAPPRIS P1 BASIC24.45■■□□□ 1.5
Pmm1O35621 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Pmm1O35621 Ildr2-207ENSMUST00000195557 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Pmm1O35621 Sap30l-201ENSMUST00000020826 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Pmm1O35621 Dapk3-209ENSMUST00000219850 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Pmm1O35621 Chrna5-202ENSMUST00000213960 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Pmm1O35621 Ccm2-201ENSMUST00000000388 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Pmm1O35621 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Pmm1O35621 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Pmm1O35621 Rab7-204ENSMUST00000113598 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Pmm1O35621 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Pmm1O35621 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Pmm1O35621 Popdc3-202ENSMUST00000161803 1369 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Pmm1O35621 Rnf130-202ENSMUST00000102776 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Pmm1O35621 Hoxd8-201ENSMUST00000019749 2634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Pmm1O35621 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Pmm1O35621 Hspd1-201ENSMUST00000027123 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Pmm1O35621 Mapk13-201ENSMUST00000004986 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Pmm1O35621 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Pmm1O35621 Tnfsf12-202ENSMUST00000181810 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Pmm1O35621 Hnrnpa0-201ENSMUST00000007980 2678 ntAPPRIS P1 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Pmm1O35621 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Pmm1O35621 Homer3-202ENSMUST00000087467 880 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Pmm1O35621 Ndufaf6-201ENSMUST00000058183 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Pmm1O35621 Rnf130-201ENSMUST00000054684 1415 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Pmm1O35621 Abhd17a-201ENSMUST00000003436 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Pmm1O35621 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Pmm1O35621 AI837181-202ENSMUST00000159759 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Pmm1O35621 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Pmm1O35621 Rab22a-202ENSMUST00000109110 849 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Pmm1O35621 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Pmm1O35621 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Pmm1O35621 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Pmm1O35621 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Pmm1O35621 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Pmm1O35621 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Pmm1O35621 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Pmm1O35621 Mkrn1-202ENSMUST00000051671 1511 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Pmm1O35621 Crlf1-201ENSMUST00000008032 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
Pmm1O35621 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Pmm1O35621 Dhrs13-203ENSMUST00000122342 1791 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Pmm1O35621 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Pmm1O35621 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Pmm1O35621 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
Pmm1O35621 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Pmm1O35621 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
Pmm1O35621 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
Pmm1O35621 Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 1442 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Pmm1O35621 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Pmm1O35621 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Pmm1O35621 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Pmm1O35621 Syt7-201ENSMUST00000073899 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Pmm1O35621 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Pmm1O35621 Ywhaz-204ENSMUST00000110362 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Pmm1O35621 Gkap1-201ENSMUST00000091579 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Pmm1O35621 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Pmm1O35621 Srp9-202ENSMUST00000111018 823 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Pmm1O35621 Btf3-201ENSMUST00000022163 1091 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Pmm1O35621 Zfp131-205ENSMUST00000223812 663 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
Pmm1O35621 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Pmm1O35621 Tmeff1-201ENSMUST00000030032 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Pmm1O35621 Ubl4a-207ENSMUST00000178691 1038 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
Pmm1O35621 Vsig8-202ENSMUST00000177086 1519 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Pmm1O35621 Peli2-204ENSMUST00000226513 1320 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
Pmm1O35621 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Pmm1O35621 Vstm2l-201ENSMUST00000109523 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
Pmm1O35621 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Pmm1O35621 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
Pmm1O35621 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Pmm1O35621 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Pmm1O35621 Lmo2-201ENSMUST00000111139 1434 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
Pmm1O35621 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Pmm1O35621 Hnrnpd-202ENSMUST00000072750 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.92■■□□□ 1.42
Pmm1O35621 Sept11-208ENSMUST00000202308 1792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
Pmm1O35621 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Pmm1O35621 Gm16148-201ENSMUST00000119653 893 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
Pmm1O35621 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Pmm1O35621 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC23.9■■□□□ 1.42
Pmm1O35621 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Pmm1O35621 Vdac3-202ENSMUST00000179233 1423 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Pmm1O35621 Kcnmb4os2-201ENSMUST00000080943 1571 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
Pmm1O35621 Gm42984-201ENSMUST00000195990 987 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Pmm1O35621 Srsf9-201ENSMUST00000031513 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Pmm1O35621 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Pmm1O35621 Gm26566-201ENSMUST00000181601 1038 ntAPPRIS P1 BASIC23.87■■□□□ 1.41
Pmm1O35621 Orai1-201ENSMUST00000051016 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Pmm1O35621 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17 ms