Protein–RNA interactions for Protein: O15245

SLC22A1, Solute carrier family 22 member 1, humanhuman

Predictions only

Length 554 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC22A1O15245 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
SLC22A1O15245 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC25.18■■□□□ 1.62
SLC22A1O15245 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
SLC22A1O15245 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
SLC22A1O15245 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
SLC22A1O15245 NT5M-201ENST00000389022 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
SLC22A1O15245 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
SLC22A1O15245 NT5M-207ENST00000616989 1635 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
SLC22A1O15245 PPP2CB-204ENST00000518564 691 ntTSL 3 BASIC25.15■■□□□ 1.62
SLC22A1O15245 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
SLC22A1O15245 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.61
SLC22A1O15245 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.61
SLC22A1O15245 RNF126-201ENST00000292363 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
SLC22A1O15245 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
SLC22A1O15245 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
SLC22A1O15245 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
SLC22A1O15245 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
SLC22A1O15245 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
SLC22A1O15245 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
SLC22A1O15245 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
SLC22A1O15245 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC25.05■■□□□ 1.6
SLC22A1O15245 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC25.05■■□□□ 1.6
SLC22A1O15245 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
SLC22A1O15245 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
SLC22A1O15245 C11orf68-202ENST00000449692 1559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
SLC22A1O15245 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
SLC22A1O15245 ANXA5-201ENST00000296511 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
SLC22A1O15245 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
SLC22A1O15245 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
SLC22A1O15245 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
SLC22A1O15245 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
SLC22A1O15245 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
SLC22A1O15245 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
SLC22A1O15245 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
SLC22A1O15245 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
SLC22A1O15245 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
SLC22A1O15245 RAN-202ENST00000392369 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
SLC22A1O15245 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
SLC22A1O15245 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
SLC22A1O15245 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
SLC22A1O15245 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
SLC22A1O15245 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
SLC22A1O15245 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
SLC22A1O15245 RAB43-207ENST00000476465 1627 ntTSL 3 BASIC24.85■■□□□ 1.57
SLC22A1O15245 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
SLC22A1O15245 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
SLC22A1O15245 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
SLC22A1O15245 PPP1R1A-201ENST00000257905 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
SLC22A1O15245 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
SLC22A1O15245 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
SLC22A1O15245 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
SLC22A1O15245 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
SLC22A1O15245 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
SLC22A1O15245 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
SLC22A1O15245 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
SLC22A1O15245 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
SLC22A1O15245 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
SLC22A1O15245 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
SLC22A1O15245 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
SLC22A1O15245 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
SLC22A1O15245 BRF1-213ENST00000548421 1452 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
SLC22A1O15245 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
SLC22A1O15245 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
SLC22A1O15245 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
SLC22A1O15245 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
SLC22A1O15245 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
SLC22A1O15245 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
SLC22A1O15245 LIMCH1-211ENST00000509638 1570 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
SLC22A1O15245 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
SLC22A1O15245 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC24.71■■□□□ 1.55
SLC22A1O15245 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
SLC22A1O15245 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
SLC22A1O15245 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
SLC22A1O15245 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
SLC22A1O15245 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
SLC22A1O15245 INO80B-201ENST00000233331 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
SLC22A1O15245 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
SLC22A1O15245 CYP26C1-201ENST00000285949 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
SLC22A1O15245 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
SLC22A1O15245 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
SLC22A1O15245 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
SLC22A1O15245 CMTM4-202ENST00000394106 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
SLC22A1O15245 CMTM4-204ENST00000563952 1023 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
SLC22A1O15245 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
SLC22A1O15245 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
SLC22A1O15245 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
SLC22A1O15245 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
SLC22A1O15245 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
SLC22A1O15245 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
SLC22A1O15245 AL136373.1-201ENST00000634804 1449 ntAPPRIS P1 BASIC24.57■■□□□ 1.52
SLC22A1O15245 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC24.56■■□□□ 1.52
SLC22A1O15245 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
SLC22A1O15245 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
SLC22A1O15245 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
SLC22A1O15245 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
SLC22A1O15245 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
SLC22A1O15245 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
SLC22A1O15245 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
SLC22A1O15245 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
SLC22A1O15245 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.9 ms