Protein–RNA interactions for Protein: O14777

NDC80, Kinetochore protein NDC80 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 642 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NDC80O14777 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.16
NDC80O14777 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC28.51■■■□□ 2.15
NDC80O14777 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC28.51■■■□□ 2.15
NDC80O14777 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
NDC80O14777 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
NDC80O14777 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
NDC80O14777 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC28.48■■■□□ 2.15
NDC80O14777 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
NDC80O14777 AGTRAP-204ENST00000376637 1067 ntTSL 2 BASIC28.47■■■□□ 2.15
NDC80O14777 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
NDC80O14777 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
NDC80O14777 AC008738.5-201ENST00000587312 482 ntTSL 3 BASIC28.44■■■□□ 2.14
NDC80O14777 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
NDC80O14777 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC28.43■■■□□ 2.14
NDC80O14777 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
NDC80O14777 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
NDC80O14777 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
NDC80O14777 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC28.38■■■□□ 2.13
NDC80O14777 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC28.38■■■□□ 2.13
NDC80O14777 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
NDC80O14777 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC28.35■■■□□ 2.13
NDC80O14777 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC28.35■■■□□ 2.13
NDC80O14777 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC28.34■■■□□ 2.13
NDC80O14777 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC28.34■■■□□ 2.13
NDC80O14777 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC28.33■■■□□ 2.13
NDC80O14777 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC28.32■■■□□ 2.12
NDC80O14777 HAGHL-204ENST00000549114 1820 ntTSL 5 BASIC28.32■■■□□ 2.12
NDC80O14777 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
NDC80O14777 ALYREF-202ENST00000505490 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
NDC80O14777 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
NDC80O14777 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
NDC80O14777 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
NDC80O14777 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
NDC80O14777 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
NDC80O14777 SYNGR1-202ENST00000318801 1361 ntTSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.12
NDC80O14777 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
NDC80O14777 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.25■■■□□ 2.11
NDC80O14777 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
NDC80O14777 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
NDC80O14777 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
NDC80O14777 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC28.21■■■□□ 2.11
NDC80O14777 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
NDC80O14777 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC28.19■■■□□ 2.1
NDC80O14777 AC006077.2-201ENST00000623591 457 ntBASIC28.19■■■□□ 2.1
NDC80O14777 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
NDC80O14777 COPS6-201ENST00000303904 1432 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
NDC80O14777 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
NDC80O14777 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
NDC80O14777 FBXO2-201ENST00000354287 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
NDC80O14777 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.15■■■□□ 2.1
NDC80O14777 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
NDC80O14777 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
NDC80O14777 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
NDC80O14777 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC28.14■■■□□ 2.1
NDC80O14777 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC28.14■■■□□ 2.09
NDC80O14777 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
NDC80O14777 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
NDC80O14777 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC28.11■■■□□ 2.09
NDC80O14777 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
NDC80O14777 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
NDC80O14777 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.1■■■□□ 2.09
NDC80O14777 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
NDC80O14777 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
NDC80O14777 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.09■■■□□ 2.09
NDC80O14777 PLPP2-203ENST00000434325 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
NDC80O14777 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
NDC80O14777 CYBA-201ENST00000261623 797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
NDC80O14777 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC28.04■■■□□ 2.08
NDC80O14777 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC28.04■■■□□ 2.08
NDC80O14777 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
NDC80O14777 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
NDC80O14777 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC28.03■■■□□ 2.08
NDC80O14777 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
NDC80O14777 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC27.99■■■□□ 2.07
NDC80O14777 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
NDC80O14777 LINC01578-201ENST00000553829 732 ntTSL 2 BASIC27.98■■■□□ 2.07
NDC80O14777 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
NDC80O14777 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC27.98■■■□□ 2.07
NDC80O14777 AC079848.1-201ENST00000511301 327 ntTSL 3 BASIC27.97■■■□□ 2.07
NDC80O14777 FGF2-203ENST00000614010 867 ntTSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
NDC80O14777 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
NDC80O14777 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.96■■■□□ 2.07
NDC80O14777 PRELID2-202ENST00000394450 1102 ntTSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
NDC80O14777 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC27.92■■■□□ 2.06
NDC80O14777 NRGN-201ENST00000284292 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
NDC80O14777 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
NDC80O14777 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
NDC80O14777 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
NDC80O14777 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
NDC80O14777 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.89■■■□□ 2.06
NDC80O14777 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.05
NDC80O14777 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC27.89■■■□□ 2.05
NDC80O14777 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
NDC80O14777 ZNRF2P1-201ENST00000441407 443 ntBASIC27.88■■■□□ 2.05
NDC80O14777 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
NDC80O14777 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
NDC80O14777 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
NDC80O14777 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC27.87■■■□□ 2.05
NDC80O14777 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
NDC80O14777 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.7 ms