Protein–RNA interactions for Protein: O09105

Neurod4, Neurogenic differentiation factor 4, mousemouse

Predictions only

Length 330 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Neurod4O09105 Slc25a28-201ENSMUST00000046038 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Neurod4O09105 Mapk14-205ENSMUST00000114758 1581 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Neurod4O09105 Zfp131-205ENSMUST00000223812 663 ntBASIC25.91■■□□□ 1.74
Neurod4O09105 Mipep-204ENSMUST00000225043 1548 ntBASIC25.91■■□□□ 1.74
Neurod4O09105 Pwwp2a-202ENSMUST00000094294 1814 ntTSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
Neurod4O09105 Hoxd8-201ENSMUST00000019749 2634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
Neurod4O09105 St3gal5-201ENSMUST00000069994 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Neurod4O09105 Grk2-210ENSMUST00000171123 1439 ntTSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
Neurod4O09105 Mapk13-201ENSMUST00000004986 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Neurod4O09105 Gm6658-202ENSMUST00000209493 1885 ntBASIC25.79■■□□□ 1.72
Neurod4O09105 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Neurod4O09105 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Neurod4O09105 Tmem59-201ENSMUST00000030361 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Neurod4O09105 Pard6a-205ENSMUST00000212430 1261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Neurod4O09105 Nrg3-202ENSMUST00000168810 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Neurod4O09105 Hnrnpa0-201ENSMUST00000007980 2678 ntAPPRIS P1 BASIC25.76■■□□□ 1.71
Neurod4O09105 Hspd1-201ENSMUST00000027123 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Neurod4O09105 Fcho2-203ENSMUST00000109403 1523 ntTSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
Neurod4O09105 Gltp-203ENSMUST00000112214 944 ntTSL 3 BASIC25.73■■□□□ 1.71
Neurod4O09105 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
Neurod4O09105 Ccm2-201ENSMUST00000000388 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Neurod4O09105 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
Neurod4O09105 Ndufaf6-201ENSMUST00000058183 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
Neurod4O09105 Ildr2-207ENSMUST00000195557 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
Neurod4O09105 AC166822.3-201ENSMUST00000227394 661 ntBASIC25.69■■□□□ 1.7
Neurod4O09105 Gm12184-201ENSMUST00000104959 1310 ntAPPRIS P1 BASIC25.64■■□□□ 1.7
Neurod4O09105 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
Neurod4O09105 Homer3-202ENSMUST00000087467 880 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Neurod4O09105 Chrna5-202ENSMUST00000213960 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Neurod4O09105 Rpl19-ps4-201ENSMUST00000167150 625 ntBASIC25.62■■□□□ 1.69
Neurod4O09105 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Neurod4O09105 Tmeff1-201ENSMUST00000030032 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Neurod4O09105 Rab7-204ENSMUST00000113598 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Neurod4O09105 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Neurod4O09105 1700069B07Rik-202ENSMUST00000191155 939 ntBASIC25.57■■□□□ 1.68
Neurod4O09105 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Neurod4O09105 Cenpv-201ENSMUST00000018653 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Neurod4O09105 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Neurod4O09105 Dapk3-209ENSMUST00000219850 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Neurod4O09105 Zxdb-201ENSMUST00000101388 5619 ntAPPRIS P1 BASIC25.5■■□□□ 1.67
Neurod4O09105 Rnf130-202ENSMUST00000102776 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Neurod4O09105 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Neurod4O09105 Gm42984-201ENSMUST00000195990 987 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Neurod4O09105 Popdc3-202ENSMUST00000161803 1369 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Neurod4O09105 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Neurod4O09105 Rnf130-201ENSMUST00000054684 1415 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Neurod4O09105 Adgrb2-207ENSMUST00000120204 5170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Neurod4O09105 Srp9-202ENSMUST00000111018 823 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Neurod4O09105 Srsf9-201ENSMUST00000031513 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Neurod4O09105 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
Neurod4O09105 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Neurod4O09105 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
Neurod4O09105 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Neurod4O09105 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
Neurod4O09105 Ap1ar-210ENSMUST00000200409 2580 ntTSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
Neurod4O09105 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Neurod4O09105 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Neurod4O09105 Abhd17a-201ENSMUST00000003436 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Neurod4O09105 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Neurod4O09105 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
Neurod4O09105 Tnfsf12-202ENSMUST00000181810 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Neurod4O09105 2210008F06Rik-201ENSMUST00000180805 1082 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Neurod4O09105 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Neurod4O09105 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Neurod4O09105 Ywhaz-204ENSMUST00000110362 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Neurod4O09105 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC25.33■■□□□ 1.65
Neurod4O09105 Crlf1-201ENSMUST00000008032 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Neurod4O09105 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Neurod4O09105 Vstm2l-201ENSMUST00000109523 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
Neurod4O09105 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
Neurod4O09105 Dhrs13-203ENSMUST00000122342 1791 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Neurod4O09105 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
Neurod4O09105 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Neurod4O09105 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Neurod4O09105 Mkrn1-202ENSMUST00000051671 1511 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Neurod4O09105 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Neurod4O09105 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Neurod4O09105 Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 1442 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Neurod4O09105 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Neurod4O09105 Gm16148-201ENSMUST00000119653 893 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
Neurod4O09105 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Neurod4O09105 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Neurod4O09105 Syt7-201ENSMUST00000073899 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Neurod4O09105 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
Neurod4O09105 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Neurod4O09105 Rab22a-202ENSMUST00000109110 849 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
Neurod4O09105 Reps1-206ENSMUST00000154718 2402 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
Neurod4O09105 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC25.17■■□□□ 1.62
Neurod4O09105 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Neurod4O09105 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Neurod4O09105 Btf3-201ENSMUST00000022163 1091 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Neurod4O09105 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC25.14■■□□□ 1.62
Neurod4O09105 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Neurod4O09105 1700028N14Rik-201ENSMUST00000139621 747 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Neurod4O09105 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Neurod4O09105 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Neurod4O09105 Eif2ak3-204ENSMUST00000162950 927 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Neurod4O09105 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Neurod4O09105 Gkap1-201ENSMUST00000091579 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Neurod4O09105 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.2 ms