Protein–RNA interactions for Protein: O08976

Pbsn, Probasin, mousemouse

Predictions only

Length 174 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PbsnO08976 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC26.69■■□□□ 1.86
PbsnO08976 Vstm2l-201ENSMUST00000109523 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.69■■□□□ 1.86
PbsnO08976 Dlx4-201ENSMUST00000021241 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
PbsnO08976 Btf3-201ENSMUST00000022163 1091 ntTSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
PbsnO08976 Mipep-204ENSMUST00000225043 1548 ntBASIC26.65■■□□□ 1.86
PbsnO08976 Mocs3-201ENSMUST00000099071 1973 ntAPPRIS P1 BASIC26.64■■□□□ 1.86
PbsnO08976 Gm42984-201ENSMUST00000195990 987 ntTSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
PbsnO08976 Ctbp1-206ENSMUST00000201575 2091 ntTSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
PbsnO08976 Gm16148-201ENSMUST00000119653 893 ntBASIC26.62■■□□□ 1.85
PbsnO08976 Mkrn1-202ENSMUST00000051671 1511 ntTSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
PbsnO08976 Zfp131-205ENSMUST00000223812 663 ntBASIC26.61■■□□□ 1.85
PbsnO08976 Srsf9-201ENSMUST00000031513 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
PbsnO08976 Chrna5-202ENSMUST00000213960 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
PbsnO08976 Rab22a-202ENSMUST00000109110 849 ntTSL 5 BASIC26.59■■□□□ 1.85
PbsnO08976 Vdac3-202ENSMUST00000179233 1423 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
PbsnO08976 Frs3-201ENSMUST00000113296 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
PbsnO08976 Slc25a28-201ENSMUST00000046038 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
PbsnO08976 Fndc10-201ENSMUST00000099265 2140 ntAPPRIS P1 BASIC26.53■■□□□ 1.84
PbsnO08976 Peli2-204ENSMUST00000226513 1320 ntBASIC26.52■■□□□ 1.84
PbsnO08976 E2f4-201ENSMUST00000015003 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
PbsnO08976 Coq10a-207ENSMUST00000220227 1434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.49■■□□□ 1.83
PbsnO08976 Gm26566-201ENSMUST00000181601 1038 ntAPPRIS P1 BASIC26.49■■□□□ 1.83
PbsnO08976 Brsk2-203ENSMUST00000078200 2363 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
PbsnO08976 Rbfox2-201ENSMUST00000048145 1720 ntTSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
PbsnO08976 Dapk3-209ENSMUST00000219850 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
PbsnO08976 Pard6a-205ENSMUST00000212430 1261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
PbsnO08976 Raly-203ENSMUST00000109701 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
PbsnO08976 Fcho2-203ENSMUST00000109403 1523 ntTSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
PbsnO08976 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
PbsnO08976 Syt7-201ENSMUST00000073899 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
PbsnO08976 Gm42517-201ENSMUST00000197216 1850 ntAPPRIS P1 BASIC26.36■■□□□ 1.81
PbsnO08976 1700069B07Rik-202ENSMUST00000191155 939 ntBASIC26.34■■□□□ 1.81
PbsnO08976 Pwwp2a-202ENSMUST00000094294 1814 ntTSL 5 BASIC26.34■■□□□ 1.81
PbsnO08976 Ppp2r2d-201ENSMUST00000041097 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
PbsnO08976 Rundc3a-201ENSMUST00000006750 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
PbsnO08976 Dennd1b-209ENSMUST00000200533 1853 ntTSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
PbsnO08976 2210008F06Rik-201ENSMUST00000180805 1082 ntTSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
PbsnO08976 Sh3glb2-203ENSMUST00000113620 1694 ntTSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
PbsnO08976 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.31■■□□□ 1.8
PbsnO08976 Eif2ak3-204ENSMUST00000162950 927 ntTSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
PbsnO08976 Gltp-203ENSMUST00000112214 944 ntTSL 3 BASIC26.28■■□□□ 1.8
PbsnO08976 1700028N14Rik-201ENSMUST00000139621 747 ntTSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
PbsnO08976 Mon2-207ENSMUST00000219203 1844 ntTSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
PbsnO08976 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC26.25■■□□□ 1.79
PbsnO08976 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.24■■□□□ 1.79
PbsnO08976 Crlf1-201ENSMUST00000008032 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
PbsnO08976 Kcnmb4os2-201ENSMUST00000080943 1571 ntTSL 5 BASIC26.23■■□□□ 1.79
PbsnO08976 Abhd17a-201ENSMUST00000003436 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
PbsnO08976 Gm2415-204ENSMUST00000190235 2004 ntBASIC26.2■■□□□ 1.78
PbsnO08976 C330011M18Rik-201ENSMUST00000071067 1849 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
PbsnO08976 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
PbsnO08976 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC26.19■■□□□ 1.78
PbsnO08976 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC26.19■■□□□ 1.78
PbsnO08976 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
PbsnO08976 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
PbsnO08976 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC26.15■■□□□ 1.78
PbsnO08976 Hspd1-201ENSMUST00000027123 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
PbsnO08976 Gm26859-201ENSMUST00000181743 1852 ntTSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.78
PbsnO08976 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
PbsnO08976 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
PbsnO08976 Dhrs13-203ENSMUST00000122342 1791 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
PbsnO08976 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
PbsnO08976 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
PbsnO08976 Six3-202ENSMUST00000175898 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
PbsnO08976 Tnfsf12-202ENSMUST00000181810 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
PbsnO08976 1700016A09Rik-201ENSMUST00000192004 835 ntBASIC26.09■■□□□ 1.77
PbsnO08976 Ildr2-207ENSMUST00000195557 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.76
PbsnO08976 Tmem59-201ENSMUST00000030361 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
PbsnO08976 Tmco6-201ENSMUST00000007046 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
PbsnO08976 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC26.04■■□□□ 1.76
PbsnO08976 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
PbsnO08976 Gm10762-201ENSMUST00000099385 1133 ntAPPRIS P1 BASIC26.02■■□□□ 1.76
PbsnO08976 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
PbsnO08976 Ccm2-201ENSMUST00000000388 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
PbsnO08976 Ubl4a-207ENSMUST00000178691 1038 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
PbsnO08976 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
PbsnO08976 Gm6658-202ENSMUST00000209493 1885 ntBASIC25.97■■□□□ 1.75
PbsnO08976 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
PbsnO08976 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
PbsnO08976 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
PbsnO08976 Hoxd8-201ENSMUST00000019749 2634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
PbsnO08976 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
PbsnO08976 Vsig8-202ENSMUST00000177086 1519 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
PbsnO08976 Orai1-201ENSMUST00000051016 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
PbsnO08976 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
PbsnO08976 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
PbsnO08976 Gkap1-201ENSMUST00000091579 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
PbsnO08976 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
PbsnO08976 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
PbsnO08976 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
PbsnO08976 Rpl19-ps4-201ENSMUST00000167150 625 ntBASIC25.84■■□□□ 1.73
PbsnO08976 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC25.84■■□□□ 1.73
PbsnO08976 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
PbsnO08976 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
PbsnO08976 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
PbsnO08976 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
PbsnO08976 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
PbsnO08976 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
PbsnO08976 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
PbsnO08976 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 77.4 ms