Protein–RNA interactions for Protein: F6W043

Vmn2r40, Vomeronasal 2, receptor 40, mousemouse

Predictions only

Length 852 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vmn2r40F6W043 Lactb-202ENSMUST00000215172 1806 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Vmn2r40F6W043 Mbd3-204ENSMUST00000105349 1566 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Vmn2r40F6W043 Mapk14-205ENSMUST00000114758 1581 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Vmn2r40F6W043 Sap30l-201ENSMUST00000020826 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Vmn2r40F6W043 Carnmt1-201ENSMUST00000025632 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Vmn2r40F6W043 AC166822.3-201ENSMUST00000227394 661 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
Vmn2r40F6W043 Raly-203ENSMUST00000109701 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Vmn2r40F6W043 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
Vmn2r40F6W043 Casp9-202ENSMUST00000097805 1498 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Vmn2r40F6W043 C330011M18Rik-201ENSMUST00000071067 1849 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Vmn2r40F6W043 Gm8066-201ENSMUST00000197762 485 ntTSL 3 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Vmn2r40F6W043 Frs3-201ENSMUST00000113296 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Vmn2r40F6W043 Ppp2r2d-201ENSMUST00000041097 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Vmn2r40F6W043 Mon2-207ENSMUST00000219203 1844 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Vmn2r40F6W043 E2f4-201ENSMUST00000015003 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Vmn2r40F6W043 Gm6658-202ENSMUST00000209493 1885 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
Vmn2r40F6W043 Rnf130-201ENSMUST00000054684 1415 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Vmn2r40F6W043 Homer3-202ENSMUST00000087467 880 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Vmn2r40F6W043 Mapk13-201ENSMUST00000004986 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Vmn2r40F6W043 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Vmn2r40F6W043 Rab7-204ENSMUST00000113598 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Vmn2r40F6W043 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Vmn2r40F6W043 Ccm2-201ENSMUST00000000388 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Vmn2r40F6W043 AI837181-202ENSMUST00000159759 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Vmn2r40F6W043 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Vmn2r40F6W043 Ino80b-201ENSMUST00000032109 1038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Vmn2r40F6W043 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Vmn2r40F6W043 Ndufaf6-201ENSMUST00000058183 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Vmn2r40F6W043 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Vmn2r40F6W043 Ube2q2-202ENSMUST00000121677 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Vmn2r40F6W043 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Vmn2r40F6W043 Rbfox2-201ENSMUST00000048145 1720 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Vmn2r40F6W043 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Vmn2r40F6W043 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Vmn2r40F6W043 Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 1442 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Vmn2r40F6W043 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Vmn2r40F6W043 Pwwp2a-202ENSMUST00000094294 1814 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Vmn2r40F6W043 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Vmn2r40F6W043 Chrna5-202ENSMUST00000213960 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Vmn2r40F6W043 Shf-201ENSMUST00000048635 1431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Vmn2r40F6W043 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Vmn2r40F6W043 Slc25a28-201ENSMUST00000046038 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Vmn2r40F6W043 Hspd1-201ENSMUST00000027123 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Vmn2r40F6W043 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Vmn2r40F6W043 Mipep-204ENSMUST00000225043 1548 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
Vmn2r40F6W043 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Vmn2r40F6W043 Tmem59-201ENSMUST00000030361 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Vmn2r40F6W043 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
Vmn2r40F6W043 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Vmn2r40F6W043 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Vmn2r40F6W043 Rnf130-202ENSMUST00000102776 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Vmn2r40F6W043 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Vmn2r40F6W043 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Vmn2r40F6W043 Tlx1-201ENSMUST00000026236 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Vmn2r40F6W043 Srp9-202ENSMUST00000111018 823 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Vmn2r40F6W043 Popdc3-202ENSMUST00000161803 1369 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Vmn2r40F6W043 Ildr2-207ENSMUST00000195557 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Vmn2r40F6W043 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Vmn2r40F6W043 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Vmn2r40F6W043 Vdac3-202ENSMUST00000179233 1423 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Vmn2r40F6W043 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Vmn2r40F6W043 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Vmn2r40F6W043 Fcho2-203ENSMUST00000109403 1523 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Vmn2r40F6W043 Zfp131-205ENSMUST00000223812 663 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
Vmn2r40F6W043 Vstm2l-201ENSMUST00000109523 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Vmn2r40F6W043 Mkrn1-202ENSMUST00000051671 1511 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Vmn2r40F6W043 Cenpv-201ENSMUST00000018653 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Vmn2r40F6W043 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Vmn2r40F6W043 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Vmn2r40F6W043 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Vmn2r40F6W043 Btf3-201ENSMUST00000022163 1091 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Vmn2r40F6W043 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Vmn2r40F6W043 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Vmn2r40F6W043 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Vmn2r40F6W043 Gm16148-201ENSMUST00000119653 893 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
Vmn2r40F6W043 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Vmn2r40F6W043 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
Vmn2r40F6W043 Peli2-204ENSMUST00000226513 1320 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
Vmn2r40F6W043 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Vmn2r40F6W043 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Vmn2r40F6W043 2210008F06Rik-201ENSMUST00000180805 1082 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Vmn2r40F6W043 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Vmn2r40F6W043 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Vmn2r40F6W043 Coq10a-207ENSMUST00000220227 1434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Vmn2r40F6W043 Gltp-203ENSMUST00000112214 944 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Vmn2r40F6W043 Gm26566-201ENSMUST00000181601 1038 ntAPPRIS P1 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Vmn2r40F6W043 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Vmn2r40F6W043 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Vmn2r40F6W043 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Vmn2r40F6W043 Srsf9-201ENSMUST00000031513 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Vmn2r40F6W043 Pard6a-205ENSMUST00000212430 1261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Vmn2r40F6W043 1700069B07Rik-202ENSMUST00000191155 939 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
Vmn2r40F6W043 Gm42984-201ENSMUST00000195990 987 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Vmn2r40F6W043 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Vmn2r40F6W043 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Vmn2r40F6W043 Syt7-201ENSMUST00000073899 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Vmn2r40F6W043 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Vmn2r40F6W043 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Vmn2r40F6W043 Dapk3-209ENSMUST00000219850 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Vmn2r40F6W043 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 86.9 ms