Protein–RNA interactions for Protein: F5H4B4

FAM227A, Protein FAM227A, humanhuman

Predictions only

Length 570 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM227AF5H4B4 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC26.4■■□□□ 1.82
FAM227AF5H4B4 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.39■■□□□ 1.82
FAM227AF5H4B4 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
FAM227AF5H4B4 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
FAM227AF5H4B4 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.34■■□□□ 1.81
FAM227AF5H4B4 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
FAM227AF5H4B4 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC26.33■■□□□ 1.81
FAM227AF5H4B4 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC26.33■■□□□ 1.81
FAM227AF5H4B4 TPRG1L-202ENST00000378344 2414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.33■■□□□ 1.8
FAM227AF5H4B4 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC26.32■■□□□ 1.8
FAM227AF5H4B4 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC26.32■■□□□ 1.8
FAM227AF5H4B4 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC26.31■■□□□ 1.8
FAM227AF5H4B4 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.31■■□□□ 1.8
FAM227AF5H4B4 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
FAM227AF5H4B4 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC26.28■■□□□ 1.8
FAM227AF5H4B4 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC26.27■■□□□ 1.8
FAM227AF5H4B4 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
FAM227AF5H4B4 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC26.26■■□□□ 1.79
FAM227AF5H4B4 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
FAM227AF5H4B4 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC26.25■■□□□ 1.79
FAM227AF5H4B4 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
FAM227AF5H4B4 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC26.24■■□□□ 1.79
FAM227AF5H4B4 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC26.24■■□□□ 1.79
FAM227AF5H4B4 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
FAM227AF5H4B4 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.23■■□□□ 1.79
FAM227AF5H4B4 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
FAM227AF5H4B4 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
FAM227AF5H4B4 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC26.2■■□□□ 1.78
FAM227AF5H4B4 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC26.2■■□□□ 1.78
FAM227AF5H4B4 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
FAM227AF5H4B4 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
FAM227AF5H4B4 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
FAM227AF5H4B4 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
FAM227AF5H4B4 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC26.17■■□□□ 1.78
FAM227AF5H4B4 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
FAM227AF5H4B4 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC26.17■■□□□ 1.78
FAM227AF5H4B4 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
FAM227AF5H4B4 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
FAM227AF5H4B4 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
FAM227AF5H4B4 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
FAM227AF5H4B4 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC26.15■■□□□ 1.78
FAM227AF5H4B4 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
FAM227AF5H4B4 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC26.14■■□□□ 1.78
FAM227AF5H4B4 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
FAM227AF5H4B4 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
FAM227AF5H4B4 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
FAM227AF5H4B4 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
FAM227AF5H4B4 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
FAM227AF5H4B4 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
FAM227AF5H4B4 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
FAM227AF5H4B4 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
FAM227AF5H4B4 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
FAM227AF5H4B4 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
FAM227AF5H4B4 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC26.08■■□□□ 1.77
FAM227AF5H4B4 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.76
FAM227AF5H4B4 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
FAM227AF5H4B4 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC26.07■■□□□ 1.76
FAM227AF5H4B4 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
FAM227AF5H4B4 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC26.05■■□□□ 1.76
FAM227AF5H4B4 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
FAM227AF5H4B4 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
FAM227AF5H4B4 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
FAM227AF5H4B4 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
FAM227AF5H4B4 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
FAM227AF5H4B4 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
FAM227AF5H4B4 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC26.02■■□□□ 1.76
FAM227AF5H4B4 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
FAM227AF5H4B4 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
FAM227AF5H4B4 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
FAM227AF5H4B4 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
FAM227AF5H4B4 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
FAM227AF5H4B4 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC25.98■■□□□ 1.75
FAM227AF5H4B4 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
FAM227AF5H4B4 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
FAM227AF5H4B4 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
FAM227AF5H4B4 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
FAM227AF5H4B4 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.74
FAM227AF5H4B4 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
FAM227AF5H4B4 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
FAM227AF5H4B4 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
FAM227AF5H4B4 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
FAM227AF5H4B4 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
FAM227AF5H4B4 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
FAM227AF5H4B4 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC25.91■■□□□ 1.74
FAM227AF5H4B4 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
FAM227AF5H4B4 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC25.9■■□□□ 1.74
FAM227AF5H4B4 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
FAM227AF5H4B4 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
FAM227AF5H4B4 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.74
FAM227AF5H4B4 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
FAM227AF5H4B4 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC25.88■■□□□ 1.73
FAM227AF5H4B4 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC25.87■■□□□ 1.73
FAM227AF5H4B4 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC25.87■■□□□ 1.73
FAM227AF5H4B4 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
FAM227AF5H4B4 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
FAM227AF5H4B4 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC25.86■■□□□ 1.73
FAM227AF5H4B4 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
FAM227AF5H4B4 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
FAM227AF5H4B4 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
FAM227AF5H4B4 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.1 ms