Protein–RNA interactions for Protein: E9Q8N6

Aknad1, AKNA domain-containing 1, mousemouse

Predictions only

Length 675 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Aknad1E9Q8N6 Ccm2l-201ENSMUST00000109800 2158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.9■■■□□ 2.86
Aknad1E9Q8N6 Gm42517-201ENSMUST00000197216 1850 ntAPPRIS P1 BASIC32.88■■■□□ 2.85
Aknad1E9Q8N6 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC32.88■■■□□ 2.85
Aknad1E9Q8N6 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.87■■■□□ 2.85
Aknad1E9Q8N6 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.87■■■□□ 2.85
Aknad1E9Q8N6 Casp9-202ENSMUST00000097805 1498 ntTSL 1 (best) BASIC32.86■■■□□ 2.85
Aknad1E9Q8N6 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC32.84■■■□□ 2.85
Aknad1E9Q8N6 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC32.84■■■□□ 2.85
Aknad1E9Q8N6 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC32.82■■■□□ 2.84
Aknad1E9Q8N6 1700016A09Rik-201ENSMUST00000192004 835 ntBASIC32.79■■■□□ 2.84
Aknad1E9Q8N6 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.77■■■□□ 2.84
Aknad1E9Q8N6 Shf-201ENSMUST00000048635 1431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.77■■■□□ 2.84
Aknad1E9Q8N6 Kcnmb4os2-201ENSMUST00000080943 1571 ntTSL 5 BASIC32.73■■■□□ 2.83
Aknad1E9Q8N6 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.72■■■□□ 2.83
Aknad1E9Q8N6 Atp1b3-201ENSMUST00000034983 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.71■■■□□ 2.83
Aknad1E9Q8N6 Crlf1-201ENSMUST00000008032 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.71■■■□□ 2.83
Aknad1E9Q8N6 Rnf215-201ENSMUST00000003677 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.7■■■□□ 2.83
Aknad1E9Q8N6 Syt7-201ENSMUST00000073899 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.69■■■□□ 2.82
Aknad1E9Q8N6 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC32.67■■■□□ 2.82
Aknad1E9Q8N6 Foxd3-201ENSMUST00000087285 2324 ntAPPRIS P1 BASIC32.61■■■□□ 2.81
Aknad1E9Q8N6 Cadm4-201ENSMUST00000068023 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.6■■■□□ 2.81
Aknad1E9Q8N6 Dapk3-209ENSMUST00000219850 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.6■■■□□ 2.81
Aknad1E9Q8N6 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC32.59■■■□□ 2.81
Aknad1E9Q8N6 Abhd17a-201ENSMUST00000003436 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.58■■■□□ 2.81
Aknad1E9Q8N6 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.56■■■□□ 2.8
Aknad1E9Q8N6 Sept3-202ENSMUST00000116423 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.56■■■□□ 2.8
Aknad1E9Q8N6 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC32.53■■■□□ 2.8
Aknad1E9Q8N6 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC32.5■■■□□ 2.79
Aknad1E9Q8N6 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.49■■■□□ 2.79
Aknad1E9Q8N6 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.48■■■□□ 2.79
Aknad1E9Q8N6 Fcho2-203ENSMUST00000109403 1523 ntTSL 5 BASIC32.47■■■□□ 2.79
Aknad1E9Q8N6 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC32.46■■■□□ 2.79
Aknad1E9Q8N6 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.45■■■□□ 2.79
Aknad1E9Q8N6 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC32.45■■■□□ 2.78
Aknad1E9Q8N6 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.44■■■□□ 2.78
Aknad1E9Q8N6 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.44■■■□□ 2.78
Aknad1E9Q8N6 Emx1-201ENSMUST00000045942 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.42■■■□□ 2.78
Aknad1E9Q8N6 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC32.42■■■□□ 2.78
Aknad1E9Q8N6 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.41■■■□□ 2.78
Aknad1E9Q8N6 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC32.37■■■□□ 2.77
Aknad1E9Q8N6 Lactb-202ENSMUST00000215172 1806 ntTSL 1 (best) BASIC32.37■■■□□ 2.77
Aknad1E9Q8N6 Dhrs13-203ENSMUST00000122342 1791 ntTSL 1 (best) BASIC32.32■■■□□ 2.76
Aknad1E9Q8N6 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.31■■■□□ 2.76
Aknad1E9Q8N6 Gm26699-201ENSMUST00000180825 2291 ntTSL 5 BASIC32.3■■■□□ 2.76
Aknad1E9Q8N6 Egln2-201ENSMUST00000080058 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.3■■■□□ 2.76
Aknad1E9Q8N6 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.27■■■□□ 2.76
Aknad1E9Q8N6 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC32.26■■■□□ 2.76
Aknad1E9Q8N6 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC32.26■■■□□ 2.75
Aknad1E9Q8N6 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC32.25■■■□□ 2.75
Aknad1E9Q8N6 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC32.25■■■□□ 2.75
Aknad1E9Q8N6 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC32.25■■■□□ 2.75
Aknad1E9Q8N6 Calm3-201ENSMUST00000019514 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.25■■■□□ 2.75
Aknad1E9Q8N6 Gnai2-201ENSMUST00000055704 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.24■■■□□ 2.75
Aknad1E9Q8N6 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC32.24■■■□□ 2.75
Aknad1E9Q8N6 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.23■■■□□ 2.75
Aknad1E9Q8N6 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.23■■■□□ 2.75
Aknad1E9Q8N6 Tnfsf12-202ENSMUST00000181810 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.22■■■□□ 2.75
Aknad1E9Q8N6 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.2■■■□□ 2.75
Aknad1E9Q8N6 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC32.19■■■□□ 2.74
Aknad1E9Q8N6 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.19■■■□□ 2.74
Aknad1E9Q8N6 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.19■■■□□ 2.74
Aknad1E9Q8N6 Orai1-201ENSMUST00000051016 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.18■■■□□ 2.74
Aknad1E9Q8N6 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC32.18■■■□□ 2.74
Aknad1E9Q8N6 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC32.18■■■□□ 2.74
Aknad1E9Q8N6 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC32.18■■■□□ 2.74
Aknad1E9Q8N6 Vsig8-202ENSMUST00000177086 1519 ntTSL 1 (best) BASIC32.16■■■□□ 2.74
Aknad1E9Q8N6 Epcam-201ENSMUST00000053577 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.14■■■□□ 2.74
Aknad1E9Q8N6 Tprgl-201ENSMUST00000030896 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.14■■■□□ 2.74
Aknad1E9Q8N6 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.13■■■□□ 2.73
Aknad1E9Q8N6 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC32.1■■■□□ 2.73
Aknad1E9Q8N6 Ldb1-208ENSMUST00000185355 2088 ntTSL 1 (best) BASIC32.09■■■□□ 2.73
Aknad1E9Q8N6 Ubl4a-207ENSMUST00000178691 1038 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.09■■■□□ 2.73
Aknad1E9Q8N6 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.08■■■□□ 2.73
Aknad1E9Q8N6 Rpia-201ENSMUST00000066134 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.05■■■□□ 2.72
Aknad1E9Q8N6 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.04■■■□□ 2.72
Aknad1E9Q8N6 1810026B05Rik-206ENSMUST00000187421 519 ntTSL 3 BASIC32.04■■■□□ 2.72
Aknad1E9Q8N6 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC32.02■■■□□ 2.72
Aknad1E9Q8N6 Gm24970-201ENSMUST00000175582 82 ntBASIC32■■■□□ 2.71
Aknad1E9Q8N6 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC32■■■□□ 2.71
Aknad1E9Q8N6 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.99■■■□□ 2.71
Aknad1E9Q8N6 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.98■■■□□ 2.71
Aknad1E9Q8N6 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC31.98■■■□□ 2.71
Aknad1E9Q8N6 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC31.97■■■□□ 2.71
Aknad1E9Q8N6 Stard3nl-210ENSMUST00000222869 1030 ntTSL 5 BASIC31.96■■■□□ 2.71
Aknad1E9Q8N6 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC31.96■■■□□ 2.71
Aknad1E9Q8N6 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC31.93■■■□□ 2.7
Aknad1E9Q8N6 Mocs3-201ENSMUST00000099071 1973 ntAPPRIS P1 BASIC31.92■■■□□ 2.7
Aknad1E9Q8N6 Gkap1-201ENSMUST00000091579 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.92■■■□□ 2.7
Aknad1E9Q8N6 Evx2-202ENSMUST00000173623 1428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.91■■■□□ 2.7
Aknad1E9Q8N6 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.91■■■□□ 2.7
Aknad1E9Q8N6 Tmem243-201ENSMUST00000115365 1040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.89■■■□□ 2.7
Aknad1E9Q8N6 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.89■■■□□ 2.7
Aknad1E9Q8N6 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC31.87■■■□□ 2.69
Aknad1E9Q8N6 Cib1-201ENSMUST00000065163 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.87■■■□□ 2.69
Aknad1E9Q8N6 Azin2-201ENSMUST00000030581 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.86■■■□□ 2.69
Aknad1E9Q8N6 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC31.85■■■□□ 2.69
Aknad1E9Q8N6 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.84■■■□□ 2.69
Aknad1E9Q8N6 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC31.83■■■□□ 2.69
Aknad1E9Q8N6 Fndc10-201ENSMUST00000099265 2140 ntAPPRIS P1 BASIC31.82■■■□□ 2.69
Aknad1E9Q8N6 Ldb1-207ENSMUST00000156585 2014 ntTSL 1 (best) BASIC31.81■■■□□ 2.68
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.8 ms