Protein–RNA interactions for Protein: E9Q3L6

4930579F01Rik, RIKEN cDNA 4930579F01 gene, mousemouse

Predictions only

Length 325 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
4930579F01RikE9Q3L6 Mta3-202ENSMUST00000112349 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
4930579F01RikE9Q3L6 Ppp2r2d-201ENSMUST00000041097 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
4930579F01RikE9Q3L6 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
4930579F01RikE9Q3L6 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
4930579F01RikE9Q3L6 Rab21-202ENSMUST00000218831 843 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
4930579F01RikE9Q3L6 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
4930579F01RikE9Q3L6 9230104M06Rik-201ENSMUST00000180971 1963 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
4930579F01RikE9Q3L6 Gm6658-202ENSMUST00000209493 1885 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
4930579F01RikE9Q3L6 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
4930579F01RikE9Q3L6 Jdp2-203ENSMUST00000177587 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
4930579F01RikE9Q3L6 Trabd-203ENSMUST00000165690 1941 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
4930579F01RikE9Q3L6 Ppp2cb-201ENSMUST00000009774 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
4930579F01RikE9Q3L6 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
4930579F01RikE9Q3L6 G6pc3-202ENSMUST00000078975 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
4930579F01RikE9Q3L6 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
4930579F01RikE9Q3L6 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
4930579F01RikE9Q3L6 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
4930579F01RikE9Q3L6 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
4930579F01RikE9Q3L6 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
4930579F01RikE9Q3L6 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
4930579F01RikE9Q3L6 Glrx5-203ENSMUST00000223244 793 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
4930579F01RikE9Q3L6 Nrgn-201ENSMUST00000065668 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
4930579F01RikE9Q3L6 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
4930579F01RikE9Q3L6 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC22.9■■□□□ 1.26
4930579F01RikE9Q3L6 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
4930579F01RikE9Q3L6 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
4930579F01RikE9Q3L6 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
4930579F01RikE9Q3L6 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
4930579F01RikE9Q3L6 Gdf7-201ENSMUST00000037313 1423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
4930579F01RikE9Q3L6 Egln2-201ENSMUST00000080058 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
4930579F01RikE9Q3L6 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
4930579F01RikE9Q3L6 C330011M18Rik-201ENSMUST00000071067 1849 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
4930579F01RikE9Q3L6 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
4930579F01RikE9Q3L6 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
4930579F01RikE9Q3L6 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
4930579F01RikE9Q3L6 Chrna5-202ENSMUST00000213960 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
4930579F01RikE9Q3L6 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
4930579F01RikE9Q3L6 Fam220a-203ENSMUST00000118121 919 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
4930579F01RikE9Q3L6 Atoh7-201ENSMUST00000044059 1629 ntAPPRIS P1 BASIC22.78■■□□□ 1.24
4930579F01RikE9Q3L6 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
4930579F01RikE9Q3L6 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
4930579F01RikE9Q3L6 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
4930579F01RikE9Q3L6 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
4930579F01RikE9Q3L6 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
4930579F01RikE9Q3L6 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
4930579F01RikE9Q3L6 Ccm2-201ENSMUST00000000388 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
4930579F01RikE9Q3L6 Tmed7-201ENSMUST00000036030 1436 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
4930579F01RikE9Q3L6 Mon2-207ENSMUST00000219203 1844 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
4930579F01RikE9Q3L6 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
4930579F01RikE9Q3L6 B430219N15Rik-202ENSMUST00000180853 1105 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
4930579F01RikE9Q3L6 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
4930579F01RikE9Q3L6 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
4930579F01RikE9Q3L6 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
4930579F01RikE9Q3L6 Vps37d-201ENSMUST00000067935 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
4930579F01RikE9Q3L6 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
4930579F01RikE9Q3L6 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
4930579F01RikE9Q3L6 Raly-203ENSMUST00000109701 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
4930579F01RikE9Q3L6 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
4930579F01RikE9Q3L6 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
4930579F01RikE9Q3L6 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
4930579F01RikE9Q3L6 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
4930579F01RikE9Q3L6 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
4930579F01RikE9Q3L6 Gpr137c-202ENSMUST00000147957 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
4930579F01RikE9Q3L6 Fam122a-201ENSMUST00000099556 855 ntAPPRIS P1 BASIC22.61■■□□□ 1.21
4930579F01RikE9Q3L6 BC030336-205ENSMUST00000208454 813 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
4930579F01RikE9Q3L6 Gsx2-202ENSMUST00000160104 1182 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
4930579F01RikE9Q3L6 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
4930579F01RikE9Q3L6 Chmp4b-201ENSMUST00000044277 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
4930579F01RikE9Q3L6 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
4930579F01RikE9Q3L6 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
4930579F01RikE9Q3L6 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
4930579F01RikE9Q3L6 Frs3-201ENSMUST00000113296 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
4930579F01RikE9Q3L6 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
4930579F01RikE9Q3L6 Crebl2-202ENSMUST00000111937 612 ntTSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
4930579F01RikE9Q3L6 Abhd17a-204ENSMUST00000191440 1529 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
4930579F01RikE9Q3L6 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
4930579F01RikE9Q3L6 Tprgl-201ENSMUST00000030896 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
4930579F01RikE9Q3L6 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
4930579F01RikE9Q3L6 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
4930579F01RikE9Q3L6 E2f4-201ENSMUST00000015003 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
4930579F01RikE9Q3L6 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
4930579F01RikE9Q3L6 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
4930579F01RikE9Q3L6 Gm26115-201ENSMUST00000175605 87 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
4930579F01RikE9Q3L6 Kctd9-204ENSMUST00000150768 1302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
4930579F01RikE9Q3L6 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
4930579F01RikE9Q3L6 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
4930579F01RikE9Q3L6 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
4930579F01RikE9Q3L6 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
4930579F01RikE9Q3L6 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
4930579F01RikE9Q3L6 B3gat3-201ENSMUST00000096243 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
4930579F01RikE9Q3L6 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
4930579F01RikE9Q3L6 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
4930579F01RikE9Q3L6 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
4930579F01RikE9Q3L6 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
4930579F01RikE9Q3L6 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
4930579F01RikE9Q3L6 Bcl7c-201ENSMUST00000061468 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
4930579F01RikE9Q3L6 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
4930579F01RikE9Q3L6 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
4930579F01RikE9Q3L6 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
4930579F01RikE9Q3L6 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.2 ms