Protein–RNA interactions for Protein: E9Q2C0

Cfap46, Cilia and flagella-associated protein 46, mousemouse

Predictions only

Length 2,641 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cfap46E9Q2C0 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Cfap46E9Q2C0 Zfyve21-201ENSMUST00000021714 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Cfap46E9Q2C0 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Cfap46E9Q2C0 Zic2-201ENSMUST00000075888 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Cfap46E9Q2C0 Bcl7c-207ENSMUST00000207019 654 ntTSL 3 BASIC25.2■■□□□ 1.63
Cfap46E9Q2C0 Chrna5-202ENSMUST00000213960 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Cfap46E9Q2C0 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Cfap46E9Q2C0 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
Cfap46E9Q2C0 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC25.17■■□□□ 1.62
Cfap46E9Q2C0 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.16■■□□□ 1.62
Cfap46E9Q2C0 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
Cfap46E9Q2C0 Evx2-202ENSMUST00000173623 1428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Cfap46E9Q2C0 Nt5dc2-204ENSMUST00000227096 1848 ntAPPRIS P5 BASIC25.14■■□□□ 1.61
Cfap46E9Q2C0 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Cfap46E9Q2C0 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Cfap46E9Q2C0 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC25.11■■□□□ 1.61
Cfap46E9Q2C0 Gm12523-201ENSMUST00000148844 599 ntTSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
Cfap46E9Q2C0 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Cfap46E9Q2C0 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Cfap46E9Q2C0 Orai1-201ENSMUST00000051016 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Cfap46E9Q2C0 Chmp4b-201ENSMUST00000044277 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Cfap46E9Q2C0 Peli2-204ENSMUST00000226513 1320 ntBASIC25.01■■□□□ 1.59
Cfap46E9Q2C0 Glt8d1-201ENSMUST00000022476 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Cfap46E9Q2C0 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC24.99■■□□□ 1.59
Cfap46E9Q2C0 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Cfap46E9Q2C0 Abhd17a-204ENSMUST00000191440 1529 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
Cfap46E9Q2C0 Jdp2-203ENSMUST00000177587 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Cfap46E9Q2C0 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Cfap46E9Q2C0 G6pc3-202ENSMUST00000078975 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Cfap46E9Q2C0 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Cfap46E9Q2C0 Fkbp8-204ENSMUST00000119698 1799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Cfap46E9Q2C0 Gm8503-201ENSMUST00000118131 455 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
Cfap46E9Q2C0 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
Cfap46E9Q2C0 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Cfap46E9Q2C0 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Cfap46E9Q2C0 4930542C12Rik-201ENSMUST00000171096 1203 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
Cfap46E9Q2C0 Mbd3-204ENSMUST00000105349 1566 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Cfap46E9Q2C0 Btf3-201ENSMUST00000022163 1091 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Cfap46E9Q2C0 Vsig8-201ENSMUST00000061835 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Cfap46E9Q2C0 AL845457.1-201ENSMUST00000197244 68 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
Cfap46E9Q2C0 Rab22a-202ENSMUST00000109110 849 ntTSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
Cfap46E9Q2C0 Carnmt1-201ENSMUST00000025632 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Cfap46E9Q2C0 Samd1-201ENSMUST00000095228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
Cfap46E9Q2C0 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
Cfap46E9Q2C0 Fbxo6-203ENSMUST00000105706 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Cfap46E9Q2C0 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Cfap46E9Q2C0 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Cfap46E9Q2C0 Popdc3-202ENSMUST00000161803 1369 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Cfap46E9Q2C0 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
Cfap46E9Q2C0 Mkrn1-202ENSMUST00000051671 1511 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Cfap46E9Q2C0 Trp53i13-201ENSMUST00000060417 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Cfap46E9Q2C0 Gm9939-201ENSMUST00000067161 1154 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
Cfap46E9Q2C0 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Cfap46E9Q2C0 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
Cfap46E9Q2C0 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Cfap46E9Q2C0 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC24.68■■□□□ 1.54
Cfap46E9Q2C0 Tmem259-201ENSMUST00000052885 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Cfap46E9Q2C0 Sept3-202ENSMUST00000116423 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Cfap46E9Q2C0 Zfp131-207ENSMUST00000224946 1783 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
Cfap46E9Q2C0 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
Cfap46E9Q2C0 Gm24970-201ENSMUST00000175582 82 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
Cfap46E9Q2C0 Ccm2l-201ENSMUST00000109800 2158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
Cfap46E9Q2C0 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Cfap46E9Q2C0 Ube2ql1-201ENSMUST00000065118 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Cfap46E9Q2C0 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
Cfap46E9Q2C0 1810026B05Rik-206ENSMUST00000187421 519 ntTSL 3 BASIC24.55■■□□□ 1.52
Cfap46E9Q2C0 Kcnmb4os2-201ENSMUST00000080943 1571 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Cfap46E9Q2C0 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Cfap46E9Q2C0 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Cfap46E9Q2C0 Snx24-202ENSMUST00000165032 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Cfap46E9Q2C0 Gm42517-201ENSMUST00000197216 1850 ntAPPRIS P1 BASIC24.52■■□□□ 1.52
Cfap46E9Q2C0 Gnai2-202ENSMUST00000192615 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Cfap46E9Q2C0 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Cfap46E9Q2C0 Foxd3-201ENSMUST00000087285 2324 ntAPPRIS P1 BASIC24.48■■□□□ 1.51
Cfap46E9Q2C0 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Cfap46E9Q2C0 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Cfap46E9Q2C0 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
Cfap46E9Q2C0 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Cfap46E9Q2C0 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Cfap46E9Q2C0 Lrrc1-204ENSMUST00000183734 2113 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Cfap46E9Q2C0 Gm12100-201ENSMUST00000150255 1933 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Cfap46E9Q2C0 Nemp1-202ENSMUST00000118612 1522 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Cfap46E9Q2C0 Tmem243-201ENSMUST00000115365 1040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Cfap46E9Q2C0 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Cfap46E9Q2C0 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Cfap46E9Q2C0 9230104M06Rik-201ENSMUST00000180971 1963 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
Cfap46E9Q2C0 Cenpv-201ENSMUST00000018653 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Cfap46E9Q2C0 Stard3nl-210ENSMUST00000222869 1030 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Cfap46E9Q2C0 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
Cfap46E9Q2C0 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Cfap46E9Q2C0 Gm26699-201ENSMUST00000180825 2291 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Cfap46E9Q2C0 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Cfap46E9Q2C0 Syt7-201ENSMUST00000073899 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Cfap46E9Q2C0 A830010M20Rik-202ENSMUST00000094541 1134 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Cfap46E9Q2C0 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Cfap46E9Q2C0 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Cfap46E9Q2C0 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Cfap46E9Q2C0 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Cfap46E9Q2C0 Ube2q2-202ENSMUST00000121677 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Cfap46E9Q2C0 Crlf1-201ENSMUST00000008032 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
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