Protein–RNA interactions for Protein: E9Q1M3

Gm3250, Predicted gene 3250, mousemouse

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Length 230 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm3250E9Q1M3 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Gm3250E9Q1M3 Rab12-205ENSMUST00000167962 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Gm3250E9Q1M3 Wtip-201ENSMUST00000038537 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Gm3250E9Q1M3 Btf3-201ENSMUST00000022163 1091 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Gm3250E9Q1M3 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Gm3250E9Q1M3 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Gm3250E9Q1M3 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Gm3250E9Q1M3 Mkrn1-202ENSMUST00000051671 1511 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Gm3250E9Q1M3 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Gm3250E9Q1M3 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Gm3250E9Q1M3 Bcl7c-207ENSMUST00000207019 654 ntTSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Gm3250E9Q1M3 Cib1-201ENSMUST00000065163 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Gm3250E9Q1M3 Evx2-202ENSMUST00000173623 1428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Gm3250E9Q1M3 Popdc3-202ENSMUST00000161803 1369 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Gm3250E9Q1M3 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Gm3250E9Q1M3 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Gm3250E9Q1M3 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Gm3250E9Q1M3 Gnai2-202ENSMUST00000192615 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Gm3250E9Q1M3 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Gm3250E9Q1M3 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Gm3250E9Q1M3 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Gm3250E9Q1M3 AY074887-201ENSMUST00000054018 769 ntAPPRIS P1 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Gm3250E9Q1M3 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Gm3250E9Q1M3 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
Gm3250E9Q1M3 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Gm3250E9Q1M3 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Gm3250E9Q1M3 Samd1-201ENSMUST00000095228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
Gm3250E9Q1M3 Orai1-201ENSMUST00000051016 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Gm3250E9Q1M3 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
Gm3250E9Q1M3 G6pc3-202ENSMUST00000078975 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Gm3250E9Q1M3 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Gm3250E9Q1M3 Glt8d1-201ENSMUST00000022476 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Gm3250E9Q1M3 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Gm3250E9Q1M3 Gm17110-201ENSMUST00000171248 735 ntTSL 3 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Gm3250E9Q1M3 Kcnmb4os2-201ENSMUST00000080943 1571 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Gm3250E9Q1M3 Gm42517-201ENSMUST00000197216 1850 ntAPPRIS P1 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Gm3250E9Q1M3 Gm12523-201ENSMUST00000148844 599 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Gm3250E9Q1M3 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Gm3250E9Q1M3 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Gm3250E9Q1M3 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Gm3250E9Q1M3 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Gm3250E9Q1M3 Trp53i13-201ENSMUST00000060417 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Gm3250E9Q1M3 Rab22a-202ENSMUST00000109110 849 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Gm3250E9Q1M3 Zfp131-207ENSMUST00000224946 1783 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
Gm3250E9Q1M3 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Gm3250E9Q1M3 Syt7-201ENSMUST00000073899 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Gm3250E9Q1M3 Fbxo6-203ENSMUST00000105706 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Gm3250E9Q1M3 Cenpv-201ENSMUST00000018653 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Gm3250E9Q1M3 1810026B05Rik-206ENSMUST00000187421 519 ntTSL 3 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Gm3250E9Q1M3 Jdp2-203ENSMUST00000177587 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Gm3250E9Q1M3 4930542C12Rik-201ENSMUST00000171096 1203 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
Gm3250E9Q1M3 Gm9939-201ENSMUST00000067161 1154 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
Gm3250E9Q1M3 Crlf1-201ENSMUST00000008032 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Gm3250E9Q1M3 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC21.08■□□□□ 0.97
Gm3250E9Q1M3 Lrrc1-204ENSMUST00000183734 2113 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Gm3250E9Q1M3 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Gm3250E9Q1M3 Zfyve21-201ENSMUST00000021714 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Gm3250E9Q1M3 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Gm3250E9Q1M3 Mipep-204ENSMUST00000225043 1548 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
Gm3250E9Q1M3 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Gm3250E9Q1M3 Ube2q2-202ENSMUST00000121677 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
Gm3250E9Q1M3 Vsig8-201ENSMUST00000061835 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Gm3250E9Q1M3 Stard3nl-210ENSMUST00000222869 1030 ntTSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
Gm3250E9Q1M3 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Gm3250E9Q1M3 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Gm3250E9Q1M3 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Gm3250E9Q1M3 Gm8503-201ENSMUST00000118131 455 ntBASIC20.92■□□□□ 0.94
Gm3250E9Q1M3 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC20.91■□□□□ 0.94
Gm3250E9Q1M3 Snx24-202ENSMUST00000165032 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Gm3250E9Q1M3 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC20.88■□□□□ 0.93
Gm3250E9Q1M3 Gm24970-201ENSMUST00000175582 82 ntBASIC20.87■□□□□ 0.93
Gm3250E9Q1M3 Tmem243-201ENSMUST00000115365 1040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
Gm3250E9Q1M3 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
Gm3250E9Q1M3 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Gm3250E9Q1M3 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Gm3250E9Q1M3 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Gm3250E9Q1M3 Nemp1-202ENSMUST00000118612 1522 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Gm3250E9Q1M3 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Gm3250E9Q1M3 Abhd17a-201ENSMUST00000003436 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Gm3250E9Q1M3 Dapk3-209ENSMUST00000219850 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Gm3250E9Q1M3 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
Gm3250E9Q1M3 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Gm3250E9Q1M3 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Gm3250E9Q1M3 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Gm3250E9Q1M3 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Gm3250E9Q1M3 9230104M06Rik-201ENSMUST00000180971 1963 ntBASIC20.72■□□□□ 0.91
Gm3250E9Q1M3 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Gm3250E9Q1M3 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC20.68■□□□□ 0.9
Gm3250E9Q1M3 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Gm3250E9Q1M3 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Gm3250E9Q1M3 Vsig8-202ENSMUST00000177086 1519 ntTSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Gm3250E9Q1M3 Dhrs13-203ENSMUST00000122342 1791 ntTSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Gm3250E9Q1M3 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.64■□□□□ 0.89
Gm3250E9Q1M3 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.89
Gm3250E9Q1M3 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Gm3250E9Q1M3 Shf-201ENSMUST00000048635 1431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Gm3250E9Q1M3 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
Gm3250E9Q1M3 Lmo2-201ENSMUST00000111139 1434 ntTSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
Gm3250E9Q1M3 Ccm2l-201ENSMUST00000109800 2158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
Gm3250E9Q1M3 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
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