Protein–RNA interactions for Protein: E9Q1M3

Gm3250, Predicted gene 3250, mousemouse

Predictions only

Length 230 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm3250E9Q1M3 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Gm3250E9Q1M3 Rab12-205ENSMUST00000167962 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Gm3250E9Q1M3 Wtip-201ENSMUST00000038537 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Gm3250E9Q1M3 Btf3-201ENSMUST00000022163 1091 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Gm3250E9Q1M3 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Gm3250E9Q1M3 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Gm3250E9Q1M3 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Gm3250E9Q1M3 Mkrn1-202ENSMUST00000051671 1511 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Gm3250E9Q1M3 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Gm3250E9Q1M3 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Gm3250E9Q1M3 Bcl7c-207ENSMUST00000207019 654 ntTSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Gm3250E9Q1M3 Cib1-201ENSMUST00000065163 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Gm3250E9Q1M3 Evx2-202ENSMUST00000173623 1428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Gm3250E9Q1M3 Popdc3-202ENSMUST00000161803 1369 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Gm3250E9Q1M3 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Gm3250E9Q1M3 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Gm3250E9Q1M3 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Gm3250E9Q1M3 Gnai2-202ENSMUST00000192615 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Gm3250E9Q1M3 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Gm3250E9Q1M3 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Gm3250E9Q1M3 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Gm3250E9Q1M3 AY074887-201ENSMUST00000054018 769 ntAPPRIS P1 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Gm3250E9Q1M3 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Gm3250E9Q1M3 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
Gm3250E9Q1M3 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Gm3250E9Q1M3 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Gm3250E9Q1M3 Samd1-201ENSMUST00000095228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
Gm3250E9Q1M3 Orai1-201ENSMUST00000051016 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Gm3250E9Q1M3 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
Gm3250E9Q1M3 G6pc3-202ENSMUST00000078975 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Gm3250E9Q1M3 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Gm3250E9Q1M3 Glt8d1-201ENSMUST00000022476 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Gm3250E9Q1M3 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Gm3250E9Q1M3 Gm17110-201ENSMUST00000171248 735 ntTSL 3 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Gm3250E9Q1M3 Kcnmb4os2-201ENSMUST00000080943 1571 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Gm3250E9Q1M3 Gm42517-201ENSMUST00000197216 1850 ntAPPRIS P1 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Gm3250E9Q1M3 Gm12523-201ENSMUST00000148844 599 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Gm3250E9Q1M3 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Gm3250E9Q1M3 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Gm3250E9Q1M3 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Gm3250E9Q1M3 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Gm3250E9Q1M3 Trp53i13-201ENSMUST00000060417 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Gm3250E9Q1M3 Rab22a-202ENSMUST00000109110 849 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Gm3250E9Q1M3 Zfp131-207ENSMUST00000224946 1783 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
Gm3250E9Q1M3 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Gm3250E9Q1M3 Syt7-201ENSMUST00000073899 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Gm3250E9Q1M3 Fbxo6-203ENSMUST00000105706 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Gm3250E9Q1M3 Cenpv-201ENSMUST00000018653 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Gm3250E9Q1M3 1810026B05Rik-206ENSMUST00000187421 519 ntTSL 3 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Gm3250E9Q1M3 Jdp2-203ENSMUST00000177587 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Gm3250E9Q1M3 4930542C12Rik-201ENSMUST00000171096 1203 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
Gm3250E9Q1M3 Gm9939-201ENSMUST00000067161 1154 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
Gm3250E9Q1M3 Crlf1-201ENSMUST00000008032 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Gm3250E9Q1M3 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC21.08■□□□□ 0.97
Gm3250E9Q1M3 Lrrc1-204ENSMUST00000183734 2113 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Gm3250E9Q1M3 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Gm3250E9Q1M3 Zfyve21-201ENSMUST00000021714 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Gm3250E9Q1M3 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Gm3250E9Q1M3 Mipep-204ENSMUST00000225043 1548 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
Gm3250E9Q1M3 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Gm3250E9Q1M3 Ube2q2-202ENSMUST00000121677 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
Gm3250E9Q1M3 Vsig8-201ENSMUST00000061835 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Gm3250E9Q1M3 Stard3nl-210ENSMUST00000222869 1030 ntTSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
Gm3250E9Q1M3 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Gm3250E9Q1M3 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Gm3250E9Q1M3 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Gm3250E9Q1M3 Gm8503-201ENSMUST00000118131 455 ntBASIC20.92■□□□□ 0.94
Gm3250E9Q1M3 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC20.91■□□□□ 0.94
Gm3250E9Q1M3 Snx24-202ENSMUST00000165032 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Gm3250E9Q1M3 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC20.88■□□□□ 0.93
Gm3250E9Q1M3 Gm24970-201ENSMUST00000175582 82 ntBASIC20.87■□□□□ 0.93
Gm3250E9Q1M3 Tmem243-201ENSMUST00000115365 1040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
Gm3250E9Q1M3 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
Gm3250E9Q1M3 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Gm3250E9Q1M3 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Gm3250E9Q1M3 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Gm3250E9Q1M3 Nemp1-202ENSMUST00000118612 1522 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Gm3250E9Q1M3 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Gm3250E9Q1M3 Abhd17a-201ENSMUST00000003436 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Gm3250E9Q1M3 Dapk3-209ENSMUST00000219850 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Gm3250E9Q1M3 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
Gm3250E9Q1M3 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Gm3250E9Q1M3 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Gm3250E9Q1M3 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Gm3250E9Q1M3 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Gm3250E9Q1M3 9230104M06Rik-201ENSMUST00000180971 1963 ntBASIC20.72■□□□□ 0.91
Gm3250E9Q1M3 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Gm3250E9Q1M3 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC20.68■□□□□ 0.9
Gm3250E9Q1M3 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Gm3250E9Q1M3 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Gm3250E9Q1M3 Vsig8-202ENSMUST00000177086 1519 ntTSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Gm3250E9Q1M3 Dhrs13-203ENSMUST00000122342 1791 ntTSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Gm3250E9Q1M3 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.64■□□□□ 0.89
Gm3250E9Q1M3 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.89
Gm3250E9Q1M3 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Gm3250E9Q1M3 Shf-201ENSMUST00000048635 1431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Gm3250E9Q1M3 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
Gm3250E9Q1M3 Lmo2-201ENSMUST00000111139 1434 ntTSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
Gm3250E9Q1M3 Ccm2l-201ENSMUST00000109800 2158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
Gm3250E9Q1M3 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.8 ms