Protein–RNA interactions for Protein: E9PV87

Talpid3, Protein TALPID3, mousemouse

Predictions only

Length 1,520 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Talpid3E9PV87 Gm5987-201ENSMUST00000196433 1151 ntBASIC39.58■■■■□ 3.93
Talpid3E9PV87 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC39.56■■■■□ 3.92
Talpid3E9PV87 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC39.55■■■■□ 3.92
Talpid3E9PV87 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC39.55■■■■□ 3.92
Talpid3E9PV87 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.54■■■■□ 3.92
Talpid3E9PV87 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC39.52■■■■□ 3.92
Talpid3E9PV87 Mkrn1-202ENSMUST00000051671 1511 ntTSL 1 (best) BASIC39.51■■■■□ 3.92
Talpid3E9PV87 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC39.51■■■■□ 3.92
Talpid3E9PV87 Jdp2-203ENSMUST00000177587 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.51■■■■□ 3.92
Talpid3E9PV87 Fbxo6-203ENSMUST00000105706 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.48■■■■□ 3.91
Talpid3E9PV87 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.46■■■■□ 3.91
Talpid3E9PV87 AC158592.1-201ENSMUST00000215560 1113 ntTSL 5 BASIC39.46■■■■□ 3.91
Talpid3E9PV87 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.45■■■■□ 3.91
Talpid3E9PV87 Cenpv-201ENSMUST00000018653 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.44■■■■□ 3.9
Talpid3E9PV87 Samd1-201ENSMUST00000095228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC39.43■■■■□ 3.9
Talpid3E9PV87 Trp53i13-201ENSMUST00000060417 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC39.42■■■■□ 3.9
Talpid3E9PV87 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC39.4■■■■□ 3.9
Talpid3E9PV87 Gm2018-201ENSMUST00000140754 478 ntTSL 2 BASIC39.39■■■■□ 3.9
Talpid3E9PV87 Carnmt1-201ENSMUST00000025632 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.34■■■■□ 3.89
Talpid3E9PV87 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC39.31■■■■□ 3.88
Talpid3E9PV87 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC39.31■■■■□ 3.88
Talpid3E9PV87 Vsig8-201ENSMUST00000061835 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.3■■■■□ 3.88
Talpid3E9PV87 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC39.3■■■■□ 3.88
Talpid3E9PV87 Cib1-201ENSMUST00000065163 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.27■■■■□ 3.88
Talpid3E9PV87 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.26■■■■□ 3.88
Talpid3E9PV87 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC39.26■■■■□ 3.88
Talpid3E9PV87 Glt8d1-201ENSMUST00000022476 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.26■■■■□ 3.88
Talpid3E9PV87 Gnai2-202ENSMUST00000192615 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.26■■■■□ 3.88
Talpid3E9PV87 Evx2-202ENSMUST00000173623 1428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC39.26■■■■□ 3.88
Talpid3E9PV87 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC39.24■■■■□ 3.87
Talpid3E9PV87 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC39.22■■■■□ 3.87
Talpid3E9PV87 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.22■■■■□ 3.87
Talpid3E9PV87 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC39.21■■■■□ 3.87
Talpid3E9PV87 AY074887-201ENSMUST00000054018 769 ntAPPRIS P1 BASIC39.21■■■■□ 3.87
Talpid3E9PV87 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.21■■■■□ 3.87
Talpid3E9PV87 Zfp131-207ENSMUST00000224946 1783 ntBASIC39.2■■■■□ 3.87
Talpid3E9PV87 Orai1-201ENSMUST00000051016 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.18■■■■□ 3.86
Talpid3E9PV87 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC39.17■■■■□ 3.86
Talpid3E9PV87 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC39.15■■■■□ 3.86
Talpid3E9PV87 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC39.14■■■■□ 3.86
Talpid3E9PV87 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC39.13■■■■□ 3.85
Talpid3E9PV87 Pkdcc-204ENSMUST00000170794 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.1■■■■□ 3.85
Talpid3E9PV87 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.08■■■■□ 3.85
Talpid3E9PV87 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC39.08■■■■□ 3.85
Talpid3E9PV87 Kcnmb4os2-201ENSMUST00000080943 1571 ntTSL 5 BASIC39.06■■■■□ 3.84
Talpid3E9PV87 Nemp1-202ENSMUST00000118612 1522 ntTSL 1 (best) BASIC39.05■■■■□ 3.84
Talpid3E9PV87 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC39.04■■■■□ 3.84
Talpid3E9PV87 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC39.01■■■■□ 3.84
Talpid3E9PV87 Zic2-201ENSMUST00000075888 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.98■■■■□ 3.83
Talpid3E9PV87 Bcl7c-207ENSMUST00000207019 654 ntTSL 3 BASIC38.98■■■■□ 3.83
Talpid3E9PV87 Zfyve21-201ENSMUST00000021714 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC38.94■■■■□ 3.82
Talpid3E9PV87 Gm42517-201ENSMUST00000197216 1850 ntAPPRIS P1 BASIC38.93■■■■□ 3.82
Talpid3E9PV87 Syt7-201ENSMUST00000073899 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.91■■■■□ 3.82
Talpid3E9PV87 Gm24970-201ENSMUST00000175582 82 ntBASIC38.9■■■■□ 3.82
Talpid3E9PV87 Gm12523-201ENSMUST00000148844 599 ntTSL 5 BASIC38.87■■■■□ 3.81
Talpid3E9PV87 Snx24-202ENSMUST00000165032 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.86■■■■□ 3.81
Talpid3E9PV87 Gm8503-201ENSMUST00000118131 455 ntBASIC38.81■■■■□ 3.8
Talpid3E9PV87 1810026B05Rik-206ENSMUST00000187421 519 ntTSL 3 BASIC38.81■■■■□ 3.8
Talpid3E9PV87 Gm17110-201ENSMUST00000171248 735 ntTSL 3 BASIC38.78■■■■□ 3.8
Talpid3E9PV87 Mipep-204ENSMUST00000225043 1548 ntBASIC38.76■■■■□ 3.8
Talpid3E9PV87 Lrrc1-204ENSMUST00000183734 2113 ntTSL 1 (best) BASIC38.75■■■■□ 3.79
Talpid3E9PV87 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC38.74■■■■□ 3.79
Talpid3E9PV87 Crlf1-201ENSMUST00000008032 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.74■■■■□ 3.79
Talpid3E9PV87 Stard3nl-210ENSMUST00000222869 1030 ntTSL 5 BASIC38.73■■■■□ 3.79
Talpid3E9PV87 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC38.72■■■■□ 3.79
Talpid3E9PV87 Shf-201ENSMUST00000048635 1431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC38.68■■■■□ 3.78
Talpid3E9PV87 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC38.66■■■■□ 3.78
Talpid3E9PV87 4930542C12Rik-201ENSMUST00000171096 1203 ntBASIC38.65■■■■□ 3.78
Talpid3E9PV87 Abhd17a-201ENSMUST00000003436 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.64■■■■□ 3.78
Talpid3E9PV87 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.63■■■■□ 3.77
Talpid3E9PV87 Gm9939-201ENSMUST00000067161 1154 ntBASIC38.63■■■■□ 3.77
Talpid3E9PV87 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC38.62■■■■□ 3.77
Talpid3E9PV87 Gm12100-201ENSMUST00000150255 1933 ntTSL 1 (best) BASIC38.6■■■■□ 3.77
Talpid3E9PV87 9230104M06Rik-201ENSMUST00000180971 1963 ntBASIC38.6■■■■□ 3.77
Talpid3E9PV87 Ube2q2-202ENSMUST00000121677 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC38.56■■■■□ 3.76
Talpid3E9PV87 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC38.56■■■■□ 3.76
Talpid3E9PV87 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.56■■■■□ 3.76
Talpid3E9PV87 Casp9-202ENSMUST00000097805 1498 ntTSL 1 (best) BASIC38.55■■■■□ 3.76
Talpid3E9PV87 Tmem243-201ENSMUST00000115365 1040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC38.5■■■■□ 3.75
Talpid3E9PV87 Dapk3-209ENSMUST00000219850 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.5■■■■□ 3.75
Talpid3E9PV87 Tmem259-201ENSMUST00000052885 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.41■■■■□ 3.74
Talpid3E9PV87 Vsig8-202ENSMUST00000177086 1519 ntTSL 1 (best) BASIC38.39■■■■□ 3.74
Talpid3E9PV87 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC38.36■■■■□ 3.73
Talpid3E9PV87 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC38.34■■■■□ 3.73
Talpid3E9PV87 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.34■■■■□ 3.73
Talpid3E9PV87 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.34■■■■□ 3.73
Talpid3E9PV87 Ccm2l-201ENSMUST00000109800 2158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC38.29■■■■□ 3.72
Talpid3E9PV87 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.27■■■■□ 3.72
Talpid3E9PV87 Dhrs13-203ENSMUST00000122342 1791 ntTSL 1 (best) BASIC38.26■■■■□ 3.71
Talpid3E9PV87 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC38.22■■■■□ 3.71
Talpid3E9PV87 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC38.18■■■■□ 3.7
Talpid3E9PV87 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC38.15■■■■□ 3.7
Talpid3E9PV87 Atp1b3-201ENSMUST00000034983 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.15■■■■□ 3.7
Talpid3E9PV87 Ubl4a-207ENSMUST00000178691 1038 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC38.14■■■■□ 3.7
Talpid3E9PV87 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC38.1■■■■□ 3.69
Talpid3E9PV87 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.1■■■■□ 3.69
Talpid3E9PV87 Lmo2-201ENSMUST00000111139 1434 ntTSL 5 BASIC38.08■■■■□ 3.69
Talpid3E9PV87 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.08■■■■□ 3.69
Talpid3E9PV87 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.07■■■■□ 3.69
Talpid3E9PV87 Rnf215-201ENSMUST00000003677 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.07■■■■□ 3.68
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.9 ms