Protein–RNA interactions for Protein: E9PUD6

Zscan18, Zinc finger and SCAN domain-containing 18, mousemouse

Predictions only

Length 809 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zscan18E9PUD6 Fcho2-203ENSMUST00000109403 1523 ntTSL 5 BASIC30.79■■■□□ 2.52
Zscan18E9PUD6 Rab22a-202ENSMUST00000109110 849 ntTSL 5 BASIC30.79■■■□□ 2.52
Zscan18E9PUD6 Btf3-201ENSMUST00000022163 1091 ntTSL 1 (best) BASIC30.79■■■□□ 2.52
Zscan18E9PUD6 Dapk3-209ENSMUST00000219850 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.77■■■□□ 2.52
Zscan18E9PUD6 Orai1-202ENSMUST00000121652 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.77■■■□□ 2.52
Zscan18E9PUD6 Mocs3-201ENSMUST00000099071 1973 ntAPPRIS P1 BASIC30.76■■■□□ 2.51
Zscan18E9PUD6 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC30.75■■■□□ 2.51
Zscan18E9PUD6 Vstm2l-201ENSMUST00000109523 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.74■■■□□ 2.51
Zscan18E9PUD6 Chrna5-202ENSMUST00000213960 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.72■■■□□ 2.51
Zscan18E9PUD6 Gm26566-201ENSMUST00000181601 1038 ntAPPRIS P1 BASIC30.71■■■□□ 2.51
Zscan18E9PUD6 Mapkapk5-201ENSMUST00000031410 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.69■■■□□ 2.5
Zscan18E9PUD6 Crlf1-201ENSMUST00000008032 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.68■■■□□ 2.5
Zscan18E9PUD6 Coq10a-207ENSMUST00000220227 1434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.66■■■□□ 2.5
Zscan18E9PUD6 Syt7-201ENSMUST00000073899 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.65■■■□□ 2.5
Zscan18E9PUD6 Frs3-201ENSMUST00000113296 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.65■■■□□ 2.5
Zscan18E9PUD6 Gm16148-201ENSMUST00000119653 893 ntBASIC30.62■■■□□ 2.49
Zscan18E9PUD6 Abhd17a-201ENSMUST00000003436 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.62■■■□□ 2.49
Zscan18E9PUD6 Gm26588-201ENSMUST00000181064 2098 ntTSL 1 (best) BASIC30.59■■■□□ 2.49
Zscan18E9PUD6 Msantd2-201ENSMUST00000048604 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.59■■■□□ 2.49
Zscan18E9PUD6 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.58■■■□□ 2.49
Zscan18E9PUD6 E2f4-201ENSMUST00000015003 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.58■■■□□ 2.49
Zscan18E9PUD6 Kcnmb4os2-201ENSMUST00000080943 1571 ntTSL 5 BASIC30.56■■■□□ 2.48
Zscan18E9PUD6 Zfp131-205ENSMUST00000223812 663 ntBASIC30.55■■■□□ 2.48
Zscan18E9PUD6 Raly-203ENSMUST00000109701 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.54■■■□□ 2.48
Zscan18E9PUD6 Rbfox2-201ENSMUST00000048145 1720 ntTSL 1 (best) BASIC30.54■■■□□ 2.48
Zscan18E9PUD6 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.54■■■□□ 2.48
Zscan18E9PUD6 Srsf9-201ENSMUST00000031513 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.54■■■□□ 2.48
Zscan18E9PUD6 Ctbp1-206ENSMUST00000201575 2091 ntTSL 1 (best) BASIC30.52■■■□□ 2.48
Zscan18E9PUD6 Sh3glb2-203ENSMUST00000113620 1694 ntTSL 1 (best) BASIC30.52■■■□□ 2.48
Zscan18E9PUD6 Gm42984-201ENSMUST00000195990 987 ntTSL 1 (best) BASIC30.5■■■□□ 2.47
Zscan18E9PUD6 2210008F06Rik-201ENSMUST00000180805 1082 ntTSL 1 (best) BASIC30.49■■■□□ 2.47
Zscan18E9PUD6 Pwwp2a-202ENSMUST00000094294 1814 ntTSL 5 BASIC30.49■■■□□ 2.47
Zscan18E9PUD6 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC30.47■■■□□ 2.47
Zscan18E9PUD6 Dhrs13-203ENSMUST00000122342 1791 ntTSL 1 (best) BASIC30.46■■■□□ 2.47
Zscan18E9PUD6 Tnfsf12-202ENSMUST00000181810 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.45■■■□□ 2.46
Zscan18E9PUD6 Dlx4-201ENSMUST00000021241 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.44■■■□□ 2.46
Zscan18E9PUD6 1700028N14Rik-201ENSMUST00000139621 747 ntTSL 1 (best) BASIC30.44■■■□□ 2.46
Zscan18E9PUD6 Fndc10-201ENSMUST00000099265 2140 ntAPPRIS P1 BASIC30.44■■■□□ 2.46
Zscan18E9PUD6 Pard6a-205ENSMUST00000212430 1261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.41■■■□□ 2.46
Zscan18E9PUD6 Ppp2r2d-201ENSMUST00000041097 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.37■■■□□ 2.45
Zscan18E9PUD6 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.35■■■□□ 2.45
Zscan18E9PUD6 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC30.34■■■□□ 2.45
Zscan18E9PUD6 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC30.33■■■□□ 2.45
Zscan18E9PUD6 Mon2-207ENSMUST00000219203 1844 ntTSL 1 (best) BASIC30.33■■■□□ 2.45
Zscan18E9PUD6 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC30.32■■■□□ 2.44
Zscan18E9PUD6 1700069B07Rik-202ENSMUST00000191155 939 ntBASIC30.3■■■□□ 2.44
Zscan18E9PUD6 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.29■■■□□ 2.44
Zscan18E9PUD6 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC30.28■■■□□ 2.44
Zscan18E9PUD6 Gltp-203ENSMUST00000112214 944 ntTSL 3 BASIC30.28■■■□□ 2.44
Zscan18E9PUD6 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.26■■■□□ 2.43
Zscan18E9PUD6 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.24■■■□□ 2.43
Zscan18E9PUD6 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.23■■■□□ 2.43
Zscan18E9PUD6 C330011M18Rik-201ENSMUST00000071067 1849 ntTSL 1 (best) BASIC30.23■■■□□ 2.43
Zscan18E9PUD6 Eif2ak3-204ENSMUST00000162950 927 ntTSL 1 (best) BASIC30.22■■■□□ 2.43
Zscan18E9PUD6 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC30.19■■■□□ 2.42
Zscan18E9PUD6 Gm10762-201ENSMUST00000099385 1133 ntAPPRIS P1 BASIC30.17■■■□□ 2.42
Zscan18E9PUD6 Gkap1-201ENSMUST00000091579 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.16■■■□□ 2.42
Zscan18E9PUD6 Tmem59-201ENSMUST00000030361 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.15■■■□□ 2.42
Zscan18E9PUD6 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.15■■■□□ 2.42
Zscan18E9PUD6 Ubl4a-207ENSMUST00000178691 1038 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.15■■■□□ 2.42
Zscan18E9PUD6 Vsig8-202ENSMUST00000177086 1519 ntTSL 1 (best) BASIC30.15■■■□□ 2.42
Zscan18E9PUD6 Gm2415-204ENSMUST00000190235 2004 ntBASIC30.14■■■□□ 2.42
Zscan18E9PUD6 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.12■■■□□ 2.41
Zscan18E9PUD6 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC30.12■■■□□ 2.41
Zscan18E9PUD6 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.12■■■□□ 2.41
Zscan18E9PUD6 Ildr2-207ENSMUST00000195557 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.1■■■□□ 2.41
Zscan18E9PUD6 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.1■■■□□ 2.41
Zscan18E9PUD6 Orai1-201ENSMUST00000051016 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.09■■■□□ 2.41
Zscan18E9PUD6 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.08■■■□□ 2.41
Zscan18E9PUD6 Dennd1b-209ENSMUST00000200533 1853 ntTSL 1 (best) BASIC30.08■■■□□ 2.41
Zscan18E9PUD6 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.07■■■□□ 2.4
Zscan18E9PUD6 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.06■■■□□ 2.4
Zscan18E9PUD6 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC30.06■■■□□ 2.4
Zscan18E9PUD6 1700016A09Rik-201ENSMUST00000192004 835 ntBASIC30.05■■■□□ 2.4
Zscan18E9PUD6 Lmo2-201ENSMUST00000111139 1434 ntTSL 5 BASIC30.05■■■□□ 2.4
Zscan18E9PUD6 Tmco6-201ENSMUST00000007046 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.04■■■□□ 2.4
Zscan18E9PUD6 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC30.04■■■□□ 2.4
Zscan18E9PUD6 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC30.04■■■□□ 2.4
Zscan18E9PUD6 Sept11-208ENSMUST00000202308 1792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC30.04■■■□□ 2.4
Zscan18E9PUD6 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.02■■■□□ 2.4
Zscan18E9PUD6 Hspd1-201ENSMUST00000027123 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.02■■■□□ 2.4
Zscan18E9PUD6 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.99■■■□□ 2.39
Zscan18E9PUD6 Brsk2-203ENSMUST00000078200 2363 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.99■■■□□ 2.39
Zscan18E9PUD6 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC29.96■■■□□ 2.39
Zscan18E9PUD6 Hnrnpd-202ENSMUST00000072750 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC29.96■■■□□ 2.39
Zscan18E9PUD6 Rundc3a-201ENSMUST00000006750 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.95■■■□□ 2.39
Zscan18E9PUD6 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
Zscan18E9PUD6 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
Zscan18E9PUD6 Gm6658-202ENSMUST00000209493 1885 ntBASIC29.91■■■□□ 2.38
Zscan18E9PUD6 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.9■■■□□ 2.38
Zscan18E9PUD6 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
Zscan18E9PUD6 Ccm2-201ENSMUST00000000388 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
Zscan18E9PUD6 Tlx1-201ENSMUST00000026236 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
Zscan18E9PUD6 Gm26859-201ENSMUST00000181743 1852 ntTSL 5 BASIC29.85■■■□□ 2.37
Zscan18E9PUD6 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
Zscan18E9PUD6 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
Zscan18E9PUD6 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
Zscan18E9PUD6 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC29.83■■■□□ 2.37
Zscan18E9PUD6 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
Zscan18E9PUD6 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.4 ms