Protein–RNA interactions for Protein: D3Z5T8

4930407I10Rik, RIKEN cDNA 4930407I10 gene, mousemouse

Predictions only

Length 1,512 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
4930407I10RikD3Z5T8 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC39.3■■■■□ 3.88
4930407I10RikD3Z5T8 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC39.3■■■■□ 3.88
4930407I10RikD3Z5T8 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.29■■■■□ 3.88
4930407I10RikD3Z5T8 Popdc3-202ENSMUST00000161803 1369 ntTSL 1 (best) BASIC39.26■■■■□ 3.88
4930407I10RikD3Z5T8 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC39.24■■■■□ 3.87
4930407I10RikD3Z5T8 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC39.23■■■■□ 3.87
4930407I10RikD3Z5T8 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.23■■■■□ 3.87
4930407I10RikD3Z5T8 G6pc3-202ENSMUST00000078975 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.21■■■■□ 3.87
4930407I10RikD3Z5T8 Rab22a-202ENSMUST00000109110 849 ntTSL 5 BASIC39.2■■■■□ 3.87
4930407I10RikD3Z5T8 Mkrn1-202ENSMUST00000051671 1511 ntTSL 1 (best) BASIC39.2■■■■□ 3.87
4930407I10RikD3Z5T8 Evx2-202ENSMUST00000173623 1428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC39.2■■■■□ 3.87
4930407I10RikD3Z5T8 Cib1-201ENSMUST00000065163 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.19■■■■□ 3.86
4930407I10RikD3Z5T8 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC39.16■■■■□ 3.86
4930407I10RikD3Z5T8 Carnmt1-201ENSMUST00000025632 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.15■■■■□ 3.86
4930407I10RikD3Z5T8 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC39.14■■■■□ 3.86
4930407I10RikD3Z5T8 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC39.13■■■■□ 3.85
4930407I10RikD3Z5T8 AY074887-201ENSMUST00000054018 769 ntAPPRIS P1 BASIC39.13■■■■□ 3.85
4930407I10RikD3Z5T8 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.1■■■■□ 3.85
4930407I10RikD3Z5T8 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC39.09■■■■□ 3.85
4930407I10RikD3Z5T8 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC39.09■■■■□ 3.85
4930407I10RikD3Z5T8 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.09■■■■□ 3.85
4930407I10RikD3Z5T8 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.06■■■■□ 3.84
4930407I10RikD3Z5T8 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC39.06■■■■□ 3.84
4930407I10RikD3Z5T8 Cdk9-201ENSMUST00000009699 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.04■■■■□ 3.84
4930407I10RikD3Z5T8 Bcl7c-207ENSMUST00000207019 654 ntTSL 3 BASIC39.03■■■■□ 3.84
4930407I10RikD3Z5T8 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC39.03■■■■□ 3.84
4930407I10RikD3Z5T8 Orai1-201ENSMUST00000051016 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.03■■■■□ 3.84
4930407I10RikD3Z5T8 Rab12-205ENSMUST00000167962 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC38.95■■■■□ 3.83
4930407I10RikD3Z5T8 Cenpv-201ENSMUST00000018653 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.94■■■■□ 3.82
4930407I10RikD3Z5T8 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC38.93■■■■□ 3.82
4930407I10RikD3Z5T8 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC38.9■■■■□ 3.82
4930407I10RikD3Z5T8 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC38.84■■■■□ 3.81
4930407I10RikD3Z5T8 Wtip-201ENSMUST00000038537 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.83■■■■□ 3.81
4930407I10RikD3Z5T8 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.83■■■■□ 3.81
4930407I10RikD3Z5T8 Trp53i13-201ENSMUST00000060417 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC38.83■■■■□ 3.81
4930407I10RikD3Z5T8 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC38.83■■■■□ 3.81
4930407I10RikD3Z5T8 Gm17110-201ENSMUST00000171248 735 ntTSL 3 BASIC38.81■■■■□ 3.8
4930407I10RikD3Z5T8 Zfyve21-201ENSMUST00000021714 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC38.79■■■■□ 3.8
4930407I10RikD3Z5T8 Kcnmb4os2-201ENSMUST00000080943 1571 ntTSL 5 BASIC38.78■■■■□ 3.8
4930407I10RikD3Z5T8 Gnai2-202ENSMUST00000192615 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.78■■■■□ 3.8
4930407I10RikD3Z5T8 Gm12523-201ENSMUST00000148844 599 ntTSL 5 BASIC38.76■■■■□ 3.8
4930407I10RikD3Z5T8 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC38.73■■■■□ 3.79
4930407I10RikD3Z5T8 Rab12-201ENSMUST00000070538 2057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC38.71■■■■□ 3.79
4930407I10RikD3Z5T8 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC38.7■■■■□ 3.79
4930407I10RikD3Z5T8 Zfp131-207ENSMUST00000224946 1783 ntBASIC38.67■■■■□ 3.78
4930407I10RikD3Z5T8 Gm42517-201ENSMUST00000197216 1850 ntAPPRIS P1 BASIC38.66■■■■□ 3.78
4930407I10RikD3Z5T8 Samd1-201ENSMUST00000095228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC38.65■■■■□ 3.78
4930407I10RikD3Z5T8 1810026B05Rik-206ENSMUST00000187421 519 ntTSL 3 BASIC38.64■■■■□ 3.78
4930407I10RikD3Z5T8 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC38.63■■■■□ 3.77
4930407I10RikD3Z5T8 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC38.62■■■■□ 3.77
4930407I10RikD3Z5T8 Syt7-201ENSMUST00000073899 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.61■■■■□ 3.77
4930407I10RikD3Z5T8 4930542C12Rik-201ENSMUST00000171096 1203 ntBASIC38.61■■■■□ 3.77
4930407I10RikD3Z5T8 Gm8503-201ENSMUST00000118131 455 ntBASIC38.59■■■■□ 3.77
4930407I10RikD3Z5T8 Jdp2-203ENSMUST00000177587 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.58■■■■□ 3.77
4930407I10RikD3Z5T8 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC38.55■■■■□ 3.76
4930407I10RikD3Z5T8 Gm24970-201ENSMUST00000175582 82 ntBASIC38.54■■■■□ 3.76
4930407I10RikD3Z5T8 Gm9939-201ENSMUST00000067161 1154 ntBASIC38.53■■■■□ 3.76
4930407I10RikD3Z5T8 Stard3nl-210ENSMUST00000222869 1030 ntTSL 5 BASIC38.48■■■■□ 3.75
4930407I10RikD3Z5T8 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC38.48■■■■□ 3.75
4930407I10RikD3Z5T8 Fbxo6-203ENSMUST00000105706 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.46■■■■□ 3.75
4930407I10RikD3Z5T8 Crlf1-201ENSMUST00000008032 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.45■■■■□ 3.75
4930407I10RikD3Z5T8 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.43■■■■□ 3.74
4930407I10RikD3Z5T8 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC38.39■■■■□ 3.74
4930407I10RikD3Z5T8 Mipep-204ENSMUST00000225043 1548 ntBASIC38.38■■■■□ 3.73
4930407I10RikD3Z5T8 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.38■■■■□ 3.73
4930407I10RikD3Z5T8 Lrrc1-204ENSMUST00000183734 2113 ntTSL 1 (best) BASIC38.26■■■■□ 3.72
4930407I10RikD3Z5T8 Nemp1-202ENSMUST00000118612 1522 ntTSL 1 (best) BASIC38.26■■■■□ 3.71
4930407I10RikD3Z5T8 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.26■■■■□ 3.71
4930407I10RikD3Z5T8 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC38.24■■■■□ 3.71
4930407I10RikD3Z5T8 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.24■■■■□ 3.71
4930407I10RikD3Z5T8 Ube2q2-202ENSMUST00000121677 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC38.23■■■■□ 3.71
4930407I10RikD3Z5T8 Tmem243-201ENSMUST00000115365 1040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC38.22■■■■□ 3.71
4930407I10RikD3Z5T8 Abhd17a-201ENSMUST00000003436 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.21■■■■□ 3.71
4930407I10RikD3Z5T8 Vsig8-201ENSMUST00000061835 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.18■■■■□ 3.7
4930407I10RikD3Z5T8 Glt8d1-201ENSMUST00000022476 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.15■■■■□ 3.7
4930407I10RikD3Z5T8 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC38.14■■■■□ 3.7
4930407I10RikD3Z5T8 Shf-201ENSMUST00000048635 1431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC38.06■■■■□ 3.68
4930407I10RikD3Z5T8 Dapk3-209ENSMUST00000219850 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.05■■■■□ 3.68
4930407I10RikD3Z5T8 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.02■■■■□ 3.68
4930407I10RikD3Z5T8 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC38.02■■■■□ 3.68
4930407I10RikD3Z5T8 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.01■■■■□ 3.68
4930407I10RikD3Z5T8 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC38.01■■■■□ 3.67
4930407I10RikD3Z5T8 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.01■■■■□ 3.67
4930407I10RikD3Z5T8 Vsig8-202ENSMUST00000177086 1519 ntTSL 1 (best) BASIC37.97■■■■□ 3.67
4930407I10RikD3Z5T8 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC37.9■■■■□ 3.66
4930407I10RikD3Z5T8 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.87■■■■□ 3.65
4930407I10RikD3Z5T8 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC37.87■■■■□ 3.65
4930407I10RikD3Z5T8 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC37.86■■■■□ 3.65
4930407I10RikD3Z5T8 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC37.86■■■■□ 3.65
4930407I10RikD3Z5T8 Dhrs13-203ENSMUST00000122342 1791 ntTSL 1 (best) BASIC37.85■■■■□ 3.65
4930407I10RikD3Z5T8 Snx24-202ENSMUST00000165032 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.85■■■■□ 3.65
4930407I10RikD3Z5T8 Casp9-202ENSMUST00000097805 1498 ntTSL 1 (best) BASIC37.85■■■■□ 3.65
4930407I10RikD3Z5T8 Lmo2-201ENSMUST00000111139 1434 ntTSL 5 BASIC37.82■■■■□ 3.65
4930407I10RikD3Z5T8 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC37.8■■■■□ 3.64
4930407I10RikD3Z5T8 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.78■■■■□ 3.64
4930407I10RikD3Z5T8 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC37.76■■■■□ 3.63
4930407I10RikD3Z5T8 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC37.74■■■■□ 3.63
4930407I10RikD3Z5T8 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.74■■■■□ 3.63
4930407I10RikD3Z5T8 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC37.74■■■■□ 3.63
4930407I10RikD3Z5T8 9230104M06Rik-201ENSMUST00000180971 1963 ntBASIC37.73■■■■□ 3.63
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.6 ms