Protein–RNA interactions for Protein: B1AYN9

Tex28, Testis-expressed 28, mousemouse

Predictions only

Length 409 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tex28B1AYN9 Casp9-202ENSMUST00000097805 1498 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Tex28B1AYN9 Gm42517-201ENSMUST00000197216 1850 ntAPPRIS P1 BASIC23.72■■□□□ 1.39
Tex28B1AYN9 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Tex28B1AYN9 Lrrc1-204ENSMUST00000183734 2113 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Tex28B1AYN9 Tmco6-201ENSMUST00000007046 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Tex28B1AYN9 Crebl2-202ENSMUST00000111937 612 ntTSL 3 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Tex28B1AYN9 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
Tex28B1AYN9 Gm25262-201ENSMUST00000174934 133 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
Tex28B1AYN9 B3gat3-201ENSMUST00000096243 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Tex28B1AYN9 Gsx2-202ENSMUST00000160104 1182 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Tex28B1AYN9 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Tex28B1AYN9 Lactb-202ENSMUST00000215172 1806 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Tex28B1AYN9 Raly-203ENSMUST00000109701 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Tex28B1AYN9 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
Tex28B1AYN9 Ino80b-201ENSMUST00000032109 1038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Tex28B1AYN9 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Tex28B1AYN9 Carnmt1-201ENSMUST00000025632 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Tex28B1AYN9 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Tex28B1AYN9 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Tex28B1AYN9 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Tex28B1AYN9 Frs3-201ENSMUST00000113296 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Tex28B1AYN9 E2f4-201ENSMUST00000015003 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Tex28B1AYN9 C330011M18Rik-201ENSMUST00000071067 1849 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Tex28B1AYN9 Mafa-201ENSMUST00000062002 1080 ntAPPRIS P1 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Tex28B1AYN9 Mon2-207ENSMUST00000219203 1844 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Tex28B1AYN9 Gm2415-204ENSMUST00000190235 2004 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
Tex28B1AYN9 Ppp2r2d-201ENSMUST00000041097 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Tex28B1AYN9 Shf-201ENSMUST00000048635 1431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Tex28B1AYN9 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Tex28B1AYN9 AL845457.1-201ENSMUST00000197244 68 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
Tex28B1AYN9 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Tex28B1AYN9 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Tex28B1AYN9 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Tex28B1AYN9 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Tex28B1AYN9 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Tex28B1AYN9 Mbd3-204ENSMUST00000105349 1566 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Tex28B1AYN9 Slc25a28-201ENSMUST00000046038 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Tex28B1AYN9 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Tex28B1AYN9 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Tex28B1AYN9 Gm6658-202ENSMUST00000209493 1885 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
Tex28B1AYN9 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Tex28B1AYN9 Rbfox2-201ENSMUST00000048145 1720 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Tex28B1AYN9 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Tex28B1AYN9 Mipep-204ENSMUST00000225043 1548 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
Tex28B1AYN9 Svbp-202ENSMUST00000097908 832 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Tex28B1AYN9 Pwwp2a-202ENSMUST00000094294 1814 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Tex28B1AYN9 Ubtd2-201ENSMUST00000051053 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Tex28B1AYN9 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Tex28B1AYN9 Tmem59-201ENSMUST00000030361 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Tex28B1AYN9 Ube2q2-202ENSMUST00000121677 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Tex28B1AYN9 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Tex28B1AYN9 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Tex28B1AYN9 Mbd2-202ENSMUST00000114946 1290 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Tex28B1AYN9 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Tex28B1AYN9 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Tex28B1AYN9 Grk2-210ENSMUST00000171123 1439 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Tex28B1AYN9 Ilk-201ENSMUST00000033182 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Tex28B1AYN9 Ccm2-201ENSMUST00000000388 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Tex28B1AYN9 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Tex28B1AYN9 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Tex28B1AYN9 B430219N15Rik-202ENSMUST00000180853 1105 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
Tex28B1AYN9 Rab7-204ENSMUST00000113598 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Tex28B1AYN9 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Tex28B1AYN9 Nkx1-1-201ENSMUST00000173348 1209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Tex28B1AYN9 Chrna5-202ENSMUST00000213960 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Tex28B1AYN9 Mapk14-205ENSMUST00000114758 1581 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Tex28B1AYN9 Fcho2-203ENSMUST00000109403 1523 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Tex28B1AYN9 Gm27322-201ENSMUST00000184007 104 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
Tex28B1AYN9 Ildr2-207ENSMUST00000195557 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Tex28B1AYN9 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Tex28B1AYN9 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Tex28B1AYN9 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Tex28B1AYN9 Clec2l-201ENSMUST00000114874 1428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Tex28B1AYN9 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Tex28B1AYN9 BC030336-205ENSMUST00000208454 813 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Tex28B1AYN9 Gm17082-201ENSMUST00000166043 1091 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
Tex28B1AYN9 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Tex28B1AYN9 AC166822.3-201ENSMUST00000227394 661 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
Tex28B1AYN9 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Tex28B1AYN9 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Tex28B1AYN9 Bcl7c-201ENSMUST00000061468 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Tex28B1AYN9 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Tex28B1AYN9 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Tex28B1AYN9 Dapk3-209ENSMUST00000219850 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Tex28B1AYN9 Cenpv-201ENSMUST00000018653 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Tex28B1AYN9 Gm8066-201ENSMUST00000197762 485 ntTSL 3 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Tex28B1AYN9 Mapk3-201ENSMUST00000050201 1267 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Tex28B1AYN9 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Tex28B1AYN9 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Tex28B1AYN9 Kctd9-204ENSMUST00000150768 1302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Tex28B1AYN9 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Tex28B1AYN9 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Tex28B1AYN9 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
Tex28B1AYN9 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Tex28B1AYN9 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Tex28B1AYN9 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Tex28B1AYN9 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
Tex28B1AYN9 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Tex28B1AYN9 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Tex28B1AYN9 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.3 ms