Protein–RNA interactions for Protein: B1ASB6

Spocd1, SPOC domain-containing 1, mousemouse

Predictions only

Length 936 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Spocd1B1ASB6 Raly-203ENSMUST00000109701 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
Spocd1B1ASB6 Ndufaf6-201ENSMUST00000058183 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
Spocd1B1ASB6 Rbfox2-201ENSMUST00000048145 1720 ntTSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
Spocd1B1ASB6 Shf-201ENSMUST00000048635 1431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
Spocd1B1ASB6 Ppp2r2d-201ENSMUST00000041097 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
Spocd1B1ASB6 Slc25a28-201ENSMUST00000046038 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
Spocd1B1ASB6 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
Spocd1B1ASB6 Mon2-207ENSMUST00000219203 1844 ntTSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
Spocd1B1ASB6 Gm26859-201ENSMUST00000181743 1852 ntTSL 5 BASIC29.13■■■□□ 2.25
Spocd1B1ASB6 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
Spocd1B1ASB6 Pwwp2a-202ENSMUST00000094294 1814 ntTSL 5 BASIC29.1■■■□□ 2.25
Spocd1B1ASB6 Zfp131-205ENSMUST00000223812 663 ntBASIC29.09■■■□□ 2.25
Spocd1B1ASB6 Adgrb2-207ENSMUST00000120204 5170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
Spocd1B1ASB6 Gm42517-201ENSMUST00000197216 1850 ntAPPRIS P1 BASIC29.05■■■□□ 2.24
Spocd1B1ASB6 Fcho2-203ENSMUST00000109403 1523 ntTSL 5 BASIC29.04■■■□□ 2.24
Spocd1B1ASB6 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.03■■■□□ 2.24
Spocd1B1ASB6 Gm2415-204ENSMUST00000190235 2004 ntBASIC29.03■■■□□ 2.24
Spocd1B1ASB6 C330011M18Rik-201ENSMUST00000071067 1849 ntTSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
Spocd1B1ASB6 Hoxd8-201ENSMUST00000019749 2634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
Spocd1B1ASB6 Pard6a-205ENSMUST00000212430 1261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
Spocd1B1ASB6 Rnf130-202ENSMUST00000102776 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
Spocd1B1ASB6 Hspd1-201ENSMUST00000027123 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
Spocd1B1ASB6 Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 1442 ntTSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
Spocd1B1ASB6 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.96■■■□□ 2.23
Spocd1B1ASB6 Srp9-202ENSMUST00000111018 823 ntTSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
Spocd1B1ASB6 Popdc3-202ENSMUST00000161803 1369 ntTSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
Spocd1B1ASB6 Gltp-203ENSMUST00000112214 944 ntTSL 3 BASIC28.89■■■□□ 2.22
Spocd1B1ASB6 Cenpv-201ENSMUST00000018653 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
Spocd1B1ASB6 Tmco6-201ENSMUST00000007046 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
Spocd1B1ASB6 Dapk3-209ENSMUST00000219850 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
Spocd1B1ASB6 Tmem59-201ENSMUST00000030361 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
Spocd1B1ASB6 Ildr2-207ENSMUST00000195557 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
Spocd1B1ASB6 Vdac3-202ENSMUST00000179233 1423 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
Spocd1B1ASB6 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
Spocd1B1ASB6 Gm6658-202ENSMUST00000209493 1885 ntBASIC28.82■■■□□ 2.2
Spocd1B1ASB6 2210008F06Rik-201ENSMUST00000180805 1082 ntTSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
Spocd1B1ASB6 Ccm2-201ENSMUST00000000388 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.2
Spocd1B1ASB6 Crlf1-201ENSMUST00000008032 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
Spocd1B1ASB6 Mkrn1-202ENSMUST00000051671 1511 ntTSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
Spocd1B1ASB6 1700069B07Rik-202ENSMUST00000191155 939 ntBASIC28.74■■■□□ 2.19
Spocd1B1ASB6 Srsf9-201ENSMUST00000031513 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
Spocd1B1ASB6 St3gal5-201ENSMUST00000069994 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
Spocd1B1ASB6 Vstm2l-201ENSMUST00000109523 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.74■■■□□ 2.19
Spocd1B1ASB6 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
Spocd1B1ASB6 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
Spocd1B1ASB6 Gm42984-201ENSMUST00000195990 987 ntTSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
Spocd1B1ASB6 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
Spocd1B1ASB6 Abhd17a-201ENSMUST00000003436 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
Spocd1B1ASB6 1700028N14Rik-201ENSMUST00000139621 747 ntTSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
Spocd1B1ASB6 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC28.65■■■□□ 2.18
Spocd1B1ASB6 Syt7-201ENSMUST00000073899 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
Spocd1B1ASB6 Chrna5-202ENSMUST00000213960 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
Spocd1B1ASB6 Coq10a-207ENSMUST00000220227 1434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.64■■■□□ 2.18
Spocd1B1ASB6 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.63■■■□□ 2.17
Spocd1B1ASB6 Tnfsf12-202ENSMUST00000181810 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
Spocd1B1ASB6 Gm16148-201ENSMUST00000119653 893 ntBASIC28.6■■■□□ 2.17
Spocd1B1ASB6 Btf3-201ENSMUST00000022163 1091 ntTSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
Spocd1B1ASB6 Tmeff1-201ENSMUST00000030032 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
Spocd1B1ASB6 Rpl19-ps4-201ENSMUST00000167150 625 ntBASIC28.59■■■□□ 2.17
Spocd1B1ASB6 Dhrs13-203ENSMUST00000122342 1791 ntTSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
Spocd1B1ASB6 Hnrnpa0-201ENSMUST00000007980 2678 ntAPPRIS P1 BASIC28.58■■■□□ 2.17
Spocd1B1ASB6 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
Spocd1B1ASB6 Peli2-204ENSMUST00000226513 1320 ntBASIC28.58■■■□□ 2.17
Spocd1B1ASB6 Rab7-204ENSMUST00000113598 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
Spocd1B1ASB6 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
Spocd1B1ASB6 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
Spocd1B1ASB6 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.54■■■□□ 2.16
Spocd1B1ASB6 Sh3glb2-203ENSMUST00000113620 1694 ntTSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
Spocd1B1ASB6 Nrg3-202ENSMUST00000168810 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
Spocd1B1ASB6 Rab22a-202ENSMUST00000109110 849 ntTSL 5 BASIC28.53■■■□□ 2.16
Spocd1B1ASB6 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
Spocd1B1ASB6 Kcnmb4os2-201ENSMUST00000080943 1571 ntTSL 5 BASIC28.53■■■□□ 2.16
Spocd1B1ASB6 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
Spocd1B1ASB6 Gm26566-201ENSMUST00000181601 1038 ntAPPRIS P1 BASIC28.5■■■□□ 2.15
Spocd1B1ASB6 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
Spocd1B1ASB6 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC28.5■■■□□ 2.15
Spocd1B1ASB6 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
Spocd1B1ASB6 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
Spocd1B1ASB6 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.45■■■□□ 2.14
Spocd1B1ASB6 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
Spocd1B1ASB6 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
Spocd1B1ASB6 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC28.4■■■□□ 2.14
Spocd1B1ASB6 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
Spocd1B1ASB6 Gm10762-201ENSMUST00000099385 1133 ntAPPRIS P1 BASIC28.39■■■□□ 2.14
Spocd1B1ASB6 Eif2ak3-204ENSMUST00000162950 927 ntTSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
Spocd1B1ASB6 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
Spocd1B1ASB6 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
Spocd1B1ASB6 Ap1ar-210ENSMUST00000200409 2580 ntTSL 5 BASIC28.35■■■□□ 2.13
Spocd1B1ASB6 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
Spocd1B1ASB6 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
Spocd1B1ASB6 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
Spocd1B1ASB6 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
Spocd1B1ASB6 Gkap1-201ENSMUST00000091579 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
Spocd1B1ASB6 Lmo2-201ENSMUST00000111139 1434 ntTSL 5 BASIC28.29■■■□□ 2.12
Spocd1B1ASB6 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC28.29■■■□□ 2.12
Spocd1B1ASB6 Tlx1-201ENSMUST00000026236 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
Spocd1B1ASB6 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
Spocd1B1ASB6 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC28.28■■■□□ 2.12
Spocd1B1ASB6 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
Spocd1B1ASB6 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.8 ms